基于癌基因组突变谱解析癌相关通路的功能协同机制
| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-17页 |
| ·国内外研究进展 | 第10-14页 |
| ·癌基因组高通量突变扫查 | 第10-12页 |
| ·生物通路数据库与通路定义问题 | 第12-13页 |
| ·癌相关通路的协同作用 | 第13-14页 |
| ·识别癌基因 | 第14页 |
| ·论文研究的目的和意义 | 第14-15页 |
| ·论文的主要研究内容 | 第15-17页 |
| 第2章 基于体细胞突变谱分析共突变基因 | 第17-30页 |
| ·目的和意义 | 第17-18页 |
| ·材料和方法 | 第18-21页 |
| ·癌基因组突变谱 | 第18-19页 |
| ·通路和蛋白质互作网络 | 第19页 |
| ·通路内模型和通路间模型 | 第19-20页 |
| ·识别功能基模(motif)间和基模内模型 | 第20-21页 |
| ·识别通路间枢纽基因 | 第21页 |
| ·结果 | 第21-27页 |
| ·共突变基因对的功能关系 | 第21-24页 |
| ·通路间枢纽基因 | 第24-25页 |
| ·通路间模型举例 | 第25-27页 |
| ·本章小结 | 第27-30页 |
| 第3章 基于通路突变谱分析癌相关超通路的功能协同 | 第30-42页 |
| ·目的和意义 | 第30-31页 |
| ·数据和方法 | 第31-33页 |
| ·癌基因组的基因突变谱、拷贝数谱和癌相关通路 | 第31页 |
| ·癌基因组的通路突变谱及共突变通路对的打分 | 第31-32页 |
| ·多功能基因参与功能协同机制 | 第32页 |
| ·共突变通路网络及超通路构造 | 第32-33页 |
| ·DNA 拷贝数改变扰动超通路 | 第33页 |
| ·识别癌基因 | 第33页 |
| ·结果 | 第33-40页 |
| ·癌通路间的共突变关系 | 第33-36页 |
| ·多功能基因影响通路间协同关系 | 第36-37页 |
| ·共突变超通路 | 第37-38页 |
| ·DNA 拷贝数改变扰动超通路 | 第38-39页 |
| ·识别癌基因 | 第39-40页 |
| ·本章小结 | 第40-42页 |
| 第4章 基于蛋白质互作网络识别共突变功能模块 | 第42-53页 |
| ·目的和意义 | 第42-43页 |
| ·数据和方法 | 第43-46页 |
| ·突变谱、蛋白质互作与功能通路数据 | 第43-44页 |
| ·共突变功能模块对的打分与搜索 | 第44-46页 |
| ·按功能通路组装功能模块 | 第46页 |
| ·结果 | 第46-51页 |
| ·识别共突变模块对与通路间模型 | 第46-48页 |
| ·通路内模型的案例分析 | 第48-50页 |
| ·共突变通路网络 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附录 | 第62-84页 |
| 攻读博士学位期间发表论文 | 第84-86页 |
| 攻读博士学位期间参加课题工作 | 第86-87页 |
| 个人简历 | 第87页 |
