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花生种子全长cDNA文库的大规模测序和生物信息学分析

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
第一章:文献综述第11-33页
 1.花生遗传育种研究进展第11-17页
   ·花生常规育种方法及进展第11-13页
     ·花生常规育种成就和存在问题第13-15页
   ·基因工程在育种方面的研究第15-17页
 2.植物基因组研究进展第17-20页
   ·模式植物全基因组测序研究进展第17-18页
   ·表达序列标签(ESTs)研究进展第18-19页
   ·表达序列标签(ESTs)及其应用概况第19-20页
 3.植物全长基因文库构建和利用。第20-23页
   ·植物基因文库构建的目的意义和方法。第20-21页
   ·几种全长cDNA文库构建方法第21-22页
   ·构建全长文库的用途第22-23页
 4.花生功能基因组学研究进展和存在问题第23-31页
   ·EST测序与分子标记开发研究第23-26页
   ·花生重要基因的研究进展第26-31页
 5.本研究的目的和意义第31-33页
第二章:花生种子全长文库大规模EST测序和EST注释第33-46页
 1.前言第33页
 2.材料与方法第33-36页
   ·材料与主要仪器设备第33-34页
   ·部分文库铺平板第34页
   ·随机挑选2000个克隆转换克隆的形式第34页
   ·测序第34-36页
 3.结果与分析第36-44页
   ·质粒的提取第36-37页
   ·5'EST测序结果第37页
     ·EST注释第37-38页
   ·双向测序及全长获得第38-44页
 4.讨论第44-46页
   ·关于如何获得更多的全长基因比例第44-45页
   ·减少384weli plate在操作过程中的污染问题第45页
   ·如何提高一次测序的质量第45-46页
第三章 EST序列的生物信息学分析第46-61页
 1.前言第46页
 2.材料与方法第46-47页
   ·材料与主要仪器设备第46页
   ·分析测序基因的重复性第46页
   ·2000多个基因的SSR发拓第46页
   ·基因功能分类第46页
   ·全长重要基因获得第46-47页
 3.结果与分析第47-58页
   ·花生种子表达基因的丰度分析第47-50页
   ·所得到表达基因EST的SSR开发第50-51页
   ·基因功能分类第51-54页
   ·功能基因参与的代谢途径第54-55页
   ·全长基因获得第55-58页
 4.讨论第58-61页
   ·花生EST测序促进花生基因的发现和鉴定的研究第58页
   ·花生脂肪代谢发拓与脂肪品质改良的关系第58-60页
   ·花生贮藏蛋白的研究有利于改良花生蛋白营养及解决过敏性问题第60-61页
第四章 两个重要基因的结构和功能生物信息学预测第61-84页
 1.前言第61页
 2.材料与方法第61-64页
   ·材料与主要仪器设备第61页
   ·两个重要基因的生物信息学分析第61-64页
 3.结果与分析第64-81页
 4.讨论第81-84页
参考文献:第84-89页
附件1.全长文库构建质粒图第89-90页
附录2-1.己登录的基因及序列号第90-98页
附录2-2.已登录的基因及序列号第98-100页
附件3.英文缩写第100-101页
附录四:基因序列第101-102页
附录五:SSR检索部分结果第102-103页
附录六:LEA蛋白的分类第103-104页
致谢第104页

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