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苏云金芽胞杆菌S-层蛋白形成内涵体的研究

目录第1-8页
中文摘要第8-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略语第10-11页
1.文献综述第11-36页
   ·细菌S-层及其一般性质第12-15页
   ·细菌S-层的多样性第15-21页
     ·S-层结构的多样性第15-18页
       ·S-层在不同细菌种属中存在的多样性第15页
       ·不同的S-层致使表达形成不同的菌落形态第15页
       ·S-层结构装配的多样性第15-17页
       ·组成S-层晶格的结构多样性第17页
       ·S-层结构装配的牢固性存在多样性第17-18页
     ·S-层蛋白的多样性第18-20页
       ·S-层蛋白的大小呈现多样性第18页
       ·组成S-层的基本蛋白单元的多样性第18页
       ·形成S-层晶体的蛋白质结构单元同源性的多样性第18页
       ·S-层蛋白结构域的多样性第18-19页
       ·S-层蛋白转译后修饰的多样性第19页
       ·S-层蛋白作为抗原的多态性第19-20页
     ·S-层蛋白基因的多样性第20-21页
       ·编码S-层蛋白的基因多样性第20页
       ·S-层基因的结构多样性第20页
       ·S-层基因的启动子结构的多样性第20-21页
     ·细菌S-层的功能多样性第21页
   ·细菌S-层的应用第21-28页
     ·细菌S-层的应用概述第21-23页
     ·细菌S-层的应用基础第23-26页
       ·S-层蛋白的自装配第23页
       ·S-层蛋白与次细胞壁多聚体(SCWP)的相互作用第23-26页
     ·细菌S-层的应用实例第26-28页
       ·S-层融合蛋白和其应用第26-28页
       ·S-层蛋白在微米和纳米材料上的应用第28页
   ·蜡状芽胞杆菌群的S-层第28-32页
     ·蜡状芽胞杆菌群简介第28-31页
     ·蜡状芽胞杆菌群的S-层第31-32页
   ·细菌S-层研究方法综述第32-34页
     ·细菌S-层观测研究方法第32-33页
     ·细菌S-层基因在外源宿主中的表达第33页
     ·细菌S-层蛋白结构与功能的研究第33-34页
   ·本文的研究背景及研究意义第34-36页
     ·苏云金芽胞杆菌CTC菌株产生的伴胞晶体及其产生的条件第34页
     ·苏云金芽胞杆菌CTC菌株的S-层蛋白可以形成伴胞晶体第34页
     ·苏云金芽胞杆菌CTC菌株细胞表面的S-层结构第34-35页
     ·苏云金芽胞杆菌中S-层基因的普查第35页
     ·苏云金芽胞杆菌CTC菌株的分类鉴定第35页
     ·本文的研究目的和意义第35-36页
2.材料与方法第36-54页
   ·菌株第36-37页
   ·质粒第37页
   ·引物第37-38页
   ·培养基和实验试剂第38-40页
     ·培养基和普通实验试剂第38-39页
     ·生化试剂及免疫试剂第39-40页
   ·生物测定供试昆虫和靶细胞第40页
   ·DNA测序公司第40页
   ·仪器第40页
   ·各种溶液及配方第40-41页
   ·实验方法第41-54页
     ·微生物培养条件及菌种保藏第41页
     ·碱裂解法抽提大肠杆菌质粒DNA第41页
     ·大肠杆菌质粒DNA的少量快速提取及检测第41-42页
     ·苏云金芽胞杆菌总DNA抽提第42页
     ·DNA片段的回收第42-43页
     ·DNA的纯化第43页
     ·载体的去磷酸化第43页
     ·DNA的连接第43页
     ·大肠杆菌感受态的制备(CaCl_2法)及转化第43-44页
     ·苏云金芽胞杆菌的电穿孔第44页
     ·DNA的琼脂糖凝胶电泳第44-45页
     ·IPTG诱导大肠杆菌中重组基因的表达第45页
     ·PCR技术第45页
     ·AT克隆第45-46页
     ·苏云金芽胞杆菌RNA的抽提第46页
     ·RNA电泳(甲醛凝胶电泳)第46-47页
     ·RNA的定量以及质量检测第47页
     ·RT-PCR第47页
     ·SDS-PAGE和蛋白质的银染第47-48页
     ·Western blot第48-49页
     ·抗血清的制备第49-50页
     ·免疫双扩散定性检测抗体效价第50页
     ·ELISA定量检测抗体效价第50-51页
     ·蛋白质测序第51页
     ·蛋白质组学双向电泳分离技术第51-53页
     ·对棉铃虫毒力的生物测定和细胞毒性试验第53页
     ·分子生物学操作软件及基本生物信息学分析方法第53-54页
3.结果与分析第54-91页
   ·与苏云金芽胞杆菌相关的生物信息学分析第54-61页
     ·ctc_1和ctc_2基因密码子组成分析第54页
     ·ctc_1和ctc_2基因内部重复序列分析第54-55页
     ·ctc_1、ctc_2全基因重复序列分析第55页
     ·ctc_1和ctc_2基因上游启动子分析第55-56页
     ·ctc_1和ctc_2基因下游终止子分析第56页
     ·ctc_1基因的上游基因分析第56-57页
     ·ctc_1和ctc_2基因全长比对结果第57页
     ·CTC_1和CTC_2蛋白全长比对结果第57页
     ·CTC_1蛋白N段和CTC_2蛋白N段比对结果第57-58页
     ·CTC_1蛋白C段和CTC_2蛋白C段比对结果第58页
     ·CTC_1蛋白C段和CTC_2蛋白C段基因序列比对结果第58页
     ·CTC_1和CTC_2蛋白保守结构域SLH分析第58页
     ·S-层蛋白的信号肽预测第58-59页
     ·CTC_1蛋白和SAP蛋白比对结果第59页
     ·CTC_2蛋白和EA1蛋白比对结果第59页
     ·CTC_1-C和CTC_2-C末端多肽潜在的抗原决定簇分析第59-60页
     ·小结第60-61页
   ·苏云金芽胞杆菌一类新的内涵体蛋白第61-74页
     ·CTC菌株在不同pH环境下的生长曲线第61页
     ·CTC菌株表面S-层的研究第61-63页
       ·CTC菌株表面S-层的电镜观察第61-62页
       ·CTC菌株表面S-层的冰冻蚀刻第62页
       ·SDS-PAGE检测CTC菌株表面S-层第62页
       ·CTC菌株表面S-层的初抽提第62-63页
       ·CTC菌株表面S-层蛋白测序结果第63页
     ·UTC菌株芽胞期内涵体的研究第63-66页
       ·CTC菌株芽胞期内涵体的电镜观察第64页
       ·CTC菌株芽胞期内涵体的初抽提第64-65页
       ·CTC菌株芽胞期内涵体蛋白测序结果第65-66页
       ·CTC菌株芽胞期内涵体的表面结构第66页
     ·Bt.菌株中类CTC菌株的普查第66-73页
       ·CTC_1和CTC_2蛋白C末端特异性抗血清的制备第66-69页
       ·62个Bt.菌株内涵体的SDS-PAGE和Western blot分析第69页
       ·62个Bt.菌株的PCR分析第69-71页
       ·阳性菌株的基因克隆、测序和序列比对分析第71页
       ·阳性菌株H20ac、T68、H61的基本生物学性状第71-73页
     ·内涵体蛋白对棉铃虫的毒力和细胞毒性第73页
     ·小 结第73-74页
   ·苏云金芽胞杆菌的S-层形成内涵体与低氧条件有关第74-80页
     ·CTC菌株在不同培养条件下的生长状态第74-76页
       ·在常规摇床中的发酵比较研究第74页
       ·在固体平皿中的生长比较第74-75页
       ·在发酵罐中的分批发酵比较研究第75-76页
     ·不同通气条件下S-层形成内涵体的Western blot证据第76-77页
     ·不同通气条件下S-层形成内涵体的RT-PCR证据第77-78页
     ·在低氧条件下S-层形成内涵体的质谱证据第78页
     ·低氧条件下其它菌株的S-层蛋白形成内涵体第78-79页
     ·小结第79-80页
   ·苏云金芽胞杆菌中S-层功能的初步探索第80-90页
     ·CTC菌株中S-层基因的突变结果第80-87页
       ·S-层基因突变菌株的中间载体的构建第80-82页
       ·苏云金芽胞杆菌野生菌株的电转化条件第82-83页
       ·突变前的中间转化子BMB0549~*的获得第83页
       ·突变前的中间转化子BMB0549~*的PCR验证第83-84页
       ·通过双交换缺失CTC菌株的S-层基因示意图第84-85页
       ·ctc_1和ctc_2基因突变菌株的筛选结果第85页
       ·S-层基因突变菌株的验证第85-87页
     ·CTC菌株S-层缺失株耐碱性实验结果第87-88页
     ·通过蛋白质组学的方法研究S-层的功能第88-89页
       ·样品蛋白质浓度测定第88页
       ·突变株和野生株总蛋白的双向电泳第88-89页
     ·小结第89-90页
   ·本文主要结果总结第90-91页
4 讨论第91-93页
参考文献第93-101页
致谢第101-102页
附录第102-111页
攻博期间的成果第111页

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