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苎麻茎皮cDNA文库的构建及EST序列分析

摘要第1-10页
Abstract第10-11页
英文缩略表第11-12页
第一章 文献综述第12-24页
   ·cDNA文库的构建及其研究进展第12-17页
     ·构建cDNA文库的基本原理和方法第13-14页
     ·cDNA文库的种类第14-16页
     ·cDNA文库的应用第16-17页
   ·EST技术第17-22页
     ·EST技术原理与方法第18页
     ·生物信息学在EST技术中的应用第18-20页
     ·在功能基因组研究上的应用第20-22页
   ·本研究的目的与流程第22-24页
第二章 苎麻茎皮cDNA文库构建第24-34页
   ·实验材料第24-26页
     ·材料第24页
     ·主要试剂和常用溶液第24-25页
     ·器皿准备第25页
     ·培养基配方第25页
     ·主要仪器设备第25-26页
   ·实验方法第26-29页
     ·苎麻茎皮总RNA的提取第26页
     ·mRNA的分离和纯化第26页
     ·cDNA文库的构建第26-29页
   ·结果与分析第29-32页
     ·总RNA的提取第29-30页
     ·mRNA分离纯化第30页
     ·cDNA的合成及分析第30页
     ·cDNA文库的质量第30-32页
   ·讨论第32-34页
     ·苎麻茎皮总RNA的提取第32-33页
     ·cDNA文库的质量第33-34页
第三章 苎麻茎皮EST序列与生物信息学分析第34-47页
   ·实验材料第34-35页
     ·材料第34页
     ·主要试剂第34页
     ·培养基配方第34-35页
     ·主要仪器设备第35页
   ·实验方法第35-36页
     ·DNA序列测定第35页
     ·测序PCR反应第35-36页
     ·生物信息学分析第36页
   ·结果与分析第36-45页
     ·EST测序起点第36-37页
     ·EST序列的获得第37-38页
     ·GenBank序列提交第38页
     ·与NCBI数据库BLAST比对结果第38-39页
     ·BlastX比对具已知功能和推测功能的EST分析第39-43页
     ·高丰度表达的基因与纤维发育相关基因第43-45页
   ·讨论第45-47页
     ·BlastN和BlastX比对结果差异分析第45页
     ·Blast比对情况第45页
     ·茎皮的主要功能基因分类第45-47页
第四章 结论第47-49页
   ·构建了2个高质量的苎麻茎皮cDNA文库第47页
   ·获得275条有效ESTs并进行生物信息学分析第47页
   ·获得12类苎麻茎皮的功能基因第47页
   ·获得8个纤维发育相关基因序列第47-48页
   ·今后研究方向第48-49页
参考文献第49-55页
附录1 测序结果示意图第55-56页
附录2 Blast比对第56-60页
附录3 EST格式第60-62页
致谢第62-63页
作者简历第63页

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