摘要 | 第1-10页 |
Abstract | 第10-11页 |
英文缩略表 | 第11-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-24页 |
·cDNA文库的构建及其研究进展 | 第12-17页 |
·构建cDNA文库的基本原理和方法 | 第13-14页 |
·cDNA文库的种类 | 第14-16页 |
·cDNA文库的应用 | 第16-17页 |
·EST技术 | 第17-22页 |
·EST技术原理与方法 | 第18页 |
·生物信息学在EST技术中的应用 | 第18-20页 |
·在功能基因组研究上的应用 | 第20-22页 |
·本研究的目的与流程 | 第22-24页 |
第二章 苎麻茎皮cDNA文库构建 | 第24-34页 |
·实验材料 | 第24-26页 |
·材料 | 第24页 |
·主要试剂和常用溶液 | 第24-25页 |
·器皿准备 | 第25页 |
·培养基配方 | 第25页 |
·主要仪器设备 | 第25-26页 |
·实验方法 | 第26-29页 |
·苎麻茎皮总RNA的提取 | 第26页 |
·mRNA的分离和纯化 | 第26页 |
·cDNA文库的构建 | 第26-29页 |
·结果与分析 | 第29-32页 |
·总RNA的提取 | 第29-30页 |
·mRNA分离纯化 | 第30页 |
·cDNA的合成及分析 | 第30页 |
·cDNA文库的质量 | 第30-32页 |
·讨论 | 第32-34页 |
·苎麻茎皮总RNA的提取 | 第32-33页 |
·cDNA文库的质量 | 第33-34页 |
第三章 苎麻茎皮EST序列与生物信息学分析 | 第34-47页 |
·实验材料 | 第34-35页 |
·材料 | 第34页 |
·主要试剂 | 第34页 |
·培养基配方 | 第34-35页 |
·主要仪器设备 | 第35页 |
·实验方法 | 第35-36页 |
·DNA序列测定 | 第35页 |
·测序PCR反应 | 第35-36页 |
·生物信息学分析 | 第36页 |
·结果与分析 | 第36-45页 |
·EST测序起点 | 第36-37页 |
·EST序列的获得 | 第37-38页 |
·GenBank序列提交 | 第38页 |
·与NCBI数据库BLAST比对结果 | 第38-39页 |
·BlastX比对具已知功能和推测功能的EST分析 | 第39-43页 |
·高丰度表达的基因与纤维发育相关基因 | 第43-45页 |
·讨论 | 第45-47页 |
·BlastN和BlastX比对结果差异分析 | 第45页 |
·Blast比对情况 | 第45页 |
·茎皮的主要功能基因分类 | 第45-47页 |
第四章 结论 | 第47-49页 |
·构建了2个高质量的苎麻茎皮cDNA文库 | 第47页 |
·获得275条有效ESTs并进行生物信息学分析 | 第47页 |
·获得12类苎麻茎皮的功能基因 | 第47页 |
·获得8个纤维发育相关基因序列 | 第47-48页 |
·今后研究方向 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-55页 |
附录1 测序结果示意图 | 第55-56页 |
附录2 Blast比对 | 第56-60页 |
附录3 EST格式 | 第60-62页 |
致谢 | 第62-63页 |
作者简历 | 第63页 |