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三种植物病原细菌的实时荧光定量PCR检测

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-11页
第一章 文献综述第11-28页
 1.研究目的及意义第11-12页
 2.细菌鉴定检测方法第12-18页
   ·传统的细菌分类、鉴定和检测方法第12页
   ·数值分类法第12页
   ·化学分类法第12-14页
   ·血清学第14页
   ·分子生物学和遗传学方法第14-18页
     ·DNA的碱基组成即G+C mol%第14页
     ·DNA同源性测定第14-15页
     ·DNA—RNA重配试验第15页
     ·蛋白质分析法第15页
     ·RFLP第15页
     ·rDNA-PCR第15-17页
     ·RAPD基因指纹图谱分析第17页
     ·rep-PCR基因指纹图谱分析第17页
     ·AFLP遗传分析第17-18页
     ·SCAR标记和ITS研究进展第18页
 3.细菌的定量方法第18-28页
   ·传统的细菌计数方法第18-19页
     ·测数计计数法第18页
     ·混浊度计数法第18-19页
     ·平板菌落计数法第19页
     ·其他方法第19页
   ·PCR定量法第19-28页
     ·传统PCR定量方法第19页
       ·内参照法第19页
       ·竞争法第19页
       ·PCR—ELISA法第19页
       ·内标在传统定量中的作用第19页
     ·实时荧光定量PCR第19-28页
       ·原理第21-22页
       ·荧光化学第22-25页
       ·定量方法第25页
       ·实时荧光定量PCR技术的应用第25-27页
       ·存在的问题及应用前景第27-28页
第二章 研究内容第28-53页
 1.材料与方法第28-39页
   ·参试菌株第28-31页
   ·试剂及培养基第31-32页
   ·通用引物扩增第32-34页
     ·细菌基因组DNA的提取和纯化第32-33页
     ·DNA样品的浓度测定第33页
     ·通用引物扩增16s及16S-23SrDNA间的ITS第33-34页
     ·电泳第34页
   ·PCR产物的回收、克隆和测序第34-37页
     ·试剂盒回收DNA第34页
     ·多态性片段的克隆第34-37页
       ·感受态细胞的制备第34-35页
       ·DNA片段的连接第35页
       ·DNA片段的转化第35-36页
       ·阳性克隆的验证第36页
       ·质粒的少量提取(碱裂解法)第36-37页
     ·DNA序列的测定第37页
   ·引物设计第37页
   ·特异性引物的常规PCR扩增及电泳第37-38页
   ·实时荧光定量PCR的扩增第38-39页
     ·实时荧光定量PCR的扩增体系及程序第38页
     ·标准曲线的制备第38-39页
     ·植物组织中病原菌的检测第39页
 2.结果与分析第39-50页
   ·特异性引物的设计第39页
   ·引物的特异性验证第39-40页
   ·实时荧光PCR检测第40-44页
   ·标准曲线的制备第44-48页
   ·实时荧光PCR的灵敏度检测第48-49页
   ·糖甜菜叶片中Tc7的实时荧光PCR检测第49-50页
 3.结论及讨论第50-53页
参考文献第53-57页
致谢第57页

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