小麦与条锈菌亲和互作cDNA文库高通量ESTs分析平台构建及相关分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-26页 |
| ·小麦条锈病研究进展 | 第10-11页 |
| ·生物信息学概述 | 第11-17页 |
| ·生物信息学发展史 | 第11-12页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第12-14页 |
| ·生物信息学方法及技术 | 第14-16页 |
| ·生物信息学在植物抗性基因研究中的应用 | 第16-17页 |
| ·生物数据库及ESTS研究进展 | 第17-24页 |
| ·生物数据库 | 第17-21页 |
| ·ESTs 研究进展 | 第21-24页 |
| ·本研究的目的、意义及主要内容 | 第24-26页 |
| ·研究的目的及意义 | 第24-25页 |
| ·研究的主要内容 | 第25-26页 |
| 第二章 ESTS 数据来源及分析平台的构建 | 第26-38页 |
| ·ESTS数据来源 | 第26页 |
| ·ESTS分析平台的构建 | 第26-38页 |
| ·系统硬件配置及操作系统安装 | 第26页 |
| ·ESTs 分析平台构成及流程图 | 第26页 |
| ·ESTs 序列前处理系统构建及处理流程 | 第26-30页 |
| ·ESTs 序列同源性分析系统 | 第30-32页 |
| ·ESTs 功能注释分类系统 | 第32-36页 |
| ·系统构建中相关程序及perl 脚本介绍 | 第36-38页 |
| 第三章 结果与分析 | 第38-43页 |
| ·聚类拼接结果分析 | 第38-39页 |
| ·功能注释结果分析 | 第39-43页 |
| ·基于GO 分类的功能注释 | 第39-40页 |
| ·基于KO 的功能注释 | 第40-41页 |
| ·基于拟南芥和酵母菌蛋白数据库的功能注释 | 第41-43页 |
| 第四章 讨论 | 第43-46页 |
| ·关于ESTS序列的聚类拼接 | 第43-44页 |
| ·关于ESTS的功能注释 | 第44页 |
| ·关于ESTS自动化分析系统 | 第44-45页 |
| ·分析系统的可操作性 | 第44页 |
| ·分析系统的针对性 | 第44-45页 |
| ·分析系统的维护与更新 | 第45页 |
| ·进一步工作构想 | 第45-46页 |
| 第五章 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 作者简介 | 第53页 |
