| 摘要 | 第1-3页 |
| ABSTRACT | 第3-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第6-20页 |
| ·系统生物学的建立和发展现状 | 第6-8页 |
| ·系统生物学的研究目标 | 第7页 |
| ·系统生物学的研究方法 | 第7-8页 |
| ·系统生物学的发展趋势 | 第8页 |
| ·代谢工程的发展和现状 | 第8页 |
| ·生物信息学的发展和现状 | 第8-12页 |
| ·生物信息学的内容和研究方向 | 第9-10页 |
| ·基于基因组信息的代谢网络资源介绍 | 第10-12页 |
| ·代谢网络的重建及其利用 | 第12-18页 |
| ·代谢网络的基本特征 | 第12-13页 |
| ·代谢网络的重建 | 第13-14页 |
| ·代谢网络模型的修正 | 第14-15页 |
| ·重建网络的表示 | 第15-16页 |
| ·重建网络的性能及应用 | 第16-18页 |
| ·枯草芽孢杆菌简介 | 第18-19页 |
| ·本论文的研究意义 | 第19页 |
| ·本论文研究的主要内容 | 第19-20页 |
| 第二章 由基因组数据建立枯草芽孢杆菌代谢网络模型 | 第20-45页 |
| ·代谢网络数据的获得 | 第20-24页 |
| ·代谢反应数据库的建立 | 第24-29页 |
| ·代谢反应数据库的补充修正和完善 | 第29-34页 |
| ·孤立途径和封闭途径的处理 | 第34-44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 第三章 枯草芽孢杆菌代谢网络的分割 | 第45-47页 |
| ·代谢网络的分割原则 | 第45页 |
| ·子网络的划分结果 | 第45-46页 |
| ·小结 | 第46-47页 |
| 第四章 已核查的部分枯草芽孢杆菌代谢网络的绘制 | 第47-52页 |
| ·现已分析的子网络 | 第47-50页 |
| ·代谢途径的分析结果对代谢网络数据库的补充和修正 | 第50-51页 |
| ·小结 | 第51-52页 |
| 第五章 结论和展望 | 第52-53页 |
| ·结论 | 第52页 |
| ·展望 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 附录一 应用Excel进行枯草芽孢杆菌代谢反应数据库的建立 | 第58-66页 |
| 附录二 由互联网所得各数据库信息及新建数据库信息说明 | 第66-67页 |
| 附录三 核酸代谢途径的代谢图谱 | 第67-71页 |
| 附录四 代谢网络各代谢物缩写及对应中文名称 | 第71-80页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第80-81页 |
| 致谢 | 第81页 |