| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-13页 |
| 缩略词 | 第13-19页 |
| 1 绪论 | 第19-39页 |
| ·研究意义与背景 | 第19-20页 |
| ·基因组差异分析方法的种类 | 第20页 |
| ·用于DNA 分子标记的基因组差异分析 | 第20-22页 |
| ·限制性片段长度多态性(RFLP) | 第21页 |
| ·随机扩增多态性DNA(RAPD) | 第21页 |
| ·扩增片段长度多态性(AFLP) | 第21-22页 |
| ·基于消减杂交的分离差异方法 | 第22-28页 |
| ·消减杂交的原理 | 第22页 |
| ·消减方式 | 第22-24页 |
| ·常用的消减杂交方法 | 第24-28页 |
| ·现有消减杂交方法的缺陷 | 第28页 |
| ·差异序列的确定 | 第28-30页 |
| ·Southern 杂交或点杂交 | 第28-30页 |
| ·菌落杂交分析 | 第30页 |
| ·核酸数据库比对分析 | 第30页 |
| ·几种差异基因检测技术的比较 | 第30-31页 |
| ·差异基因检测技术的应用 | 第31-32页 |
| ·基因的分离 | 第31页 |
| ·物种的鉴定和进化 | 第31-32页 |
| ·分子标记 | 第32页 |
| ·小结 | 第32页 |
| ·研究目标和整体思路 | 第32-33页 |
| ·研究目标 | 第32页 |
| ·整体思路 | 第32-33页 |
| ·研究内容与技术路线 | 第33-38页 |
| ·研究内容 | 第33-34页 |
| ·技术路线 | 第34-38页 |
| ·本研究的创新性 | 第38-39页 |
| 2 材料和方法 | 第39-57页 |
| ·材料 | 第39-43页 |
| ·菌株 | 第39页 |
| ·主要试剂 | 第39页 |
| ·主要溶液配制 | 第39-42页 |
| ·主要仪器设备 | 第42-43页 |
| ·主要方法 | 第43-57页 |
| ·酵母基因组DNA提取(酶解法) | 第43页 |
| ·基因组DNA纯度及浓度测定 | 第43页 |
| ·杂交监控体系的建立 | 第43-45页 |
| ·接头制备 | 第45-46页 |
| ·Tester DNA (酿酒酵母)的准备 | 第46-47页 |
| ·Driver DNA(裂殖酵母)的处理 | 第47-48页 |
| ·消减杂交过程分析 | 第48-49页 |
| ·差异片段的克隆 | 第49-51页 |
| ·测序结果分析 | 第51-52页 |
| ·差异片断的富集效率 | 第52-54页 |
| ·覆盖率统计分析 | 第54-57页 |
| 3 结果与分析 | 第57-81页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第57页 |
| ·杂交监控体系的建立 | 第57-64页 |
| ·185 rDNA同源性分析 | 第57-61页 |
| ·杂交监控序列的扩增 | 第61-64页 |
| ·Tester 和driver DNA 的处理 | 第64-69页 |
| ·Tester DNA(酿酒酵母)的酶切 | 第64-65页 |
| ·分析tester DNA酶切片段与接头的连接效率 | 第65-66页 |
| ·Driver DNA(裂殖酵母)的处理 | 第66-67页 |
| ·Driver DNA 固定膜的选择及漂洗过程 | 第67-68页 |
| ·Driver DNA 的固定效率 | 第68-69页 |
| ·杂交过程分析 | 第69-71页 |
| ·185 rDNA对消减过程的监控分析 | 第69-70页 |
| ·杂交后tester DNA的扩增 | 第70-71页 |
| ·数据分析及方法评价 | 第71-81页 |
| ·差异片段的分析 | 第71-75页 |
| ·差异片段的富集效率 | 第75-76页 |
| ·覆盖率分析 | 第76-81页 |
| 4 讨论 | 第81-93页 |
| ·本研究中实验材料的选择 | 第81页 |
| ·杂交监控差异分析的特点及其与其他方法的比较 | 第81-83页 |
| ·引入杂交监控体系 | 第81-82页 |
| ·以PCR 为基础的差异分析 | 第82页 |
| ·利用消减杂交的基本原理 | 第82页 |
| ·发挥膜杂交的优势 | 第82-83页 |
| ·杂交监控差异分析与其他方法的比较 | 第83-85页 |
| ·Tester DNA的处理 | 第83页 |
| ·Driver DNA的处理 | 第83页 |
| ·消减过程 | 第83-84页 |
| ·差异片段的扩增 | 第84页 |
| ·差异分析的效率 | 第84-85页 |
| ·适用范围 | 第85页 |
| ·液相杂交和固相杂交在消减杂交中的优劣 | 第85-86页 |
| ·液相消减杂交 | 第85-86页 |
| ·固相消减杂交 | 第86页 |
| ·185 rDNA 在其他生物基因组DNA 差异分析中的应用 | 第86页 |
| ·185 rDNA 监控分析对不同拷贝 DNA 序列差异分析的影响 | 第86-87页 |
| ·影响杂交监控差异分析阳性率的因素 | 第87-88页 |
| ·相似区域大小 | 第87-88页 |
| ·杂交的严谨性 | 第88页 |
| ·相似性比较中E值设定 | 第88页 |
| ·影响杂交监控差异分析覆盖率的因素 | 第88-89页 |
| ·连接效率对覆盖率的影响 | 第88-89页 |
| ·非特异性吸附对覆盖率的影响 | 第89页 |
| ·PCR 扩增条件对覆盖率的影响 | 第89页 |
| ·影响杂交监控差异分析富集效率的因素 | 第89-91页 |
| ·评价差减效率的方法 | 第89-90页 |
| ·影响差异富集效率的因素 | 第90-91页 |
| 5 结论 | 第91-93页 |
| 致谢 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-103页 |
| 附录1 | 第103-105页 |
| 附录2 | 第105-109页 |
