| 第一章 基因芯片 | 第1-38页 |
| ·生物芯片简介 | 第12-13页 |
| ·基因芯片的原理及类型 | 第13-14页 |
| ·原位合成法 | 第13页 |
| ·直接点样芯片 | 第13页 |
| ·原位合成法与直接点样法比较 | 第13-14页 |
| ·PCR芯片 | 第14页 |
| ·样本制备，标记与芯片杂交 | 第14-16页 |
| ·样本制备 | 第14-15页 |
| ·样本标记 | 第15-16页 |
| ·芯片杂交 | 第16页 |
| ·图像处理与数据处理 | 第16-23页 |
| ·图像处理 | 第16-23页 |
| ·生物芯片荧光图像的视图处理 | 第17页 |
| ·图像处理 | 第17-18页 |
| ·图像的平滑处理与赝像，污染的去除 | 第18页 |
| ·样品的识别 | 第18-19页 |
| ·背景的确定 | 第19-20页 |
| ·样点信号的确定 | 第20页 |
| ·芯片数据归一化 | 第20-23页 |
| ·聚类分析 | 第23-27页 |
| ·系统聚类分析 | 第24页 |
| ·逐步聚类分析 | 第24页 |
| ·自组图分析 | 第24-25页 |
| ·主成分分析 | 第25页 |
| ·时间系列分析 | 第25页 |
| ·其他系统分析方法 | 第25-27页 |
| ·基因芯片的应用 | 第27-35页 |
| ·基因芯片在测序和及再测序中的应用 | 第27-28页 |
| ·杂交测序技术 | 第28页 |
| ·邻近杂交测序技术 | 第28页 |
| ·芯片在突变和多态性检测和分析中的应用 | 第28-29页 |
| ·基因芯片与大规模基因表达谱分析 | 第29-33页 |
| ·基因芯片在疾病诊断中的应用 | 第33-34页 |
| ·感染性疾病诊断 | 第33-34页 |
| ·遗产性疾病的诊断 | 第34页 |
| ·基因芯片技术在药物研究中的应用 | 第34-35页 |
| ·遗传药理学与合理用药 | 第34-35页 |
| ·基因芯片技术在疾病耐药性研究及检测方面的应用 | 第35页 |
| ·基因芯片在微生物菌种鉴定及致病机制中的应用 | 第35页 |
| ·参考文献 | 第35-38页 |
| 第二章 内质网压力反应 | 第38-73页 |
| ·ER压力 | 第38-46页 |
| ·蛋白质折叠原理 | 第39-46页 |
| ·热动力学 | 第39页 |
| ·动力学 | 第39-40页 |
| ·蛋白质在ER中的折叠 | 第40-41页 |
| ·蛋白质折叠器 | 第41-42页 |
| ·ER压力分子伴侣的功能 | 第42-43页 |
| ·非折叠蛋白的识别 | 第43-46页 |
| ·内质网中非折叠蛋白的管理机制 | 第46-56页 |
| ·转录诱导、翻译减弱和降解 | 第46-49页 |
| ·UPR的时间控制：不同的感受器，不同的角色 | 第49-51页 |
| ·正、负反馈环路 | 第51页 |
| ·慎重的选择，是生存还是死亡 | 第51-55页 |
| ·BoX_1 B细胞分化和UPR | 第55-56页 |
| ·在ER压力期间翻译控制是如何发生的? | 第56页 |
| ·内质网贮存性疾病 | 第56-58页 |
| ·展望 | 第58页 |
| ·参考文献 | 第58-73页 |
| 第三章 丙型肝炎病毒非结构蛋白NS4B对HeLa细胞基因表达谱的影响 | 第73-103页 |
| ·引言 | 第73-74页 |
| ·材料和方法 | 第74-86页 |
| ·实验材料 | 第74-78页 |
| ·实验方法 | 第78-86页 |
| ·HCV NS4B重组真核表达质粒的构建 | 第78-81页 |
| ·细胞培养和转染 | 第81-86页 |
| ·结果 | 第86-95页 |
| ·重组HCV NS4B真核表达质粒的构建 | 第86页 |
| ·HCV NS4B蛋白基因在HeLa稳定细胞和Huh-7细胞中的表达 | 第86-88页 |
| ·RT-PCR检测NS4B的mRNA | 第86-87页 |
| ·Western blot检测NS4B蛋白 | 第87-88页 |
| ·点阵分析HCVNS4B对HeLa细胞信号调节的影响 | 第88-95页 |
| ·微点阵系统的建立 | 第88-90页 |
| ·表达差异的分析 | 第90-93页 |
| ·对微点阵结果的验证 | 第93-95页 |
| ·AKRICI酶活性的检测 | 第95页 |
| ·讨论 | 第95-98页 |
| ·参考文献 | 第98-103页 |
| 第四章 丙型肝炎病毒NS4B诱导细胞非折叠蛋白反应(UPR) | 第103-123页 |
| ·引言 | 第103-104页 |
| ·实验材料 | 第104-112页 |
| ·实验材料 | 第104-109页 |
| ·实验方法 | 第109-112页 |
| ·质粒的构建 | 第109页 |
| ·细胞培养和转染 | 第109页 |
| ·Western Blot | 第109页 |
| ·XBPl的RT-PCR | 第109页 |
| ·ATF6和Grp78的Real-time定量RT-PCR | 第109-110页 |
| ·荧光素酶活性报告基因分析 | 第110页 |
| ·染色质免疫沉淀实验(ChIP) | 第110-112页 |
| ·结果 | 第112-118页 |
| ·NS4B的鉴定 | 第112-113页 |
| ·XBPl的表达 | 第113页 |
| ·NS4B诱导XBPl(s)的产生 | 第113-114页 |
| ·荧光素酶的活性 | 第114页 |
| ·染色质免疫沉淀 | 第114-118页 |
| ·讨论 | 第118-119页 |
| ·参考文献 | 第119-123页 |
| 博士研究生期间发表和待发表论文 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
