| 致谢 | 第1-11页 |
| 中文摘要 | 第11-15页 |
| 英文摘要 | 第15-18页 |
| 表格目录 | 第18页 |
| 图形目录 | 第18-19页 |
| 附录目录 | 第19-20页 |
| 第一章 绪论 | 第20-31页 |
| 一 引言 | 第20-21页 |
| 二 研究概况 | 第21-22页 |
| 三 存在问题 | 第22-26页 |
| 1 系统发育关系研究 | 第22页 |
| 2 种、属分类研究 | 第22-23页 |
| ·属级分类 | 第23页 |
| ·种级分类 | 第23页 |
| 3 系统发育与形态多态性、地理分布格局关系的研究 | 第23-26页 |
| ·系统发育与形态多态性 | 第23-24页 |
| ·系统发育与地理分布格局 | 第24-26页 |
| 四 研究方案 | 第26-29页 |
| 1 实验技术手段 | 第26-27页 |
| 2 数据分析方法 | 第27-29页 |
| ·分子数据分析的理论前提 | 第27页 |
| ·分子数据分析之方法论 | 第27-29页 |
| 五 论文框架 | 第29-31页 |
| 第二章 “liua近缘群”的系统发育及其分类探讨 | 第31-63页 |
| 一 引言 | 第31-36页 |
| 1 分类史 | 第31-34页 |
| 2 隐存种cryptic species的疑问 | 第34-36页 |
| 3 系统发育研究现状 | 第36页 |
| 4 研究目的 | 第36页 |
| 二 材料与方法 | 第36-45页 |
| 1 实验材料 | 第36-37页 |
| 2 同功酶实验与数据分析 | 第37-39页 |
| ·实验分析 | 第37页 |
| ·数据分析 | 第37-39页 |
| 3 DNA实验与数据分析 | 第39-45页 |
| ·基因选择 | 第39-40页 |
| ·总DNA的提取、PCR扩增和序列测定 | 第40-41页 |
| ·序列编辑及排序 | 第41页 |
| ·系统发育推断 | 第41-45页 |
| ·数据分析 | 第41-42页 |
| ·外群选取 | 第42页 |
| ·重建系统发育关系树 | 第42-44页 |
| ·系统发育树拓朴结构的评估 | 第44-45页 |
| ·遗传距离分析 | 第45页 |
| 三 结果 | 第45-56页 |
| 1 同功酶 | 第45-51页 |
| ·等位基因频率和遗传多样性的度量 | 第45-46页 |
| ·固定的等位基因差异 | 第46页 |
| ·居群或种的遗传结构的度量 | 第46页 |
| ·哈迪-温伯格平衡符合度的检测 | 第46页 |
| ·F-统计量 | 第46页 |
| ·种下居群间的遗传学关系的度量 | 第46-51页 |
| 2 DNA序列 | 第51-56页 |
| ·DNA序列及排序结果 | 第51页 |
| ·系统发育推断 | 第51-53页 |
| ·数据分析 | 第51页 |
| ·系统发育关系 | 第51-53页 |
| ·遗传距离分析 | 第53-56页 |
| 四 讨论 | 第56-63页 |
| 1 种下遗传变异兼议物种分化 | 第56-59页 |
| 2 “Liua近缘群”种间系统发育关系与属的分类安排 | 第59-61页 |
| 3 “Liua近缘群”分类安排小结 | 第61页 |
| 4 “Liua近缘群”的地理分布格局 | 第61-63页 |
| 第三章 山溪鲵的系统发育、分类及形态多态 | 第63-86页 |
| 一 引言 | 第63-69页 |
| 1 物种分类史及形态特征 | 第63-64页 |
| 2 分类史及疑问 | 第64-66页 |
| 3 形态多态性 | 第66-67页 |
| 4 系统发育研究现状 | 第67页 |
| 5 研究目的 | 第67-69页 |
| 二 材料与方法 | 第69-70页 |
| 1 实验材料 | 第69页 |
| 2 DNA实验与数据分析 | 第69-70页 |
| ·基因选择 | 第69页 |
| ·总DNA的提取、PCR扩增和序列测定 | 第69页 |
| ·序列编辑及排序 | 第69页 |
| ·系统发育推断 | 第69页 |
| ·遗传距离分析 | 第69-70页 |
| 三 结果 | 第70-76页 |
| 1 DNA序列 | 第70页 |
| 2 系统发育推断 | 第70-72页 |
| ·数据分析 | 第70页 |
| ·系统发育关系 | 第70-72页 |
| 3 遗传距离分析 | 第72-76页 |
| 四 讨论 | 第76-86页 |
| 1 种下遗传变异兼议物种分化 | 第76-79页 |
| 2 山溪鲵属物种的地理分布格局 | 第79-84页 |
| 3 系统发育与形态多态 | 第84-86页 |
| 第四章 西部小鲵的系统发育兼议其隔离分化式格局形成 | 第86-100页 |
| 一 引言 | 第86-91页 |
| 1 系统发育研究现状 | 第86-89页 |
| 2 西部小鲵分布及其成因研究现状 | 第89页 |
| 3 研究目的 | 第89-91页 |
| 二 材料与方法 | 第91-92页 |
| 1 实验材料 | 第91页 |
| 2 DNA实验与数据分析 | 第91-92页 |
| ·基因选择 | 第91页 |
| ·总DNA的提取、PCR扩增和序列测定 | 第91页 |
| ·序列编辑及排序 | 第91页 |
| ·系统发育推断 | 第91-92页 |
| 三 结果 | 第92-97页 |
| 1 DNA序列及排序结果 | 第92页 |
| 2 系统发育推断 | 第92-97页 |
| ·数据分析 | 第92页 |
| ·系统发育关系 | 第92-93页 |
| ·拓朴结构对比检验 | 第93-97页 |
| 四 讨论 | 第97-100页 |
| 1 西部小鲵的系统发育 | 第97页 |
| 2 系统发育与分布格局 | 第97-100页 |
| 第五章 结论 | 第100-103页 |
| 参考文献 | 第103-109页 |
| 论文发表情况 | 第109-110页 |
| 附录 | 第110-150页 |