改进的系统发育谱方法在蛋白质功能预测中的应用
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 引言 | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-13页 |
| ·研究意义 | 第9页 |
| ·研究目的 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-11页 |
| ·本文的主要工作 | 第11-12页 |
| ·本文组织结构 | 第12-13页 |
| 第二章 背景知识简介 | 第13-23页 |
| ·蛋白质功能注释方法介绍 | 第13-15页 |
| ·同源性方法 | 第13-14页 |
| ·非同源性方法 | 第14-15页 |
| ·经典的聚类算法 | 第15-22页 |
| ·K-means 聚类算法 | 第16-20页 |
| ·层次聚类算法 | 第20-22页 |
| ·聚类算法在生物信息学中的应用 | 第22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第三章 基于权值的系统发育谱的构造 | 第23-31页 |
| ·系统发育谱方法简介 | 第23-24页 |
| ·参照基因组的选择 | 第24-28页 |
| ·基于树的参照基因组选择方法 | 第26-27页 |
| ·基于遗传距离的参照基因组选择方法 | 第27页 |
| ·系统发育谱的构造 | 第27-28页 |
| ·基于权重的系统发育谱的构造 | 第28-30页 |
| ·小结 | 第30-31页 |
| 第四章 基于聚类算法的谱的相似性分析 | 第31-36页 |
| ·谱的相似性分析 | 第31-33页 |
| ·基于距离函数的谱的相似性分析 | 第31页 |
| ·基于相关系数的谱的相似性分析 | 第31-32页 |
| ·基于相互信息量的谱的相似性分析 | 第32-33页 |
| ·存在的问题 | 第33页 |
| ·基于聚类的系统发育谱的相似性分析 | 第33-35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第五章 改进的系统发育谱方法对蛋白质的功能注释 | 第36-44页 |
| ·算法描述 | 第36页 |
| ·实验数据 | 第36-37页 |
| ·实验分析 | 第37-43页 |
| ·实验过程 | 第38-42页 |
| ·性能评价 | 第42-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 结束语 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 发表论文和参与科研情况 | 第49页 |
