| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 前言 | 第11-22页 |
| 1 侵袭性牙周炎研究现状 | 第11-16页 |
| ·AgP简介 | 第11-12页 |
| ·AgP病因研究回顾 | 第12-14页 |
| ·中性粒细胞细胞与AgP关联性 | 第14-16页 |
| 2 CYP2A7研究现状及其功能 | 第16-19页 |
| ·细胞色素P450(cytochrome,CYP450) | 第16-17页 |
| ·CYP2A6 | 第17-18页 |
| ·CYP2A7 | 第18页 |
| ·本实验室前期研究 | 第18-19页 |
| 3 生物信息学分析方法 | 第19-22页 |
| ·核酸序列数据库 | 第20-21页 |
| ·蛋白质序列数据库 | 第21页 |
| ·结构数据库 | 第21页 |
| ·基因组数据库 | 第21-22页 |
| 第一部分 CYP2A7在AgP中的表达研究 | 第22-39页 |
| 材料与方法 | 第22-33页 |
| 1 材料 | 第22-26页 |
| ·病例选择 | 第22-24页 |
| ·血液样本的采集 | 第24页 |
| ·定量用PCR引物 | 第24页 |
| ·仪器和试剂 | 第24-26页 |
| ·本实验所用仪器 | 第24-25页 |
| ·主要试剂 | 第25页 |
| ·常用试剂配方 | 第25-26页 |
| 2 方法 | 第26-33页 |
| ·白细胞分离 | 第26页 |
| ·总RNA的提取和测定 | 第26-27页 |
| ·基因组DNA的消化及cDNA的合成 | 第27-28页 |
| ·总RNA中基因组DNA的消化 | 第27-28页 |
| ·cDNA的合成 | 第28页 |
| ·引物设计及cDNA合成质量的检测 | 第28-29页 |
| ·引物设计原则 | 第28-29页 |
| ·cDNA合成质量的检测 | 第29页 |
| ·SYBR-Green Ⅰ法荧光定量PCR检测体系的建立 | 第29-31页 |
| ·CYP2A7在AgP中的表达研究 | 第31页 |
| ·定量数据统计分析 | 第31-33页 |
| 结果 | 第33-38页 |
| 1 总RNA的抽提检测结果 | 第33页 |
| 2 cDNA检测结果 | 第33-34页 |
| 3 荧光定量体系优化结果 | 第34-36页 |
| 4 CYP2A7在AgP中的表达研究结果 | 第36-38页 |
| 小结 | 第38-39页 |
| 第二部分 CYP2A7的生物信息学分析 | 第39-65页 |
| 材料与方法 | 第39-45页 |
| 1 材料 | 第39页 |
| 2 方法 | 第39-45页 |
| ·同源比对 | 第39-40页 |
| ·蛋白一级结构分析 | 第40-41页 |
| ·SAPS | 第40页 |
| ·Weizmann/SeqFacts | 第40-41页 |
| ·ProtParam | 第41页 |
| ·蛋白二级结构预测 | 第41-42页 |
| ·PSIPRED | 第41页 |
| ·PredictProtein | 第41-42页 |
| ·蛋白三级结构预测 | 第42页 |
| ·结构域分析 | 第42-43页 |
| ·Pfam HMM | 第42-43页 |
| ·SMART | 第43页 |
| ·蛋白可溶性分析 | 第43-44页 |
| ·ProtParam | 第43页 |
| ·PredictProtein | 第43页 |
| ·SOSUI | 第43-44页 |
| ·跨膜区和信号肽预测 | 第44页 |
| ·跨膜区域 | 第44页 |
| ·信号肽分析 | 第44页 |
| ·综合分析 | 第44-45页 |
| ·功能预测 | 第45页 |
| 结果 | 第45-57页 |
| 1 同源比对结果 | 第45-46页 |
| 2 蛋白一级结构分析 | 第46-47页 |
| 3 蛋白二级结构预测 | 第47-50页 |
| ·PredictProtein预测结果 | 第47-48页 |
| ·PSIPRED预测结果 | 第48-50页 |
| 4 蛋白三级结构预测 | 第50-52页 |
| 5 结构域分析 | 第52页 |
| ·Pfam预测结果 | 第52页 |
| ·SMART预测结果 | 第52页 |
| 6 蛋白可溶性分析 | 第52-53页 |
| ·PROTPARAM预测结果 | 第52页 |
| ·PredictProtein预测结果 | 第52-53页 |
| ·SOSUI预测结果 | 第53页 |
| 7 跨膜区和信号肽预测结果 | 第53-56页 |
| ·跨膜区域结果 | 第53-55页 |
| ·TMHMM分析结果 | 第53-54页 |
| ·HMMTOP分析结果 | 第54-55页 |
| ·信号肽分析结果 | 第55-56页 |
| 8 综合分析结果 | 第56页 |
| 9 功能预测 | 第56-57页 |
| 小结 | 第57-58页 |
| 讨论 | 第58-65页 |
| 1 荧光定量PCR结果与基因芯片结果一致性研究 | 第58-59页 |
| 2 侵袭性牙周炎中CYP2A7表达变化的生物学意义 | 第59-63页 |
| ·CYP2A7结构功能的推测 | 第59-61页 |
| ·CYP2A7的生物学功能推测 | 第61-62页 |
| ·CYP2A7的表达变化对AgP的影响 | 第62-63页 |
| 3 蛋白3级结构预测探讨 | 第63-65页 |
| 展望 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-73页 |
| CYP2A7相关研究进展 | 第73-81页 |
| 致谢 | 第81页 |
