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栓菌及其近缘属的分子系统学研究

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 绪论第11-18页
   ·分子系统学研究方法简介第11-14页
     ·G+C百分含量第11页
     ·DNA-DNA杂交第11-12页
     ·RAPD技术第12页
     ·RFLP技术第12页
     ·核酸序列分析第12-14页
   ·构建系统发育树的主要运算方法第14-15页
   ·RNA二级结构预测的原理在分子系统学中的意义第15页
   ·栓菌属真菌分类及系统发育研究进展第15-18页
     ·栓菌的应用价值第15-16页
     ·栓菌的形态学描述第16页
     ·栓菌属菌物的分子系统学研究进展第16-18页
2 基于ITS序列及其二级结构对栓菌及其近缘属菌物进行系统发育分析第18-36页
   ·材料第18-20页
     ·供试菌株第18-19页
     ·菌种培养基及配方第19页
     ·生化试剂第19页
     ·主要试剂及配制方法第19-20页
     ·主要实验仪器第20页
   ·试验方法第20-24页
     ·菌种的保藏第20页
     ·菌体的培养、收集及预处理第20-21页
     ·菌体总DNA的提取第21页
     ·PCR扩增的引物、反应体系及步骤第21-22页
     ·PCR扩增产物的回收与纯化第22页
     ·目的片段的克隆第22-24页
     ·目的基因片段的测序及序列分析第24页
   ·结果与分析第24-32页
     ·ITS序列分析第24-26页
     ·栓菌及其近缘菌的系统发育分析第26-29页
     ·ITS-1的二级结构构建第29-30页
     ·ITS-2的二级结构构建第30-32页
   ·讨论第32-34页
     ·部分菌物的系统学定位分析第32-33页
     ·利用ITS序列进行系统发育分析的可行性探讨第33页
     ·利用ITS区构建二级结构可行性探讨第33页
     ·对部分菌株定名与实际种名不符的探讨第33-34页
   ·本章小结第34-36页
3 基于mt SSU rDNA基本全长序列及其二级结构对栓菌及其近缘属菌物进行系统发育分析第36-49页
   ·材料第36-37页
     ·供试菌株第36页
     ·菌种培养基及配方第36页
     ·生化试剂第36-37页
     ·实验仪器第37页
   ·试验方法第37-38页
     ·菌种的保藏第37页
     ·菌体的培养、收集及预处理第37页
     ·菌体总DNA的提取第37页
     ·PCR扩增的引物、反应体系及步骤第37页
     ·PCR扩增产物的回收与纯化第37-38页
     ·目的片段的克隆第38页
     ·目的基因片段的测序及序列分析第38页
   ·结果与分析第38-45页
     ·mt SSU rDNA的序列分析第38-39页
     ·基于mt SSU全序列及V4-V6-V9区拼接序列对栓菌及其近缘菌的系统发育分析第39-41页
     ·基于mt SSU rDNA部分序列构建系统发育树第41-43页
     ·V4区的二级结构构建第43页
     ·V6区的二级结构构建第43-44页
     ·V9区的二级结构构建第44-45页
   ·讨论第45-47页
     ·基于系统树对部分菌物的系统发育分析第45-46页
     ·可变区序列与二级结构分析第46-47页
   ·本章小结第47-49页
结论第49-50页
参考文献第50-54页
附录第54-67页
攻读学位期间发表的学术论文第67-68页
致谢第68-69页

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