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人肝脏特异性microRNA-122受转录因子FOXO1调控及其机制研究

目录第1-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-12页
前言第12-26页
 1. microRNA的上游转录调控是其整个调控网络的重要组成部分第12页
 2. miR-122是一个肝脏特异性高表达的小RNA第12-18页
   ·miR-122来源于hcr基因转录本并在物种间具有高度进化保守性第13-15页
   ·miR-122参与肝脏的分化发育和代谢的精细调控过程第15-18页
 3. Fox01是参与代谢调节的重要转录因子第18-25页
   ·FoxO转录因子蛋白家族的组成和结构特点第18-20页
   ·FoxO蛋白主要是作为核内的转录因子行使对靶基因的调控功能第20-23页
   ·FoxO蛋白的核定位受P13K/Akt等通路调控第23-24页
   ·Fox01在维系机体代谢平衡的稳态中起关键作用第24-25页
 4. 本课题研究的理论问题与实验设计第25-26页
材料与方法第26-46页
 1. 实验材料第26-29页
   ·菌株与质粒第26页
   ·细胞系第26页
   ·转染试剂第26页
   ·蛋白酶抑制剂第26-27页
   ·限制性内切酶及其他修饰酶第27页
   ·抗体第27页
   ·其它主要试剂第27页
   ·引物合成第27-28页
   ·主要仪器设备第28-29页
 2. 实验方法第29页
   ·本实验的实验流程图第29页
   ·生物信息学分析第29页
   ·细菌操作与质粒的转化提取第29-31页
     ·感受态大肠杆菌DH5α制备第29-30页
     ·质粒的转化第30页
     ·质粒的提取和纯化第30-31页
   ·细胞培养第31-32页
     ·细胞生长条件第31页
     ·细胞传代第31-32页
     ·细胞的复苏和冻存第32页
   ·非病毒方法介导的哺乳动物细胞转染第32页
   ·逆转录病毒的包装与转导第32-34页
     ·载体构建第32-33页
     ·阳离子转染试剂转染293T细胞第33-34页
     ·逆转录病毒上清收集及冻存第34页
     ·逆转录病毒转导靶细胞第34页
   ·逆转录病毒感染后细胞的筛选和混合克隆的获得第34-35页
     ·筛选药物的配制第34页
     ·混合克隆细胞株的获得第34-35页
   ·半定量和定量RT-PCR第35-36页
     ·细胞总RNA的提取第35页
     ·cDNA第一链的合成第35页
     ·RT-PCR检测第35-36页
     ·Real-time PCR检测第36页
   ·Western Blot分析第36-40页
     ·裂解细胞第36页
     ·蛋白质浓度测定第36-37页
       ·BCA法测定蛋白质浓度的实验原理第36-37页
       ·实验步骤第37页
     ·SDS-PAGE第37页
     ·转膜第37-38页
     ·抗原抗体反应第38页
     ·辣根过氧化物酶化学发光法第38-39页
     ·Western Blot所用的各种溶液第39-40页
   ·双荧光素酶报告基因系统检测第40页
     ·细胞的转染第40页
     ·荧光测定第40页
   ·EMSA第40-43页
     ·核蛋白提取第40-41页
     ·生物素标记探针第41页
     ·PAGE电泳转膜第41-42页
     ·杂交及显影第42页
     ·溶液配制第42-43页
   ·染色质免疫沉淀分析(Chromatin Immunoprecipitation assay,ChIP)第43-46页
     ·固定细胞第43页
     ·全细胞抽提物(whole-cell extract,WCE)的获得第43-44页
     ·免疫沉淀第44页
     ·DNA的分离及纯化第44页
     ·PCR定量分析第44-45页
     ·ChIP实验中所用的各种溶液第45-46页
实验结果第46-67页
 1. 通过生物信息学分析预测FOXO1在miR-122核心启动子区存在一个保守的结合位点第46-51页
   ·UCSC Genome Bioinformatics分析第46-47页
   ·ECR Browser保守性分析第47-48页
   ·rVista 2.0预测转录因子结合位点(TFBS)第48-51页
 2. FOXO1野生型蛋白和突变型蛋白对miR-122的转录调控作用是相反的第51-56页
   ·瞬时转染FOXO1-WT上调miR-122的转录而FOXO1-CA下调其转录第51-54页
     ·FOXO1系列表达质粒在Huh7细胞中的有效性鉴定第51-52页
     ·瞬时转染FOXO1质粒后对miR-122转录的影响第52-53页
     ·不同浓度的insulin对瞬时转染FOXO1质粒后miR-122转录的影响第53-54页
   ·稳定转染FOXO1对miR-122转录的影响与瞬时转染效果一致第54-56页
 3. FOX01通过miR-122核心启动子区的IRE元件调控miR-122的转录第56-59页
   ·通过截短实验来聚焦FOXO1在miR-122上游的相应顺式调控区域第56-58页
   ·通过突变实验来精确定位FOXO1在miR-122核心启动子区内的作用位点第58-59页
 4. FOXO1可结合于miR-122核心启动子区IRE元件第59-67页
   ·FOXO1在体外实验中直接结合于miR-122核心启动子区IRE元件第60-62页
   ·营养状态改变的情况下FOXO1动态结合于miR-122上游的核心启动子区第62-64页
   ·FOXO1和HNF4在miR-122核心promoter区上相同区域的结合呈互逆状态第64-67页
讨论第67-79页
 1. FOXO1的核定位调节对miR-122转录调控作用的影响第67-70页
 2. FOXO1和HNF4调控miR-122转录的模式第70-76页
   ·FOXO1与HNF4的不同组合模式在调控其它代谢相关基因中的表现第71-73页
   ·FOXO蛋白与许多核激素受体家族成员间的相互作用影响两者转录活性第73-74页
   ·FOXO1与HNF4在miR-122核心启动子区竞争结合第74-76页
 3. FOXO1对miR-122转录的调控受营养状态的调节第76-77页
 4. 本研究的不足及展望第77-79页
小结第79-80页
参考文献第80-87页
非论文综述第87-106页
 Reference第99-106页
致谢第106-107页
个人简历第107-109页

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