| 目录 | 第1-5页 |
| 缩略词表 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 前言 | 第12-14页 |
| 第一章 大规模质谱数据处理 | 第14-39页 |
| 1 实验数据集 | 第14-15页 |
| 2 方法与步骤 | 第15-32页 |
| ·鉴定结果处理 | 第15-22页 |
| ·SEQUEST PFF鉴定结果和图谱的处理 | 第15-20页 |
| ·Mascot PFF鉴定结果和图谱的处理 | 第20-21页 |
| ·Mascot PMF Combine鉴定结果和图谱的处理 | 第21-22页 |
| ·蛋白质列表文件 | 第22页 |
| ·蛋白质注释信息的获取 | 第22-28页 |
| ·BLAST序列相似性比对服务实现 | 第28-32页 |
| ·SSH下载与安装 | 第29页 |
| ·Web BLAST下载与安装 | 第29-30页 |
| ·库文件上传 | 第30-31页 |
| ·Web BLAST配置 | 第31-32页 |
| ·权限设置与BLAST服务器重启 | 第32页 |
| 3 结果 | 第32-36页 |
| 4 讨论 | 第36-39页 |
| ·二进制图谱文件转换成可读文件时失败 | 第36-37页 |
| ·不同项目鉴定结果对应的数据格式不同 | 第37-38页 |
| ·对实验人员提出的要求 | 第37页 |
| ·对生物信息人员提供的要求 | 第37-38页 |
| ·pkl图谱文件格式不规范 | 第38页 |
| ·蛋白质序列比对 | 第38-39页 |
| 第二章 质谱数据处理平台构建 | 第39-46页 |
| 1 材料与方法 | 第39-40页 |
| ·系统开发及运行环境 | 第39-40页 |
| ·系统结构 | 第40页 |
| 2 系统功能 | 第40-45页 |
| ·格式转换模块 | 第41页 |
| ·SEQUEST PFF鉴定结果和图谱处理模块 | 第41-42页 |
| ·Mascot PFF鉴定结果和图谱处理模块 | 第42页 |
| ·Mascot PMF Combine鉴定结果和图谱处理模块 | 第42-43页 |
| ·蛋白质列表功能 | 第43页 |
| ·蛋白质注释模块 | 第43-44页 |
| ·其它功能 | 第44-45页 |
| 3 系统应用 | 第45页 |
| ·实验数据集 | 第45页 |
| ·功能模块 | 第45页 |
| 4 结果与讨论 | 第45-46页 |
| 第三章 人类肝脏蛋白质组数据库应用系统研发 | 第46-51页 |
| 1 材料与方法 | 第46-47页 |
| ·系统开发及运行环境 | 第46页 |
| ·数据来源 | 第46-47页 |
| 2 系统结构与功能 | 第47-50页 |
| ·系统结构 | 第47页 |
| ·系统功能 | 第47-50页 |
| ·蛋白质功能检索 | 第48页 |
| ·关键词检索 | 第48页 |
| ·蛋白质注释 | 第48-49页 |
| ·外部导航 | 第49-50页 |
| 3 结论与展望 | 第50-51页 |
| 全文总结及展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-55页 |
| 附录一 蛋白质注释信息相关文件来源 | 第55-56页 |
| 附录二 运行环境及环境变量设置 | 第56-57页 |
| 综述 | 第57-67页 |
| 1 Web Services概述 | 第57-59页 |
| 2 Web Services在生物信息研究中的应用 | 第59-65页 |
| 3 难点及发展趋势 | 第65页 |
| 4 结束语 | 第65页 |
| 5 参考文献 | 第65-67页 |
| 论著 | 第67-75页 |
| 1 材料与方法 | 第68-71页 |
| 2 系统功能 | 第71-74页 |
| 3 结论及发展趋势 | 第74页 |
| 参考文献 | 第74-75页 |
| 个人简历 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
