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超氧化物歧化酶构象及与小分子相互作用的质谱研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-9页
第1章 前言第14-41页
    1.1 超氧化物歧化酶与肌萎缩侧索硬化症第14-22页
        1.1.1 铜锌超氧化物歧化酶第14-17页
        1.1.2 肌萎缩侧索硬化症第17页
        1.1.3 SOD1与肌萎缩侧索硬化症第17-19页
        1.1.4 异常SOD1可能的致病机制第19-22页
    1.2 基于质谱方法的结构生物学研究第22-31页
        1.2.1 电喷雾质谱原理第23-25页
        1.2.2 天然电喷雾质谱第25-29页
        1.2.3 常见的研究结构生物学的质谱方法第29-31页
    1.3 基于离子淌度质谱方法的结构生物学研究第31-35页
        1.3.1 离子淌度的基本要素第31-33页
        1.3.2 IMS技术分类第33-35页
    1.4 天然电喷雾离子淌度质谱的应用第35-40页
    1.5 本论文研究的内容和目的第40-41页
第2章 超氧化物歧化酶及其不成熟形式的稳定性比较第41-56页
    2.1 引言第41-42页
    2.2 实验部分第42-46页
        2.2.1 实验材料第42页
        2.2.2 样品制备第42-43页
        2.2.3 质谱实验第43-44页
        2.2.4 行波离子淌度采集第44-45页
        2.2.5 数据处理第45-46页
    2.3 结果与讨论第46-55页
        2.3.1 SOD1及apo-SOD1的质谱表征第46-47页
        2.3.2 SOD1及apo-SOD1碰撞截面积的计算第47-49页
        2.3.3 CID比较SOD1和apo-SOD1的结构稳定性第49-51页
        2.3.4 CIU比较SOD1和apo-SOD1的构型变化第51-53页
        2.3.5 DTT诱导SOD1和apo-SOD1的结构变化第53-55页
    2.4 本章小结第55-56页
第3章 非质子极性溶剂对超氧化物歧化酶结构稳定性的研究第56-73页
    3.1 引言第56-58页
    3.2 实验部分第58-59页
        3.2.1 实验材料第58页
        3.2.2 样品准备第58页
        3.2.3 质谱实验第58-59页
        3.2.4 数据处理第59页
    3.3 结果与讨论第59-71页
        3.3.1 五种非质子极性溶剂对蛋白带电荷和解离的影响第59-64页
        3.3.2 DMF有助于减少apo-SOD1在源内的碰撞诱导解离第64-65页
        3.3.3 DMF能够减少酸诱导的蛋白解离和去折叠第65-67页
        3.3.4 CIU评估DMF对蛋白构型的影响第67-71页
        3.3.5 CCS评估DMF对蛋白结构的影响第71页
    3.4 本章小结第71-73页
第4章 5-氟尿苷与超氧化物歧化酶的相互作用第73-83页
    4.1 引言第73页
    4.2 实验部分第73-75页
        4.2.1 实验材料第73-74页
        4.2.2 样品制备第74页
        4.2.3 质谱实验第74-75页
        4.2.4 ThT荧光光谱实验第75页
        4.2.5 内源性荧光光谱实验第75页
    4.3 结果与讨论第75-82页
        4.3.1 SOD1与5-Furd的相互作用的ESI-MS第76页
        4.3.2 5-Furd与SOD1相互作用的M-MS第76-78页
        4.3.3 5-Furd对SOD1荧光的淬灭机制第78-81页
        4.3.4 5-Furd对apo-SOD1体外聚集的影响第81-82页
    4.4 本章小结第82-83页
第5章 茶多酚类化合物与超氧化物歧化酶的相互作用第83-101页
    5.1 引言第83-85页
    5.2 实验部分第85-88页
        5.2.1 实验材料第85页
        5.2.2 样品制备第85-86页
        5.2.3 质谱实验第86页
        5.2.4 ThT外源荧光聚集动力学实验第86-87页
        5.2.5 ANS外源荧光实验第87页
        5.2.6 圆二色谱实验第87页
        5.2.7 细胞培养及MTT法检测细胞活力实验第87-88页
    5.3 结果与讨论第88-100页
        5.3.1 儿茶素配体与SOD1的键合亲和力分析第88-92页
        5.3.2 ESI-MS/MS比较儿茶素-SOD1复合物气相稳定性第92-93页
        5.3.3 Vc_(50)及竞争性结合实验第93-95页
        5.3.4 CIU考察EGCG对SOD1构型的影响第95-97页
        5.3.5 ThT荧光法检测EGCG对apo-SOD1聚集的影响第97-98页
        5.3.6 ANS荧光法检测EGCG对apo-SOD1聚集时疏水区暴露的影响第98-99页
        5.3.7 CD法检测EGCG对apo-SOD1纤维化二级结构的影响第99页
        5.3.8 EGCG对SOD1聚集物诱导PC12细胞毒性的抑制作用第99-100页
    5.4 本章小结第100-101页
第6章 咖啡酰奎宁酸类化合物与超氧化物歧化酶的相互作用第101-121页
    6.1 引言第101-102页
    6.2 实验部分第102-104页
        6.2.1 实验材料第102页
        6.2.2 样品制备第102-103页
        6.2.3 ESI-MS及ESI-MS/MS实验第103页
        6.2.4 ESI-IM-MS实验第103-104页
    6.3 结果与讨论第104-120页
        6.3.1 咖啡酰奎宁酸类化合物与apo-SOD1的ESI-MS分析第104-105页
        6.3.2 咖啡酰奎宁酸类化合物与apo-SOD1的ESI-MS/MS分析第105-107页
        6.3.3 同分异构体与apo-SOD1键合亲和性比较第107-119页
        6.3.4 二咖啡酰奎宁酸对apo-SOD1构型的影响第119-120页
    6.4 本章小结第120-121页
第7章 黄烷酮类化合物与超氧化物歧化酶的相互作用第121-131页
    7.1 引言第121-122页
    7.2 实验部分第122-123页
        7.2.1 实验材料第122页
        7.2.2 样品制备第122-123页
        7.2.3 质谱及荧光实验第123页
    7.3 结果与讨论第123-129页
        7.3.1 黄烷酮类化合物与apo-SOD1键合亲和力比较第124-126页
        7.3.2 黄烷酮类化合物与apo-SOD1复合物的MS/MS第126-127页
        7.3.3 黄烷酮类化合物对apo-SOD1体外聚集的影响第127-128页
        7.3.4 芹糖甘草苷对apo-SOD1构型的影响第128-129页
    7.4 本章小结第129-131页
第8章 结论与展望第131-134页
    8.1 主要结论第131-132页
    8.2 创新及展望第132-134页
参考文献第134-156页
附录第156-160页
个人简历第160-162页
致谢第162-164页
硕博连读期间发表的学术论文第164页

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