摘要 | 第10-12页 |
ABSTRACT | 第12-13页 |
第1章 绪论 | 第14-27页 |
1.1 植物盐胁迫响应的机制 | 第15-18页 |
1.1.1 离子区域化 | 第15-16页 |
1.1.2 渗透保护物质的合成 | 第16页 |
1.1.3 激素调节 | 第16-17页 |
1.1.4 转录水平调控 | 第17-18页 |
1.2 植物mRNA选择性多聚腺苷化研究进展 | 第18-21页 |
1.2.1 多聚腺苷化与选择性多聚腺苷化 | 第18-20页 |
1.2.2 选择性多聚腺苷化与植物氧化胁迫 | 第20-21页 |
1.2.3 选择性多聚腺苷化与植物盐胁迫 | 第21页 |
1.3 拟南芥与盐芥的比较研究 | 第21-24页 |
1.3.1 拟南芥与盐芥进化上的关系 | 第21-22页 |
1.3.2 拟南芥与盐芥对比研究进展 | 第22-24页 |
1.4 研究内容与意义 | 第24-27页 |
1.4.1 研究内容 | 第24-25页 |
1.4.2 研究意义 | 第25页 |
1.4.3 技术路线 | 第25-27页 |
第2章 选择性多聚腺苷化对拟南芥盐胁迫响应的影响 | 第27-57页 |
2.1 材料与方法 | 第27-35页 |
2.1.1 拟南芥的培养 | 第27页 |
2.1.2 拟南芥样品总RNA的提取 | 第27-28页 |
2.1.3 拟南芥样品PAT-seq文库的构建 | 第28-31页 |
2.1.4 拟南芥样品文库质量的检测 | 第31-32页 |
2.1.5 拟南芥样品的测序 | 第32页 |
2.1.6 拟南芥盐胁迫条件下poly(A)位点的发掘 | 第32-33页 |
2.1.7 拟南芥盐处理的poly(A)位点表达模式分析 | 第33页 |
2.1.8 拟南芥基因功能富集分析 | 第33页 |
2.1.9 拟南芥样品poly(A)位点上下游单核苷酸的组成 | 第33-34页 |
2.1.10 拟南芥盐处理APA基因poly(A)位点变化分析 | 第34-35页 |
2.2 结果 | 第35-53页 |
2.2.1 拟南芥RNA和文库的检测及测序结果 | 第35-39页 |
2.2.2 拟南芥poly(A)位点的发掘 | 第39-40页 |
2.2.3 拟南芥poly(A)位点在基因组上的分布 | 第40-41页 |
2.2.4 拟南芥盐处理poly(A)位点的表达模式特征 | 第41-42页 |
2.2.5 拟南芥盐处理DE-PAC基因的GO分析 | 第42-43页 |
2.2.6 拟南芥盐处理DE-PAC基因的KEGG分析 | 第43-44页 |
2.2.7 拟南芥盐处理DE基因的GO分析 | 第44-45页 |
2.2.8 拟南芥盐处理DE-PAC基因、DE-APA基因与DE基因关系分析 | 第45-46页 |
2.2.9 拟南芥APA基因盐处理poly(A)位点变化分析 | 第46-50页 |
2.2.10 拟南芥盐处理特异表达的PAC分析 | 第50页 |
2.2.11 拟南芥盐处理poly(A)位点上下游单核苷酸的分布及多聚腺苷化因子的表达 | 第50-53页 |
2.3 讨论 | 第53-57页 |
第3章 选择性多聚腺苷化对盐芥盐胁迫响应的影响 | 第57-80页 |
3.1 材料与方法 | 第57-60页 |
3.1.1 盐芥的培养 | 第57-58页 |
3.1.2 盐芥样品总RNA的提取 | 第58页 |
3.1.3 盐芥样品PAT-seq文库的构建 | 第58页 |
3.1.4 盐芥样品文库质量的检测 | 第58页 |
3.1.5 盐芥样品的测序 | 第58页 |
3.1.6 盐芥盐胁迫条件下poly(A)位点的发掘 | 第58-59页 |
3.1.7 盐芥盐处理的poly(A)位点表达模式分析 | 第59页 |
3.1.8 盐芥基因功能富集分析 | 第59-60页 |
3.1.9 盐芥样品poly(A)位点上下游单核苷酸的组成 | 第60页 |
3.1.10 盐芥盐处理APA基因poly(A)位点变化分析 | 第60页 |
3.2 结果 | 第60-77页 |
3.2.1 拟南芥与盐芥盐胁迫条件下的生长表型 | 第60-61页 |
3.2.2 盐芥RNA和文库的检测及测序结果 | 第61-65页 |
3.2.3 盐芥poly(A)位点的发掘 | 第65-66页 |
3.2.4 盐芥盐处理poly(A)位点的表达模式特征 | 第66-67页 |
3.2.5 盐芥盐处理DE-PAC基因的GO分析 | 第67-68页 |
3.2.6 盐芥盐处理DE-PAC基因的KEGG分析 | 第68-69页 |
3.2.7 盐芥盐处理DE基因的GO分析 | 第69-70页 |
3.2.8 盐芥盐处理DE-PAC基因、DE-APA基因与DE基因的关系分析 | 第70-71页 |
3.2.9 盐芥盐处理特异表达PAC基因的分析 | 第71-72页 |
3.2.10 盐芥盐处理poly(A)位点变化分析 | 第72-74页 |
3.2.11 盐芥盐处理poly(A)位点上下游单核苷酸的组成 | 第74-77页 |
3.3 讨论 | 第77-80页 |
第4章 结论 | 第80-82页 |
参考文献 | 第82-90页 |
致谢 | 第90-91页 |
攻读硕士学位期间发表的论文 | 第91页 |