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急性脑梗死全基因组甲基化差异及功能分析

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 绪论第11-19页
    一、急性脑梗死与DNA甲基化第11-16页
        1.1 急性脑梗死第11页
        1.2 DNA甲基化与脑血管疾病第11-13页
        1.3 DNA甲基化与脑血管疾病的危险因素关系第13-16页
    二、DNA甲基化的检测方法第16-18页
        2.1 高通量DNA甲基化检测方法第16页
        2.2 Mass ARRAY Epi TYPER DNA甲基化检测第16-18页
    三、生物信息学功能分析第18-19页
        3.1 基因本体论(Gene Ontology)分析第18页
        3.2 京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析第18-19页
第二章 Illumina Human Methylation450 Bead Chip芯片的急性脑梗死甲基化差异分析第19-45页
    一、引言第19-20页
    二、实验材料与方法第20-28页
        2.1 研究对象及血样收集第20页
        2.2 仪器与试剂第20-22页
        2.3 样品准备第22-23页
        2.4 Illumina Human Methylation450 Bead Chip芯片处理及检测第23-28页
        2.5 GO和KEGG pathway功能富集分析第28页
    三、实验结果第28-43页
        3.1 临床资料第28-29页
        3.2 Infinium Human Methylation450 Bead Chip芯片结果第29页
        3.3 差异甲基化位点分析第29-30页
        3.4 差异甲基化位点功能分析第30-43页
    四、讨论第43-45页
第三章 PTPRN2在急性脑梗死患者中DNA甲基化水平的变化及临床意义第45-53页
    一、引言第45页
    二、实验材料和方法第45-50页
        2.1 研究对象与标本收集第45-46页
        2.2 实验试剂和仪器第46-47页
        2.3 抽提样本DNA及亚硫酸盐处理:方法同第二章 2.3 和 2.4 小节第47页
        2.4 针对PTPRN2基因甲基化聚集区Cp G位点设计引物第47-48页
        2.5 PCR扩增第48页
        2.6 虾碱性磷酸酶(SAP)反应第48-49页
        2.7 T Cleavage Transcription反应第49页
        2.8 质谱检测并分析报告第49页
        2.9 统计学方法第49-50页
    三、结果第50-51页
    四、讨论第51-53页
第四章 结论与展望第53-54页
    4.1 结论第53页
    4.2 展望第53-54页
参考文献第54-60页
综述第60-71页
    参考文献第66-71页
在学期间发表的学术论文及其他科研成果第71-72页
致谢第72-73页
附录第73-98页

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