| 摘要 | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-19页 |
| 1.1 斑鸠菊的概述 | 第9-11页 |
| 1.1.1 斑鸠菊的生物学特征 | 第9页 |
| 1.1.2 斑鸠菊酸的应用前景 | 第9-11页 |
| 1.2 植物油脂与工业用珍稀脂肪酸 | 第11页 |
| 1.3 植物油脂代谢研究进展 | 第11-13页 |
| 1.3.1 植物油脂积累的生物学过程 | 第11-13页 |
| 1.3.2 斑鸠菊酸积累的生物学过程 | 第13页 |
| 1.4 参与斑鸠菊酸积累的关键酶 | 第13-15页 |
| 1.4.1 环氧化酶(Epoxygenase) | 第13-14页 |
| 1.4.2 二酰甘油酰基转移酶(DGAT) | 第14-15页 |
| 1.4.3 磷脂: 甘油二酰基转移酶(PDAT) | 第15页 |
| 1.5 RNA-Seq技术的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.6 植物NBS类抗病基因的研究现状 | 第16-17页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第17-19页 |
| 第二章 斑鸠菊油脂代谢相关基因的鉴定 | 第19-42页 |
| 2.1 试验材料 | 第19页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第19页 |
| 2.1.2 试验试剂与设备 | 第19页 |
| 2.2 试验方法 | 第19-21页 |
| 2.2.1 试验材料总RNA的提取 | 第19-20页 |
| 2.2.2 斑鸠菊总RNA的质量鉴定 | 第20页 |
| 2.2.3 转录组文库的构建 | 第20-21页 |
| 2.3 转录组数据的组装 | 第21-24页 |
| 2.3.1 原始数据质量控制 | 第21页 |
| 2.3.2 转录本的de novo拼接 | 第21-22页 |
| 2.3.3 Unigene的功能注释 | 第22页 |
| 2.3.4 CDS的预测 | 第22页 |
| 2.3.5 基因表达量的计算 | 第22页 |
| 2.3.6 差异表达基因的鉴定及功能富集分析 | 第22-23页 |
| 2.3.7 差异表达基因的验证 | 第23-24页 |
| 2.4 结果与分析 | 第24-40页 |
| 2.4.1 RNA的质量检测 | 第24页 |
| 2.4.2 测序数据的质量统计 | 第24-26页 |
| 2.4.3 Unigene的组装结果 | 第26-27页 |
| 2.4.4 Unigene的功能注释 | 第27-33页 |
| 2.4.5 斑鸠菊三个发育时期的种子差异表达基因分析 | 第33-35页 |
| 2.4.6 斑鸠菊Unigene的油脂代谢通路分析 | 第35-39页 |
| 2.4.7 斑鸠菊转录组中环氧型脂肪酸相关基因的鉴定 | 第39页 |
| 2.4.8 实时荧光定量PCR结果验证 | 第39-40页 |
| 2.5 讨论 | 第40-42页 |
| 2.5.1 斑鸠菊的转录组测序 | 第40页 |
| 2.5.2 斑鸠菊Unigene的功能注释 | 第40-41页 |
| 2.5.3 斑鸠菊的油脂代谢 | 第41-42页 |
| 第三章 亚麻荠NBS类基因的鉴定与分析 | 第42-49页 |
| 3.1 分析数据 | 第42页 |
| 3.2 试验方法 | 第42-43页 |
| 3.2.1 NBS类基因的获得与分类 | 第42页 |
| 3.2.2 染色体定位与基因簇分析 | 第42页 |
| 3.2.3 亚麻荠NBS类基因的系统发生树分析 | 第42-43页 |
| 3.3 结果与分析 | 第43-46页 |
| 3.3.1 亚麻荠NBS类基因的分类 | 第43页 |
| 3.3.2 亚麻荠NBS类蛋白的其它结构域 | 第43页 |
| 3.3.3 亚麻荠NBS类基因的染色体定位 | 第43-46页 |
| 3.3.4 亚麻荠NBS类抗病基因的系统发育分析 | 第46页 |
| 3.4 讨论 | 第46-49页 |
| 第四章 全文结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| Abstract | 第57-58页 |
| 研究生期间发表论文 | 第59-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
