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病原体核酸检测新技术的建立及应用

摘要第5-8页
Abstract第8-12页
第一章 绪论第16-32页
    1.1 论文的研究背景及意义第16-18页
    1.2 国内外相关工作研究现状第18-28页
        1.2.1 一步法巢式PCR方法的研宄现状第18-19页
        1.2.2 基因芯片技术的研究现状第19-23页
        1.2.3 纳米孔测序技术在病原体核酸检测领域的应用现状第23-28页
    1.3 论文拟解决的科学问题第28-29页
    1.4 论文的研究内容第29-32页
第二章 基于锁核酸技术的一步法巢式PCR第32-64页
    2.1 引言第32-37页
    2.2 材料与方法第37-44页
        2.2.1 参考毒株与临床样本第37-38页
        2.2.2 标准品的制备第38-39页
        2.2.3 LNA-OSN-PCR方法的建立第39-42页
        2.2.4 LNA-OSN-PCR实验室检测能力评价第42-43页
        2.2.5 LNA-OSN-PCR临床诊断能力评价第43-44页
    2.3 结果与讨论第44-61页
        2.3.1 LNA对引物性能的影响第44-49页
        2.3.2 LNA-ONS-PCR的实验室检测能力第49-56页
        2.3.3 LNA-ONS-PCR的临床诊断能力第56页
        2.3.4 LNA能克服既有OSN-PCR策略的绝大多数缺陷第56-59页
        2.3.5 LNA-OSN-PCR策略的普适性第59-61页
    2.4 本章小结第61-64页
第三章 中枢神经系统感染病原体再测序芯片方法的建立与应用第64-96页
    3.1 引言第64-68页
    3.2 材料与方法第68-76页
        3.2.1 参考毒株与临床样本第68页
        3.2.2 总核酸提取第68-69页
        3.2.3 RPM-IVDC4的引物设计与分组第69-70页
        3.2.4 逆转录与多重PCR第70-72页
        3.2.5 PCR产物纯化、片段化与加标记第72-74页
        3.2.6 洗染、扫描与结果分析第74-75页
        3.2.7 RPM实验室检测能力评价第75-76页
        3.2.8 RPM临床诊断能力评价第76页
    3.3 结果与讨论第76-93页
        3.3.1 RPM-IVDC4病原体检测范围第76-81页
        3.3.2 RPM-IYDC4的实验室检测能力第81-86页
        3.3.3 RPM-IYDC4的临床诊断能力第86-89页
        3.3.4 基因芯片相对于低通量核酸检测方法的优势第89-91页
        3.3.5 基因芯片的缺陷与发展趋势第91-93页
    3.4 本章小结第93-96页
第四章 纳米孔测序技术平台的建立与应用第96-132页
    4.1 弓丨胃第96-99页
    4.2 材料与方法第99-109页
        4.2.1 参考毒株和与临床样本第99-101页
        4.2.2 MinlON文库制备方法第101-106页
        4.2.3 MinlON文库上机方法第106-108页
        4.2.4 测序芯片清洗与重复使用第108-109页
        4.2.5 MinlON测序数据分析第109页
    4.3 结果与讨论第109-130页
        4.3.1 扩增子测序中MinlON的数据质量第109-111页
        4.3.2 扩增子测序中MinlON的准确性第111-113页
        4.3.3 由基因组覆盖度所引发的思考第113-118页
        4.3.4 测序芯片的寿命及重复使用第118-120页
        4.3.5 MinlON的测序效率及运行时间第120-124页
        4.3.6 用MinlON直接从临床样本中实施病原体检测第124-130页
    4.4 本章小结第130-132页
第五章 总结第132-136页
    5.1 全文总结第132-133页
    5.2 思考与展望第133-134页
    5.3 创新点第134-136页
参考文献第136-150页
致谢第150-152页
附录:个人简历第152-155页

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