摘要 | 第5-8页 |
Abstract | 第8-12页 |
第一章 绪论 | 第16-32页 |
1.1 论文的研究背景及意义 | 第16-18页 |
1.2 国内外相关工作研究现状 | 第18-28页 |
1.2.1 一步法巢式PCR方法的研宄现状 | 第18-19页 |
1.2.2 基因芯片技术的研究现状 | 第19-23页 |
1.2.3 纳米孔测序技术在病原体核酸检测领域的应用现状 | 第23-28页 |
1.3 论文拟解决的科学问题 | 第28-29页 |
1.4 论文的研究内容 | 第29-32页 |
第二章 基于锁核酸技术的一步法巢式PCR | 第32-64页 |
2.1 引言 | 第32-37页 |
2.2 材料与方法 | 第37-44页 |
2.2.1 参考毒株与临床样本 | 第37-38页 |
2.2.2 标准品的制备 | 第38-39页 |
2.2.3 LNA-OSN-PCR方法的建立 | 第39-42页 |
2.2.4 LNA-OSN-PCR实验室检测能力评价 | 第42-43页 |
2.2.5 LNA-OSN-PCR临床诊断能力评价 | 第43-44页 |
2.3 结果与讨论 | 第44-61页 |
2.3.1 LNA对引物性能的影响 | 第44-49页 |
2.3.2 LNA-ONS-PCR的实验室检测能力 | 第49-56页 |
2.3.3 LNA-ONS-PCR的临床诊断能力 | 第56页 |
2.3.4 LNA能克服既有OSN-PCR策略的绝大多数缺陷 | 第56-59页 |
2.3.5 LNA-OSN-PCR策略的普适性 | 第59-61页 |
2.4 本章小结 | 第61-64页 |
第三章 中枢神经系统感染病原体再测序芯片方法的建立与应用 | 第64-96页 |
3.1 引言 | 第64-68页 |
3.2 材料与方法 | 第68-76页 |
3.2.1 参考毒株与临床样本 | 第68页 |
3.2.2 总核酸提取 | 第68-69页 |
3.2.3 RPM-IVDC4的引物设计与分组 | 第69-70页 |
3.2.4 逆转录与多重PCR | 第70-72页 |
3.2.5 PCR产物纯化、片段化与加标记 | 第72-74页 |
3.2.6 洗染、扫描与结果分析 | 第74-75页 |
3.2.7 RPM实验室检测能力评价 | 第75-76页 |
3.2.8 RPM临床诊断能力评价 | 第76页 |
3.3 结果与讨论 | 第76-93页 |
3.3.1 RPM-IVDC4病原体检测范围 | 第76-81页 |
3.3.2 RPM-IYDC4的实验室检测能力 | 第81-86页 |
3.3.3 RPM-IYDC4的临床诊断能力 | 第86-89页 |
3.3.4 基因芯片相对于低通量核酸检测方法的优势 | 第89-91页 |
3.3.5 基因芯片的缺陷与发展趋势 | 第91-93页 |
3.4 本章小结 | 第93-96页 |
第四章 纳米孔测序技术平台的建立与应用 | 第96-132页 |
4.1 弓丨胃 | 第96-99页 |
4.2 材料与方法 | 第99-109页 |
4.2.1 参考毒株和与临床样本 | 第99-101页 |
4.2.2 MinlON文库制备方法 | 第101-106页 |
4.2.3 MinlON文库上机方法 | 第106-108页 |
4.2.4 测序芯片清洗与重复使用 | 第108-109页 |
4.2.5 MinlON测序数据分析 | 第109页 |
4.3 结果与讨论 | 第109-130页 |
4.3.1 扩增子测序中MinlON的数据质量 | 第109-111页 |
4.3.2 扩增子测序中MinlON的准确性 | 第111-113页 |
4.3.3 由基因组覆盖度所引发的思考 | 第113-118页 |
4.3.4 测序芯片的寿命及重复使用 | 第118-120页 |
4.3.5 MinlON的测序效率及运行时间 | 第120-124页 |
4.3.6 用MinlON直接从临床样本中实施病原体检测 | 第124-130页 |
4.4 本章小结 | 第130-132页 |
第五章 总结 | 第132-136页 |
5.1 全文总结 | 第132-133页 |
5.2 思考与展望 | 第133-134页 |
5.3 创新点 | 第134-136页 |
参考文献 | 第136-150页 |
致谢 | 第150-152页 |
附录:个人简历 | 第152-155页 |