| 摘要 | 第3-6页 |
| abstract | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-17页 |
| 1.1 引言 | 第13-15页 |
| 1.2 研究背景 | 第15-16页 |
| 1.3 论文结构 | 第16-17页 |
| 第二章 数据和方法 | 第17-21页 |
| 2.1 数据集 | 第17-18页 |
| 2.2 K-mer频谱 | 第18页 |
| 2.3 8-mer的CG二核苷分类 | 第18页 |
| 2.4 三种CG类8-mer频谱分布的相对距离 | 第18-19页 |
| 2.5 三种CG类8-mer频谱分布的保守性 | 第19页 |
| 2.6 mCG模体在序列上的分布 | 第19-20页 |
| 2.7 8-mer模体中x-mer的相对频率 | 第20页 |
| 2.8 新对称相对熵 | 第20-21页 |
| 第三章 CG类模体在基因功能位点区域上的8-mer频谱 | 第21-30页 |
| 3.1 8-mer频谱分布及其规律 | 第21-22页 |
| 3.2 三种CG类8-mer频谱分布的相对距离 | 第22-25页 |
| 3.3 三种CG类8-mer频谱分布的保守性 | 第25-28页 |
| 3.4 小结 | 第28-30页 |
| 第四章 CG类模体在基因功能位点区域上的分布 | 第30-42页 |
| 4.1 转录起始位点 | 第30-31页 |
| 4.2 转录终止位点 | 第31-33页 |
| 4.3 翻译起始位点 | 第33-34页 |
| 4.4 翻译终止位点 | 第34-35页 |
| 4.5 内含子与外显子结合处 | 第35-37页 |
| 4.6 外显子与内含子结合处 | 第37-38页 |
| 4.7 小结 | 第38-42页 |
| 第五章 1CG模体中3-mer在六个功能位点区域上的使用差异 | 第42-53页 |
| 5.1 三种CG类8-mer中x-mer的使用偏好 | 第42-43页 |
| 5.2 人类 | 第43-44页 |
| 5.3 斑马鱼 | 第44-46页 |
| 5.4 拟南芥 | 第46-47页 |
| 5.5 水稻 | 第47-48页 |
| 5.6 蚊子 | 第48-49页 |
| 5.7 蜜蜂 | 第49-51页 |
| 5.8 小结 | 第51-53页 |
| 第六章 总结与展望 | 第53-56页 |
| 6.1 全文工作总结 | 第53-54页 |
| 6.2 工作展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 附录 | 第60-69页 |
| 附录1 CG类模体在其它基因功能位点区域上的8-mer频谱 | 第60-63页 |
| 附录2 六个物种CG类8-mer频谱的最概然频次与相对距离 | 第63-66页 |
| 附录3 六个物种CG类8-mer频谱的标准差与保守性 | 第66-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
