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PEDV感染介导Vero E6细胞差异表达磷酸化蛋白筛选及功能解析

中文摘要第10-11页
英文摘要第11-12页
1 文献综述第13-29页
    1.1 猪流行性腹泻概述第13-16页
        1.1.1 PED的流行第13-14页
        1.1.2 PED的诊断第14-15页
        1.1.3 PED的预防第15页
        1.1.4 PED的治疗第15-16页
    1.2 猪流行性腹泻病毒概述第16-20页
        1.2.1 PEDV病毒学分类地位第16-17页
        1.2.2 PEDV基因组结构第17-18页
        1.2.3 PEDV编码的蛋白及功能第18-19页
        1.2.4 PEDV的感染发生机制第19-20页
    1.3 蛋白质组学技术第20-23页
        1.3.1 蛋白质组学第20页
        1.3.2 蛋白质组学在病毒学中的应用第20-21页
        1.3.3 同位素标记相对与绝对定量(iTRAQ)技术第21-23页
    1.4 磷酸化蛋白质组学技术第23-27页
        1.4.1 蛋白质磷酸化的概况第23页
        1.4.2 磷酸化蛋白样品的分离富集第23-25页
        1.4.3 磷酸化蛋白位点鉴定与分析第25页
        1.4.4 磷酸化蛋白质组学在病毒感染中的应用第25-27页
    1.5 猪流行性腹泻感染相关蛋白研究进展第27页
    1.6 本研究的目的意义第27-29页
2 VeroE6细胞感染PEDV样品制备第29-37页
    2.1 试验材料第29-30页
        2.1.1 病毒与细胞第29页
        2.1.2 主要生化试剂第29页
        2.1.3 主要仪器设备第29-30页
    2.2 试验方法第30-32页
        2.2.1 VeroE6细胞的培养第30页
        2.2.2 Vero E6细胞样品制备第30-32页
    2.3 结果与分析第32-33页
        2.3.1 PEDV感染VeroE6细胞样品的制备第32-33页
        2.3.2 蛋白质浓度测定结果第33页
        2.3.3 Westernblot鉴定PEDV感染VeroE6细胞第33页
    2.4 讨论第33-35页
    2.5 小结第35-37页
3 基于iTRAQ技术的VeroE6细胞差异表达磷酸化蛋白质组学研究第37-71页
    3.1 试验材料第37页
        3.1.1 主要生化试剂第37页
        3.1.2 主要仪器设备第37页
    3.2 试验方法第37-42页
        3.2.1 酶解和肽段定量第37-38页
        3.2.2 肽段标记第38页
        3.2.3 二氧化钛富集第38页
        3.2.4 质谱分析第38-39页
        3.2.5 蛋白质鉴定与分析第39-40页
        3.2.6 验证差异表达蛋白第40页
        3.2.7 验证样品中Hsp70的表达第40页
        3.2.8 细胞样品的制备、RNA的提取及实时荧光定量RT-PCR第40-42页
    3.3 结果与分析第42-65页
        3.3.1 酶解肽段浓度测定第42页
        3.3.2 磷酸化蛋白质鉴定结果统计第42-43页
        3.3.3 定量比值频数分布直方图第43-44页
        3.3.4 差异表达磷酸化蛋白结果第44-56页
        3.3.5 差异表达磷酸化蛋白质分子量分布第56-57页
        3.3.6 差异表达磷酸化蛋白质等电点分布第57页
        3.3.7 生物信息学(GO分析)第57-59页
        3.3.8 差异表达磷酸化蛋白的KEGG通路和蛋白质相互作用网络调节第59-62页
        3.3.9 差异表达蛋白验证第62-63页
        3.3.10 Westernblot验证温度对Hsp70的影响第63-64页
        3.3.11 荧光定量PCR鉴定PEDV的相对表达量第64-65页
    3.4 讨论第65-70页
        3.4.1 病毒感染相关信号通路第65-66页
        3.4.2 差异磷酸化蛋白与病毒感染第66-70页
    3.5 小结第70-71页
4 结论第71-73页
参考文献第73-93页
致谢第93-95页
附录第95-107页
个人简历第107页

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