| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 1 绪论 | 第11-25页 |
| 1.1 前言 | 第11-12页 |
| 1.2 转座子的概况 | 第12-16页 |
| 1.2.1 转座子的发现 | 第12-13页 |
| 1.2.2 转座子的种类 | 第13-16页 |
| 1.3 转座子水平转移 | 第16-21页 |
| 1.3.1 转座子水平转移的概况 | 第16-17页 |
| 1.3.2 转座子水平转移的鉴定方法 | 第17-19页 |
| 1.3.3 转座子水平转移的机制 | 第19-20页 |
| 1.3.4 转座子水平转移对真核生物进化的影响 | 第20-21页 |
| 1.4 重组激活基因 | 第21-22页 |
| 1.4.1 重组激活基因的功能 | 第21页 |
| 1.4.2 重组激活基因的起源 | 第21-22页 |
| 1.5 研究目的与重要意义 | 第22-23页 |
| 1.6 本文研究的主要内容和技术路线 | 第23-25页 |
| 1.6.1 研究的主要内容 | 第23-24页 |
| 1.6.2 技术路线 | 第24-25页 |
| 2 家蚕和长红猎蝽中 hAT 转座子与 MITEs 的关系及水平转移 | 第25-43页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-28页 |
| 2.1.1 数据库 | 第25页 |
| 2.1.2 分析软件和程序 | 第25页 |
| 2.1.3 实验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.4 主要分析方法及流程 | 第26-28页 |
| 2.2 结果与分析 | 第28-38页 |
| 2.2.1 hAT 转座子的鉴定和特征分析 | 第28-30页 |
| 2.2.2 家蚕和长红猎蝽中一个新的 hAT 家族 | 第30-31页 |
| 2.2.3 MITEs 种系特异性地扩增 | 第31-33页 |
| 2.2.4 hAT 转座子的水平转移 | 第33-38页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第38-43页 |
| 2.3.1 hAT-4_BM, RP-hAT1 和 hAT-34_HM 代表了一个新的 hAT 家族 | 第38页 |
| 2.3.2 Bm-MITE15 的转座机制 | 第38-39页 |
| 2.3.3 水平转移 | 第39-40页 |
| 2.3.4 hAT-4_BM 可以被用作有效的分子工具 | 第40-43页 |
| 3 Chapaev 转座子在不同无脊椎动物和脊椎动物中的水平转移 | 第43-65页 |
| 3.1 材料与方法 | 第43-49页 |
| 3.1.1 数据库 | 第43页 |
| 3.1.2 分析软件和程序 | 第43页 |
| 3.1.3 实验材料 | 第43-44页 |
| 3.1.4 实验所用到的引物 | 第44页 |
| 3.1.5 主要分析方法及流程 | 第44-49页 |
| 3.2 结果与分析 | 第49-63页 |
| 3.2.1 Merrow, Garfield 和 Conan 转座子的鉴定和特征分析 | 第49-52页 |
| 3.2.2 起源于 Garfield 和 Conan 转座子的非自主转座子 | 第52-54页 |
| 3.2.3 不同物种间转座子的高一致性暗示水平转移 | 第54-57页 |
| 3.2.4 比较宿主和转座子的系统发生树 | 第57页 |
| 3.2.5 纯化选择和密码子偏好性分析 | 第57-59页 |
| 3.2.6 转座子的分布和直系同源位点分析 | 第59-61页 |
| 3.2.7 转座子的插入时间估计和宿主的地理分布 | 第61-63页 |
| 3.3 结论和讨论 | 第63-65页 |
| 4 Chapaev 转座子和重组激活基因 RAG1 的进化关系 | 第65-73页 |
| 4.1 材料与方法 | 第65页 |
| 4.1.1 数据库 | 第65页 |
| 4.1.2 分析软件 | 第65页 |
| 4.1.3 主要分析方法及流程 | 第65页 |
| 4.2 结果与分析 | 第65-71页 |
| 4.2.1 检测 RAG1 基因与 Chapaev 转座子之间的相似性 | 第65-66页 |
| 4.2.2 RAG1 基因与 Chapaev 转座子 N 末端的两个保守基序 | 第66页 |
| 4.2.3 RAG1 基因与 Chapaev 转座子 C 末端的十五个保守基序 | 第66-68页 |
| 4.2.4 Chapaev，Transib 和 RAG1 的系统发生分析 | 第68-71页 |
| 4.3 结论与讨论 | 第71-73页 |
| 5 家蚕和长红猎蝽中微型反向重复序列（MITEs）的起源和进化 | 第73-93页 |
| 5.1 材料与方法 | 第73-78页 |
| 5.1.1 数据库 | 第73页 |
| 5.1.2 分析软件和程序 | 第73页 |
| 5.1.3 实验材料 | 第73-74页 |
| 5.1.4 实验所用到的引物 | 第74页 |
| 5.1.5 主要分析方法及流程 | 第74-78页 |
| 5.2 结果与分析 | 第78-90页 |
| 5.2.1 家蚕和长红猎蝽中 MITEs 的鉴定和分析 | 第78-81页 |
| 5.2.2 家蚕和长红猎蝽中 Novel_NA 的注释 | 第81-82页 |
| 5.2.3 MITEs 的自主转座子 | 第82-86页 |
| 5.2.4 自主转座子的水平转移 | 第86-90页 |
| 5.3 结论与讨论 | 第90-93页 |
| 5.3.1 家蚕和长红猎蝽中 MITEs 起源和进化历史的模型 | 第90-91页 |
| 5.3.2 水平转移的机制 | 第91-93页 |
| 6 结论与展望 | 第93-95页 |
| 致谢 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-109页 |
| 附录 | 第109-114页 |
| A．作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第109页 |
| B．作者在攻读博士学位期间参加的研究课题 | 第109-110页 |
| C．本文所用到的附录文件 | 第110-114页 |
