| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-34页 |
| ·微生物铁还原 | 第15-22页 |
| ·酶介导铁还原的重要性 | 第16-17页 |
| ·铁还原过程的发生 | 第17页 |
| ·异化铁还原微生物 | 第17-20页 |
| ·铁还原机制 | 第20-22页 |
| ·Fe(Ⅲ)还原微生物分子生态研究 | 第22页 |
| ·环境中的Fe(Ⅲ) | 第22-25页 |
| ·环境中Fe(Ⅲ)的生物利用度 | 第22-23页 |
| ·水稻土中的铁循环以及分布 | 第23-25页 |
| ·水稻土的特性 | 第25-27页 |
| ·水稻土中的氧还交替和pH | 第25页 |
| ·水稻土中的可溶解有机质 | 第25-26页 |
| ·水稻土中的主要细菌种群 | 第26页 |
| ·淹水对水稻土中微生物的影响 | 第26-27页 |
| ·地杆菌科和厌氧粘细菌的相关研究 | 第27-34页 |
| ·地杆菌和厌氧粘细菌的系统发育研究 | 第27-28页 |
| ·地杆菌和厌氧粘细菌的生理性质 | 第28-29页 |
| ·地杆菌和厌氧粘细菌还原Fe(Ⅲ)的机制 | 第29-30页 |
| ·地杆菌和厌氧粘细菌的分子生理研究 | 第30-31页 |
| ·水稻土中地杆菌和厌氧粘细菌的研究 | 第31-32页 |
| ·地杆菌和厌氧粘细菌的环境学意义 | 第32-34页 |
| 第二章 研究内容与方法 | 第34-39页 |
| ·研究目的与意义 | 第34-35页 |
| ·研究内容 | 第35-36页 |
| ·主要技术方法 | 第36-39页 |
| ·水稻土厌氧泥浆培养 | 第36页 |
| ·PCR 和realtime PCR | 第36-37页 |
| ·随即扩增片段长度多态性（RFLP）分析 | 第37页 |
| ·单链构象多态性（SSCP）技术 | 第37-39页 |
| 第三章 淹水培养对水稻土中地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 | 第39-50页 |
| ·材料与方法 | 第39-41页 |
| ·供试土样 | 第39-40页 |
| ·泥浆培养及Fe(Ⅱ)含量测定 | 第40-41页 |
| ·土样中微生物总DNA 提取 | 第41页 |
| ·16S rDNA 的 Realtime PCR | 第41页 |
| ·数据处理 | 第41页 |
| ·结果与分析 | 第41-46页 |
| ·不同水稻土中Fe(Ⅲ)还原特征 | 第41-43页 |
| ·淹水初期不同水稻土中地杆菌和厌氧粘细菌的丰度变化 | 第43-44页 |
| ·短期淹水培养过程中地杆菌和厌氧粘细菌丰度变化 | 第44-45页 |
| ·短期淹水培养过程中硫酸盐含量变化 | 第45页 |
| ·不同水稻土处理间的聚类分析 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-49页 |
| ·不同水稻土中Fe(Ⅲ)还原能力的差异 | 第46-47页 |
| ·16S rDNA 拷贝数与群落演替 | 第47页 |
| ·水稻土pH 与地杆菌和厌氧粘细菌对淹水的敏感性 | 第47-48页 |
| ·不同水稻土中地杆菌和厌氧粘细菌丰度变化与 Fe(Ⅲ)还原的关系 | 第48-49页 |
| ·本章小结 | 第49-50页 |
| 第四章 温度对水稻土中地杆菌和厌氧粘细菌丰度和群落结构的影响 | 第50-70页 |
| ·材料与方法 | 第51-54页 |
| ·供试土样 | 第51页 |
| ·试验设置 | 第51页 |
| ·泥浆培养和Fe(Ⅱ)含量的测定 | 第51页 |
| ·水稻土泥浆中DNA 和RNA 的提取以及cDNA 链的合成 | 第51页 |
| ·16S rDNA 和16S rcDNA 克隆序列文库的建立 | 第51-53页 |
| ·RFLP 指纹图谱和多样性分析 | 第53页 |
| ·测序和系统发育分析 | 第53-54页 |
| ·丰度测定 | 第54页 |
| ·结果与分析 | 第54-65页 |
| ·不同温度下水稻土泥浆中 Fe(Ⅲ)还原特征 | 第54-55页 |
| ·不同温度下水稻土泥浆中地杆菌和厌氧粘细菌的丰度变化 | 第55-57页 |
| ·细菌、地杆菌和厌氧粘细菌的群落多样性 | 第57-60页 |
| ·基于 DNA 和 RNA 的地杆菌和厌氧粘细菌优势群落构成比较 | 第60-62页 |
| ·地杆菌和厌氧粘细菌的进化树构建和系统发育分析 | 第62-65页 |
| ·讨论 | 第65-68页 |
| ·温度对Fe(Ⅲ)还原的影响 | 第65-66页 |
| ·温度对地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 | 第66页 |
| ·不同温度下基于DNA 和RNA 的地杆菌和厌氧粘细菌群落结构 | 第66-68页 |
| ·地杆菌群落结构 | 第67-68页 |
| ·厌氧粘细菌群落结构 | 第68页 |
| ·本章小节 | 第68-70页 |
| 第五章 含氧浓度对水稻土泥浆中地杆菌和厌氧粘细菌丰度和群落结构的影响. | 第70-85页 |
| ·材料和方法 | 第71-72页 |
| ·供试土样 | 第71页 |
| ·试验设置 | 第71页 |
| ·泥浆培养及Fe(Ⅱ)含量测定 | 第71页 |
| ·水稻土泥浆中DNA 和RNA 的提取以及cDNA 链的合成 | 第71-72页 |
| ·16S rDNA 和16S rcDNA 克隆序列文库的建立 | 第72页 |
| ·RFLP 指纹图谱和多样性分析 | 第72页 |
| ·SSCP 分析 | 第72页 |
| ·测序和系统发育分析 | 第72页 |
| ·丰度测定 | 第72页 |
| ·结果与分析 | 第72-82页 |
| ·氧浓度对Fe(Ⅲ)还原的影响 | 第72-73页 |
| ·不同含氧浓度泥浆中的地杆菌和厌氧粘细菌丰度 | 第73-75页 |
| ·聚类分析 | 第75-76页 |
| ·不同处理环境克隆多样性比较 | 第76-77页 |
| ·氧浓度变化与细菌群落演替 | 第77-78页 |
| ·不同含氧浓度水稻土泥浆中的微生物群落结构SSCP 分析 | 第78-82页 |
| ·讨论 | 第82-84页 |
| ·不同含氧浓度水稻土泥浆中的Fe(Ⅲ) | 第82页 |
| ·厌氧-有氧条件转换下水稻土泥浆中的细菌群落演替和多样性.. | 第82-83页 |
| ·不同含氧浓度水稻土泥浆中的地杆菌和厌氧粘细菌 | 第83-84页 |
| ·本章小结 | 第84-85页 |
| 第六章 pH 值和有机质对水稻土泥浆中地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 | 第85-107页 |
| ·材料和方法 | 第87-88页 |
| ·供试土壤 | 第87页 |
| ·试验设置 | 第87页 |
| ·泥浆培养及Fe(Ⅱ)含量和pH 值的测定 | 第87页 |
| ·DNA 提取 | 第87页 |
| ·丰度测定 | 第87-88页 |
| ·数据分析 | 第88页 |
| ·结果与分析 | 第88-101页 |
| ·厌氧淹水培养水稻土泥浆中pH 值的变化 | 第88-90页 |
| ·土壤性质和Fe(Ⅲ)还原的关系 | 第90-93页 |
| ·有机质对厌氧水稻土泥浆中地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 | 第93-95页 |
| ·初始pH 值对厌氧水稻土泥浆中地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 | 第95-97页 |
| ·微生物丰度与土壤性质和Fe(Ⅲ)还原的关系 | 第97-101页 |
| ·不同处理基于real timePCR 的聚类分析 | 第101页 |
| ·讨论 | 第101-105页 |
| ·泥浆pH 值的变化 | 第101-102页 |
| ·Fe(Ⅲ)还原 | 第102-103页 |
| ·有机质对地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 | 第103-104页 |
| ·初始pH 对地杆菌和厌氧粘细菌丰度的影响 | 第104-105页 |
| ·不同淹水时期的地杆菌和厌氧粘细菌 | 第105页 |
| ·本章小结 | 第105-107页 |
| 第七章 结论与展望 | 第107-110页 |
| ·本研究的主要结论 | 第107-108页 |
| ·论文创新点 | 第108页 |
| ·展望 | 第108-110页 |
| 参考文献 | 第110-134页 |
| 致谢 | 第134-135页 |
| 作者简介 | 第135页 |
