| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 第一章 绪论 | 第9-41页 |
| 1.1 含锌金属蛋白酶 | 第9页 |
| 1.2 锌离子及其结合基团 | 第9-10页 |
| 1.3 含锌金属蛋白酶计算模拟的方法及挑战 | 第10-12页 |
| 1.4 含锌金属蛋白酶计算模拟研究进展 | 第12-38页 |
| 1.4.1 Docking算法在含锌金属蛋白酶中的应用 | 第12-15页 |
| 1.4.2 含锌金属蛋白酶的力场参数 | 第15-18页 |
| 1.4.3 MD算法在含锌金属蛋白酶中的应用 | 第18-24页 |
| 1.4.4 QM/MM算法在含锌金属蛋白酶中的应用 | 第24-26页 |
| 1.4.5 含锌金属蛋白酶的自由能计算 | 第26-38页 |
| 1.5 论文主要研究内容 | 第38-41页 |
| 1.5.1 嗜热菌蛋白酶 | 第38-39页 |
| 1.5.2 硝基作为ZBG的TLN抑制剂 | 第39-41页 |
| 第二章 计算方法 | 第41-43页 |
| 2.1 分子对接 | 第41页 |
| 2.2 分子动力学模拟 | 第41-43页 |
| 第三章 结果和讨论 | 第43-57页 |
| 3.1 TLN与化合物1的分子对接与分子动力学模拟 | 第43-47页 |
| 3.2 TLN与化合物2的分子对接与分子动力学模拟 | 第47-52页 |
| 3.3 TLN与化合物3的分子对接与分子动力学模拟 | 第52-57页 |
| 第四章 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
