| 中文摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 引言 | 第10-13页 |
| 第二章 材料与方法 | 第13-23页 |
| 2.1 研究对象 | 第13-14页 |
| 2.1.1 病例组排除纳入标准 | 第13页 |
| 2.1.2 健康人排除纳入标准 | 第13-14页 |
| 2.2 主要实验试剂与仪器 | 第14-15页 |
| 2.3 研究方法 | 第15-23页 |
| 2.3.1 资料收集 | 第15-16页 |
| 2.3.2 粪便DNA的提取 | 第16-17页 |
| 2.3.3 粪便DNA质量的检测 | 第17页 |
| 2.3.4 粪便DNA的16S rRNA基因V3区bar coded 454测序 | 第17-18页 |
| 2.3.5 测序分析群落结构的流程 | 第18页 |
| 2.3.6 序列的质量控制 | 第18-19页 |
| 2.3.7 序列的比对 | 第19-20页 |
| 2.3.8 计算距离矩阵 | 第20页 |
| 2.3.9 划分操作分类单元 | 第20-21页 |
| 2.3.10 多样性分析 | 第21页 |
| 2.3.11 系统进化树的建立 | 第21-22页 |
| 2.3.12 分析分类地位 | 第22页 |
| 2.3.13 肠道菌群结构的多变量统计学分析 | 第22-23页 |
| 第三章 实验结果 | 第23-33页 |
| 3.1 各组人群肠道菌群多态性的比较 | 第23-28页 |
| 3.2 各组人群肠道菌群结构的整体比较 | 第28-30页 |
| 3.3 人群肠道菌群多样性组成的系统发育分析 | 第30-33页 |
| 第四章 讨论 | 第33-36页 |
| 第五章 结论 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-42页 |
| 综述 | 第42-50页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 附录 | 第51-53页 |