| 中文摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第—章 研究背景 | 第9-21页 |
| 1.与癌症相关SNP的研究历史 | 第9-11页 |
| ·SNP的分子生物学基础和人类基因组基础 | 第9-10页 |
| ·SNP与癌症的关系 | 第10-11页 |
| 2.与癌症相关SNP的研究现况、存在的问题和争议 | 第11-17页 |
| ·与癌症相关SNP的研究现状 | 第11-12页 |
| ·常见的筛选与癌症呈关联性SNP的方法 | 第12-15页 |
| ·SNP-SNP交互作用与癌症的关联性研究 | 第15-17页 |
| 3.应用关联规则分析研究与癌症相关SNP的意义 | 第17-18页 |
| 4.本研究中涉及到的统计学方法 | 第18-21页 |
| ·关联规则分析 | 第18-19页 |
| ·Bootstrap重抽样技术 | 第19-21页 |
| 第二章 研究目的和内容 | 第21-22页 |
| 1.研究目的 | 第21页 |
| 2.研究内容 | 第21-22页 |
| 第三章 研究方法 | 第22-29页 |
| 1 模拟模型建立及其说明 | 第22-23页 |
| 2.生成模拟数据 | 第23-24页 |
| 3.应用关联规则筛选与癌症相关的SNP | 第24-29页 |
| ·Bootstrap抽样,并对Bootstrap子样本进行关联规则分析 | 第24-26页 |
| ·筛选与癌症呈关联性的SNP主效应 | 第26-27页 |
| ·对样本进行关联规则分析 | 第27页 |
| ·探索筛选与癌症呈关联性的SNP-SNP交互作用 | 第27-29页 |
| 第四章 研究结果 | 第29-61页 |
| 1.有交互作用背景的模拟样本的研究结果 | 第29-38页 |
| ·对随机模拟样本的统计描述 | 第29-32页 |
| ·筛选与癌症呈关联性的SNP的结果 | 第32-37页 |
| ·筛选与癌症呈关联性的SNP交互作用项的结果 | 第37-38页 |
| 2.无交互作用背景的模拟样本的研究结果 | 第38-46页 |
| ·随机模拟和关联规则分析 | 第38-39页 |
| ·关联规则结合Logistic逐步回归筛选与癌症呈关联性的SNP的结果 | 第39-41页 |
| ·用Bonferroni校正法筛选与癌症呈关联性的SNP的结果 | 第41-42页 |
| ·传统Logistic回归方法筛选与癌症呈关联性的SNP的结果 | 第42-44页 |
| ·三种方法筛选与癌症呈关联性的SNP主效应之结果对比 | 第44-46页 |
| 3.实例的研究结果 | 第46-61页 |
| ·实例数据来源及整理 | 第46-47页 |
| ·统计描述和Hardy-Weinberg平衡检验 | 第47-49页 |
| ·单变量Logistic回归拟合 | 第49-51页 |
| ·应用关联规则筛选与癌症呈关联性的SNP | 第51-52页 |
| ·应用关联规则筛选与癌症呈关联性的SNP-SNP交互作用 | 第52-61页 |
| 第五章 讨论 | 第61-66页 |
| 1.方法学讨论 | 第61-62页 |
| 2.模拟样本的结果讨论 | 第62-63页 |
| 3.实例的结果讨论 | 第63-64页 |
| 4.本研究的创新之处 | 第64页 |
| 5.本研究的局限性 | 第64页 |
| 6.今后的研究方向 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-69页 |
| 附录 | 第69-75页 |
| 附录一 综述 | 第69-74页 |
| 参考文献 | 第72-74页 |
| 附录二 已发表文章 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
