| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 引言 | 第18-19页 |
| 1 冠菌素(COR)诱导橡胶树次生乳管分化实验系统 | 第19-29页 |
| 1.1 前言 | 第19-20页 |
| 1.2 材料与试剂 | 第20页 |
| 1.2.1 植物材料 | 第20页 |
| 1.2.2 试剂 | 第20页 |
| 1.3 方法 | 第20-23页 |
| 1.3.1 COR诱导次生乳管分化的实验形态学观察 | 第20-21页 |
| 1.3.2 树皮的不同组织样品和形成层区样品的采集 | 第21页 |
| 1.3.3 总RNA提取 | 第21页 |
| 1.3.4 Real-time PCR分析 | 第21-23页 |
| 1.4 结果 | 第23-27页 |
| 1.4.1 COR诱导次生乳管分化实验系统的建立 | 第23-25页 |
| 1.4.2 不同季节条件下的COR诱导次生乳管分化的结果橡胶树树皮各组织和形成层区总RNA提取 | 第25-26页 |
| 1.4.3 形成层区样品中的基因表达 | 第26-27页 |
| 1.5 讨论 | 第27-29页 |
| 1.5.1 COR诱导次生乳管分化实验系统是一个合适研究乳管分化机制的实验系统 | 第27-29页 |
| 2 割胶、茉莉酸、乙烯对巴西橡胶树乳管细胞MYC家族成员基因表达的影响 | 第29-80页 |
| 2.1 前言 | 第29-34页 |
| 2.1.1 转录因子简介 | 第29页 |
| 2.1.2 bHLH转录因子 | 第29页 |
| 2.1.3 bHLH转录因子结构 | 第29-30页 |
| 2.1.4 bHLH转录因子分类 | 第30-31页 |
| 2.1.5 bHLH转录因子功能 | 第31-33页 |
| 2.1.6 MYC转录因子及其在橡胶树中的研究 | 第33-34页 |
| 2.2 材料与试剂 | 第34-35页 |
| 2.2.1 植物材料 | 第34-35页 |
| 2.2.2 试剂 | 第35页 |
| 2.3 方法 | 第35-38页 |
| 2.3.1 组织特异性表达 | 第35页 |
| 2.3.2 割胶处理 | 第35页 |
| 2.3.3 乙烯和茉莉酸处理 | 第35页 |
| 2.3.4 总RNA提取 | 第35-36页 |
| 2.3.5 HblMYC转录因子家族成员基因克隆 | 第36页 |
| 2.3.6 同源性分析和系统进化分析 | 第36-37页 |
| 2.3.7 Real-time PCR分析 | 第37-38页 |
| 2.4 结果 | 第38-77页 |
| 2.4.1 HblMYC转录因子家族成员基因克隆 | 第38-57页 |
| 2.4.2 HblMYC转录因子家族成员基因的生物信息学分析 | 第57-66页 |
| 2.4.3 HblMYC系统发育和同源性分析 | 第66-70页 |
| 2.4.4 HblMYC转录因子家族成员基因的组织特异性表达 | 第70页 |
| 2.4.5 割胶对HblMYC转录因子家族成员基因表达的影响 | 第70-71页 |
| 2.4.6 茉莉酸处理对HblMYC转录因子家族成员基因表达的影响 | 第71-72页 |
| 2.4.7 乙烯处理对HblMYC转录因子家族成员基因表达的影响 | 第72-77页 |
| 2.5 讨论 | 第77-80页 |
| 3 茉莉酸信号途径与巴西橡胶树次生乳管分化的研究 | 第80-92页 |
| 3.1 前言 | 第80-81页 |
| 3.2 材料与试剂 | 第81页 |
| 3.2.1 植物材料 | 第81页 |
| 3.2.2 试剂 | 第81页 |
| 3.3 方法 | 第81-82页 |
| 3.3.1 冠菌素处理的形成层和初生胶乳样品的采集 | 第81-82页 |
| 3.3.2 COI1-JAZ-MYC复合体对橡胶树乳管分化的调控 | 第82页 |
| 3.3.3 总RNA提取 | 第82页 |
| 3.3.4 Real-time PCR分析 | 第82页 |
| 3.4 结果 | 第82-89页 |
| 3.4.1 COR对基因表达的影响及其与乳管分化的关系 | 第82-89页 |
| 3.5 讨论 | 第89-92页 |
| 3.5.1 巴西橡胶树次生乳管分化相关的JAZ和MYC成员鉴定 | 第89-92页 |
| 4 组蛋白去乙酰化修饰与巴西橡胶树次生乳管分化的关系 | 第92-137页 |
| 4.1 前言 | 第92-96页 |
| 4.1.1 表观遗传调控的物质基础:染色质 | 第92页 |
| 4.1.2 组蛋白乙酰化修饰 | 第92-96页 |
| 4.2 材料与试剂 | 第96-97页 |
| 4.2.1 植物材料 | 第96页 |
| 4.2.2 试剂 | 第96-97页 |
| 4.3 方法 | 第97-99页 |
| 4.3.1 TSA诱导橡胶树次生乳管分化 | 第97页 |
| 4.3.2 组蛋白去乙酰化酶/乙酰化转移酶基因克隆 | 第97页 |
| 4.3.3 同源性分析和系统进化分析 | 第97页 |
| 4.3.4 TSA处理的形成层和初生胶乳样品的采集 | 第97-98页 |
| 4.3.5 组织特异性表达 | 第98页 |
| 4.3.6 总RNA提取 | 第98页 |
| 4.3.7 Real-time PCR分析 | 第98-99页 |
| 4.4 结果 | 第99-133页 |
| 4.4.1 TSA诱导橡胶树次生乳管分化 | 第99页 |
| 4.4.2 HbHDA和HbHAT家族基因克隆 | 第99-114页 |
| 4.4.3 HbHDA和HbHAT基因的生物信息学分析 | 第114-124页 |
| 4.4.4 HbHDA和HbHAT基因的系统发育和同源性分析 | 第124-128页 |
| 4.4.5 组织特异性表达 | 第128-129页 |
| 4.4.6 TSA和COR诱导乳管分化过程中的基因表达 | 第129-133页 |
| 4.5 讨论 | 第133-136页 |
| 4.5.1 TSA能够有效诱导橡胶树次生乳管分化 | 第133-135页 |
| 4.5.2 乳管分化相关的HDA和HAT | 第135-136页 |
| 小结 | 第136-137页 |
| 5 COR诱导橡胶树次生乳管分化SSH文库的构建与差异表达基因分析 | 第137-154页 |
| 5.1 前言 | 第137-140页 |
| 5.1.1 抑制性消减杂交技术 | 第137页 |
| 5.1.2 SSH技术的原理 | 第137页 |
| 5.1.3 SSH基本过程 | 第137-140页 |
| 5.2 材料与试剂 | 第140-144页 |
| 5.2.1 植物材料 | 第140页 |
| 5.2.2 试剂 | 第140页 |
| 5.2.3 SSH文库材料的处理 | 第140页 |
| 5.2.4 总RNA提取 | 第140-141页 |
| 5.2.5 橡胶树乳管分化SSH文库的构建 | 第141页 |
| 5.2.6 反式Northern blot分析 | 第141页 |
| 5.2.7 ESTs测序和生物信息学分析 | 第141-142页 |
| 5.2.8 Real-time PCR分析 | 第142-144页 |
| 5.3 结果与分析 | 第144-152页 |
| 5.3.1 冠菌素诱导乳管分化的效应 | 第144-145页 |
| 5.3.2 总RNA及mRNA质量检测 | 第145页 |
| 5.3.3 构建SSH文库的过程 | 第145-146页 |
| 5.3.4 差减效率分析 | 第146页 |
| 5.3.5 反式Northern blot分析 | 第146-147页 |
| 5.3.6 EST序列拼接和Unigene注释 | 第147-149页 |
| 5.3.7 差异表达基因的Real-time PCR分析 | 第149-152页 |
| 5.4 讨论 | 第152-153页 |
| 小结 | 第153-154页 |
| 6 COR诱导橡胶树次生乳管分化的转录组分析 | 第154-169页 |
| 6.1 前言 | 第154-155页 |
| 6.1.1 植物转录组简介 | 第154页 |
| 6.1.2 RNA-seq技术 | 第154-155页 |
| 6.2 材料与方法 | 第155-156页 |
| 6.2.1 植物材料 | 第155页 |
| 6.2.2 冠菌素处理的形成层区样品的获取 | 第155-156页 |
| 6.2.3 总RNA提取和RNA-seq样品 | 第156页 |
| 6.3 结果 | 第156-168页 |
| 6.3.1 总RNA质量检测 | 第156页 |
| 6.3.2 RNA-seq项目概述 | 第156页 |
| 6.3.3 产量统计 | 第156-157页 |
| 6.3.4 组装结果分析 | 第157-160页 |
| 6.3.5 Unigene功能注释及COG分类 | 第160-162页 |
| 6.3.6 预测编码蛋白框(CDS) | 第162-163页 |
| 6.3.7 Unigene表达差异分析 | 第163-168页 |
| 小结 | 第168-169页 |
| 7 结论 | 第169-171页 |
| 8 创新之处 | 第171页 |
| 9 后续研究 | 第171-172页 |
| 参考文献 | 第172-190页 |
| 附录 | 第190-216页 |
| 附录1 陆生植物26个亚家族bHLH转录因子的代表序列 | 第190-194页 |
| 附录2 25个拟南芥AtHDA的氨基酸序列 | 第194-199页 |
| 附录3 16个拟南芥AtHAT的氨基酸序列 | 第199-206页 |
| 附录4 正/反向文库Unigene信息 | 第206-214页 |
| 附录5 英文缩写及中英文对照表 | 第214-215页 |
| 附录6 博士在读期间发表的论文 | 第215-216页 |
| 致谢 | 第216页 |
