| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| 1.1 迟缓爱德华氏菌 | 第10-14页 |
| 1.1.1 爱德华氏菌分类历史 | 第10-11页 |
| 1.1.2 迟缓爱德华氏菌的生物学特性 | 第11-12页 |
| 1.1.3 流行病学 | 第12-13页 |
| 1.1.4 迟缓爱德华氏菌致病机理 | 第13-14页 |
| 1.2 迟缓爱德华氏菌分型研究进展 | 第14-15页 |
| 1.2.1 传统方法分型研究 | 第14页 |
| 1.2.2 基于多位点序列分析的分型研究 | 第14-15页 |
| 1.3 迟缓爱德华氏菌基因组学的研究进展 | 第15-20页 |
| 1.3.1 迟缓爱德华氏菌全基因组测序 | 第16-17页 |
| 1.3.2 迟缓爱德华氏菌比较基因组学研究 | 第17-19页 |
| 1.3.3 爱德华氏菌分类厘定 | 第19-20页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第20-21页 |
| 第二章 黄鳝源迟缓爱德华氏菌的鉴定 | 第21-29页 |
| 2.1 材料和方法 | 第21-24页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第21页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第21-22页 |
| 2.1.3 试验鱼 | 第22页 |
| 2.1.4 病原菌的分离与纯化 | 第22页 |
| 2.1.5 回归感染实验 | 第22-23页 |
| 2.1.6 表型鉴定 | 第23页 |
| 2.1.7 分子鉴定 | 第23-24页 |
| 2.1.8 药敏试验 | 第24页 |
| 2.2 结果 | 第24-27页 |
| 2.2.1 形态学观察 | 第24页 |
| 2.2.2 生理生化 | 第24-25页 |
| 2.2.3 回归感染实验结果 | 第25页 |
| 2.2.4 16Sr DNA和gyr B基因序列分析 | 第25-27页 |
| 2.2.5 药敏试验结果 | 第27页 |
| 2.3 分析与讨论 | 第27-29页 |
| 第三章 基于多位点序列分析的分型研究 | 第29-37页 |
| 3.1 材料和方法 | 第29-32页 |
| 3.1.1 主要试剂 | 第29页 |
| 3.1.2 主要仪器设备 | 第29-30页 |
| 3.1.3 供试菌株 | 第30页 |
| 3.1.4 管家基因的扩增 | 第30-31页 |
| 3.1.5 多位点序列分析 | 第31-32页 |
| 3.2 结果 | 第32-35页 |
| 3.3 分析与讨论 | 第35-37页 |
| 第四章 全基因组测序及比较基因组学研究 | 第37-51页 |
| 4.1 材料和方法 | 第37-40页 |
| 4.1.1 主要试剂 | 第37页 |
| 4.1.2 主要仪器设备 | 第37-38页 |
| 4.1.3 供试菌株 | 第38页 |
| 4.1.4 基因组DNA提取和上机测序 | 第38页 |
| 4.1.5 基因组组装和组分分析 | 第38-39页 |
| 4.1.6 基因功能分析 | 第39页 |
| 4.1.7 比较基因组分析 | 第39-40页 |
| 4.2 结果 | 第40-49页 |
| 4.2.1 ASE201307全基因组概况 | 第40-41页 |
| 4.2.2 功能基因分析 | 第41-43页 |
| 4.2.3 基因组可视化分析 | 第43-44页 |
| 4.2.4 比较基因组分析 | 第44-49页 |
| 4.3 分析与讨论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |