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七鳃鳗Lck-like的克隆表达及生物信息学分析

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
目录第7-10页
1 绪论第10-24页
    1.1 Lck的分子结构特点第10-12页
        1.1.1 N-末端膜定位结构域第10-11页
        1.1.2 独特(Unique)结构域第11页
        1.1.3 SH3和SH2结构域第11页
        1.1.4 酪氨酸激酶(催化)结构域第11-12页
    1.2 Lck的激活调节模型第12-13页
    1.3 Lek和Fyn的信号转导途径第13-15页
    1.4 Lek和Fyn对T细胞发育的作用第15-20页
        1.4.1 T细胞的发育过程第15-16页
        1.4.2 Lck和Fyn在DN分化为DP过程中的作用第16-17页
        1.4.3 Lck和Fyn在DP分化为SP过程中的作用第17-18页
        1.4.4 由Lck或Fyn调节的TCR及细胞因子IL-7R协同介导的信号转导调节初始T细胞的存活和恒定增殖第18-20页
    1.5 Lek和Fyn对TCR信号转导的影响第20-21页
    1.6 Lck和Fyn在调节γδTCR信号强度中的作用第21-22页
    1.7 结语第22-24页
2 七鳃鳗Lck-like的分子克隆第24-45页
    2.1 材料第24-25页
        2.1.1 实验材料第24页
        2.1.2 仪器设备第24-25页
        2.1.3 药品及试剂第25页
    2.2 方法第25-37页
        2.2.1 引物设计第25-26页
        2.2.2 白细胞分离第26页
        2.2.3 白细胞总RNA的提取第26-27页
        2.2.4 RT-PCR扩增第27-28页
        2.2.5 cDNA5’末端全长快速扩增反应(5’RACE)第28-32页
        2.2.6 cDNA3’末端全长快速扩增反应(3’RACE)第32-34页
        2.2.7 目的片段的回收第34页
        2.2.8 目的片段与载体连接及转化第34-35页
        2.2.9 重组质粒的鉴定第35-36页
        2.2.10 重组质粒的提取及测序第36-37页
        2.2.11 小量感受态细胞制备方法第37页
        2.2.12 3’RACE实验和5’RACE实验所得的序列拼接第37页
    2.3 结果第37-43页
        2.3.1 白细胞总RNA的提取第37-38页
        2.3.2 Lck-like全长扩增第38-43页
    2.4 讨论第43-44页
    2.5 小结第44-45页
3 Lck-like编码氨基酸序列生物信息学分析第45-63页
    3.1 分析所用的在线网站和软件第45页
    3.2 结果第45-60页
        3.2.1 一级结构分析第45-49页
        3.2.2 功能结构域预测第49-50页
        3.2.3 二级结构预测第50-53页
        3.2.4 三级结构模拟第53页
        3.2.5 抗原表位预测第53-54页
        3.2.6 同源序列比对第54-56页
        3.2.7 保守性分析第56-59页
        3.2.8 系统发育分析第59-60页
    3.3 讨论第60-62页
    3.4 小结第62-63页
4 实时荧光定量PCR法检测七鳃鳗Lck-like在各组织中的相对表达量第63-70页
    4.1 材料第63-64页
        4.1.1 实验材料第63页
        4.1.2 仪器设备第63-64页
        4.1.3 药品及试剂第64页
    4.2 方法第64-66页
        4.2.1 LPS刺激七鳃鳗第64页
        4.2.2 白细胞的分离及组织提取第64页
        4.2.3 白细胞及组织总RNA的提取第64-65页
        4.2.4 实时荧光定量PCR法检测目的基因的相对表达量第65-66页
    4.3 结果第66-68页
        4.3.1 组织总RNA提取第66-67页
        4.3.2 Lck-like在七鳃鳗不同组织中的相对表达量第67-68页
    4.4 讨论第68-69页
    4.5 小结第69-70页
5 重组Lck-like载体的构建及原核表达第70-79页
    5.1 材料第70-71页
        5.1.1 实验材料第70页
        5.1.2 仪器设备第70页
        5.1.3 药品及试剂第70-71页
    5.2 方法第71-75页
        5.2.1 设计引物第71页
        5.2.2 PCR扩增第71-72页
        5.2.3 目的片段回收第72页
        5.2.4 目的片段与载体相连与转化第72页
        5.2.5 重组表达菌的鉴定第72-73页
        5.2.6 蛋白的诱导表达第73页
        5.2.7 SDS-PAGE鉴定第73-74页
        5.2.8 可溶性蛋白和包涵体的分离方法第74-75页
    5.3 结果第75-77页
    5.4 讨论第77-78页
    5.5 小结第78-79页
6 结论第79-80页
本论文的创新点第80-81页
参考文献第81-87页
附录A 血液cDNA文库中与Lck高度同源的序列第87-88页
附录B 七鳃鳗Lck-like mRNA全序列第88-90页
附录C 不同物种的Lck-like的FASTA格式氨基酸序列第90-94页
研究生期间发表文章及研究成果第94-95页
致谢第95页

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