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Bacillus nematocida B16基因敲除方法探索

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
目录第8-12页
第一章 细菌防治线虫的研究进展第12-21页
    1. 前言第12-13页
    2. 杀线虫细菌的侵染过程及杀线虫机理第13-16页
        2.1 杀线虫细菌侵染线虫的过程第13-14页
        2.2 寄生性细菌对植物寄生线虫的防治第14页
        2.3 根际细菌对植物寄生线虫的防治第14-15页
        2.4 苏云金芽孢杆菌对寄生线虫的防治第15-16页
        2.5 铜绿假单胞菌对病原线虫的防治第16页
    3. Bacillus nematocida B16的杀线虫过程第16-18页
        3.1 B16的表型特征以及生理生化特征第16-17页
        3.2 B16捕杀线虫的分子机制研究进展第17页
        3.3 蛋白乙酰化参与B16杀线虫的调控第17-18页
    4. 芽孢杆菌基因敲除方法和质粒的研究进展第18-20页
        4.1 利用同源重组进行基因敲除第19页
        4.2 利用随机插入突变进行基因敲除第19-20页
    5. 本研究的意义第20-21页
第二章 烟酰胺提高B16的杀线虫活性以及acuC基因的敲除第21-32页
    1. 前言第21页
    2. 材料和方法第21-29页
        2.1 实验材料第21-23页
            2.1.1 实验菌株和质粒第21-22页
            2.1.2 实验用培养基第22页
            2.1.3 主要的实验用生化试剂第22-23页
            2.1.4 主要的实验仪器和设备第23页
        2.2 实验方法第23-29页
            2.2.1 烟酰胺(NAM)影响B16毒杀C.elegans活性的检测第23页
            2.2.2 获取acuC片段第23-26页
            2.2.3 构建敲除载体第26-28页
            2.2.4 宿主菌B16感受态的制备与敲除载体的转化第28-29页
            2.2.5 敲除验证第29页
    3. 实验结果第29-31页
    4. 讨论第31-32页
第三章 通过接合转移提高B16的质粒转化效率第32-41页
    1. 前言第32页
    2. 材料和方法第32-38页
        2.1 实验材料第32-34页
            2.1.1 实验菌株和质粒第32-33页
            2.1.2 实验用培养基第33页
            2.1.3 主要的实验用生化试剂第33-34页
            2.1.4 主要的实验仪器和设备第34页
        2.2 实验方法第34-38页
            2.2.1 B16 Rif~+菌株的获得第34页
            2.2.2 测试接合转移效率的质粒pRK415-kan的构建第34-38页
            2.2.3 接合转移第38页
            2.2.4 接合转移转化子的筛选、验证第38页
    3. 实验结果第38-40页
        3.1 B16 Rif~+菌株的获得第38-39页
        3.2 质粒pRK415-kan的构建第39页
        3.3 pRK415-kan测试接合转移的效率第39-40页
    4. 讨论第40-41页
第四章 改造pCP115为结合转移质粒并构建acuC基因敲除载体第41-50页
    1. 前言第41页
    2. 材料与方法第41-47页
        2.1 实验材料第41-43页
            2.1.1 实验菌株和质粒第41-42页
            2.1.2 实验用培养基第42页
            2.1.3 主要的实验用生化试剂第42-43页
            2.1.4 主要的实验仪器和设备第43页
        2.2 实验方法第43-47页
            2.2.1 质粒pCP115-mob的构建第43-45页
            2.2.2 acuC敲除载体pCP115-mob-kan-acuC的构建第45-46页
            2.2.3 接合转移进行基因敲除第46-47页
    3. 实验结果第47-48页
        3.1 敲除载体的构建第47页
        3.2 利用质粒pCP115-mob-kan-acuC进行acuC基因敲除第47-48页
    4. 讨论第48-50页
第五章 利用温度敏感质粒pKVM2尝试敲除acuC基因第50-58页
    1. 前言第50页
    2. 材料与方法第50-55页
        2.1 实验材料第50-52页
            2.1.1 实验菌株和质粒第50-51页
            2.1.2 实验用培养基第51页
            2.1.3 主要的实验用生化试剂第51-52页
            2.1.4 主要的实验仪器和设备第52页
        2.2 实验方法第52-55页
            2.2.1 获取目的片段第52-53页
            2.2.2 构建敲除载体第53-54页
            2.2.3 接合转移进行基因敲除第54-55页
    3. 实验结果第55-57页
        3.1 acuC基因敲除载体pKVM2-kan-acuC的构建第55-56页
        3.2 通过接合转移进行acuC基因敲除以及转化子验证第56-57页
    4. 讨论第57-58页
第六章 利用pCRISPER-Cas9系统尝试敲除acuC基因第58-64页
    1. 前言第58-59页
    2. 材料与方法第59-63页
        2.1 实验材料第59-61页
            2.1.1 实验菌株和质粒第59页
            2.1.3 实验培养基第59页
            2.1.4 实验试剂第59-60页
            2.1.5 实验仪器和设备第60-61页
        2.2 实验方法第61-63页
            2.2.1 敲除载体pCP115-mob-kan-Cas9-acuC的构建第61-63页
    3. 实验结果第63-64页
        3.1 质粒pCP115-mob-kan的构建第63页
        3.2 质粒pCP115-mob-kan-Cas9的构建第63-64页
全文总结与展望第64-66页
参考文献第66-71页
附录第71-79页
    附录1 实验中用到的PCR引物第71-72页
    附录2 论文中使用的英文及英文对照第72-73页
    附录3 常用溶液的配制方法第73-75页
    附录4. 常用的数据库和网上生物学资源第75-76页
    附录5. 实验中使用菌株和载体的性质和图谱第76-79页
致谢第79页

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