| 致谢 | 第3-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第9-18页 |
| 1.1 石榴概述 | 第9-10页 |
| 1.1.1 石榴的生物学特性 | 第9-10页 |
| 1.1.2 石榴的价值与栽培现状 | 第10页 |
| 1.2 转录组学概述 | 第10-13页 |
| 1.2.1 转录组概念 | 第10-11页 |
| 1.2.2 转录组研究方法概述 | 第11-12页 |
| 1.2.3 转录组测序技术发展历程 | 第12页 |
| 1.2.4 植物转录组学研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3 花色苷概述 | 第13-15页 |
| 1.3.1 花色苷生物合成途径 | 第13-15页 |
| 1.4 植物MYB转录因子 | 第15-16页 |
| 1.4.1 MYB转录因子概述 | 第15-16页 |
| 1.4.2 MYB转录因子对花青苷的调控研究 | 第16页 |
| 1.5 本论文研究的内容、目的、意义 | 第16-18页 |
| 2 石榴果皮、籽粒转录组学分析 | 第18-30页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-20页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第18页 |
| 2.1.2 石榴籽粒、果皮总RNA的提取 | 第18-19页 |
| 2.1.3 转录组测序 | 第19页 |
| 2.1.4 测序数据的统计与评估 | 第19-20页 |
| 2.1.5 序列组装 | 第20页 |
| 2.1.6 Unigenes功能注释 | 第20页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第20-30页 |
| 2.2.1 石榴果皮、籽粒总RNA提取 | 第20-22页 |
| 2.2.2 测序统计与质量分析 | 第22页 |
| 2.2.3 序列组装结果 | 第22-23页 |
| 2.2.4 RNA-seq序列比对结果 | 第23页 |
| 2.2.5 COG功能分类 | 第23-25页 |
| 2.2.6 Unigenes GO功能分析 | 第25-27页 |
| 2.2.7 KEGG代谢通路分析 | 第27-30页 |
| 3 石榴MYB基因的克隆与生物信息分析 | 第30-48页 |
| 3.1 试验材料与方法 | 第30-34页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第30页 |
| 3.1.2 主要试剂及仪器 | 第30页 |
| 3.1.3 试验用具处理 | 第30页 |
| 3.1.4 试验方法 | 第30-34页 |
| 3.2 结果与分析 | 第34-48页 |
| 3.2.1 MYB氨基酸序列相似性比较与系统进化树分析 | 第36-37页 |
| 3.2.2 MYB理化性质分析 | 第37-38页 |
| 3.2.3 MYB信号肽分析 | 第38-39页 |
| 3.2.4 MYB跨膜结构分析 | 第39-40页 |
| 3.2.5 MYB亲疏水性分析 | 第40-43页 |
| 3.2.6 MYB蛋白亚细胞定位 | 第43-44页 |
| 3.2.7 MYB蛋白结构功能域分析 | 第44页 |
| 3.2.8 MYB蛋白二级结构预测 | 第44-48页 |
| 4 讨论 | 第48-50页 |
| 4.1 几种转录组数据拼接软件的比较 | 第48页 |
| 4.2 石榴转录组测序研究 | 第48-49页 |
| 4.3 MYB基因克隆及生物信息学分析 | 第49-50页 |
| 5 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-58页 |
| 附录 | 第58-68页 |