摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5页 |
一、文献综述 | 第8-14页 |
1.1 肿瘤疾病概述 | 第8页 |
1.2 基因差异表达研究技术简介 | 第8-13页 |
1.2.1 传统基因差异表达研究技术 | 第9-10页 |
1.2.2 基因芯片技术 | 第10-13页 |
1.3 研究目的及意义 | 第13-14页 |
二、实验研究 | 第14-23页 |
2.1 材料、试剂与仪器 | 第14-15页 |
2.1.1 实验仪器 | 第14-15页 |
2.1.2 实验试剂 | 第15页 |
2.2 实验方法 | 第15-23页 |
2.2.1 样本采集 | 第15页 |
2.2.2 总RNA的抽提 | 第15-16页 |
2.2.3 总RNA的质量控制 | 第16页 |
2.2.4 cRNA的合成、荧光标记及纯化 | 第16-20页 |
2.2.5 基因表达谱芯片的杂交及洗片 | 第20-22页 |
2.2.6 实验数据的处理 | 第22-23页 |
三、实验结果与分析 | 第23-41页 |
3.1 总RNA及cRNA质量控制结果 | 第23-25页 |
3.1.1 总RNA质量控制结果 | 第23-24页 |
3.1.2 cRNA质量控制结果 | 第24-25页 |
3.2 基因表达谱芯片结果及筛选 | 第25-28页 |
3.2.1 Agilent基因表达谱芯片扫描结果 | 第25-26页 |
3.2.2 基因表达谱芯片扫描结果的转化与筛选 | 第26-28页 |
3.3 实验数据处理 | 第28-41页 |
3.3.1 差异表达基因的聚类分析处理 | 第28-29页 |
3.3.2 Gene Ontology(GO)功能富集处理 | 第29-36页 |
3.3.3 差异表达基因所参与的信号通路 | 第36-39页 |
3.3.4 蛋白质相互作用关系 | 第39-41页 |
四、讨论 | 第41-53页 |
4.1 GO结果分析讨论 | 第41-42页 |
4.2 KEGG信号通路 | 第42-44页 |
4.3 STRING蛋白质相互作用关系 | 第44-45页 |
4.4 结肠癌相关信号通路中的差异表达基因研究 | 第45-53页 |
五、结论 | 第53-54页 |
参考文献 | 第54-58页 |
附录:缩略词表 | 第58-59页 |
致谢 | 第59-60页 |
作者简介 | 第60页 |