| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第1章 绪论 | 第12-38页 |
| 1.1 畜禽养殖污染现状 | 第12-16页 |
| 1.1.1 我国畜禽养殖业发展现状 | 第12-14页 |
| 1.1.2 我国畜禽养殖业面源污染 | 第14页 |
| 1.1.3 我国畜禽养殖业污染物处理现状 | 第14-16页 |
| 1.2 耐药基因的研究进展 | 第16-23页 |
| 1.2.1 水环境中耐药基因的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2.2 畜禽养殖废水中四环素类耐药基因的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.2.3 抗生素耐药基因的检测方法 | 第20-23页 |
| 1.3 微生物溯源方法的研究进展 | 第23-28页 |
| 1.3.1 微生物溯源方法学 | 第23-24页 |
| 1.3.2 微生物溯源方法的应用研究 | 第24-28页 |
| 1.4 研究意义与目的 | 第28-29页 |
| 1.4.1 研究意义 | 第28-29页 |
| 1.4.2 研究目的 | 第29页 |
| 1.5 技术路线 | 第29-30页 |
| 参考文献 | 第30-38页 |
| 第2章 基于微生物溯源的畜禽粪便污染物在受纳河流中降解规律研究 | 第38-56页 |
| 2.1 引言 | 第38页 |
| 2.2 材料与方法 | 第38-46页 |
| 2.2.1 实验样品、试剂与仪器 | 第38-40页 |
| 2.2.2 样品DNA提取 | 第40-41页 |
| 2.2.3 PCR | 第41页 |
| 2.2.4 凝胶电泳 | 第41-42页 |
| 2.2.5 PCR产物纯化 | 第42页 |
| 2.2.6 克隆 | 第42-44页 |
| 2.2.7 质粒DNA的提取与纯化 | 第44页 |
| 2.2.8 实时定量PCR | 第44-46页 |
| 2.2.9 常规水质指标的检测 | 第46页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第46-51页 |
| 2.3.1 DNA提取结果分析 | 第46-47页 |
| 2.3.2 定性PCR检测宿主特异性微生物标记基因 | 第47页 |
| 2.3.3 宿主特异性微生物标记基因重组质粒构建及标准曲线 | 第47-48页 |
| 2.3.4 宿主特异性微生物标记基因的定量分析 | 第48-50页 |
| 2.3.5 样品水质指标的检测 | 第50-51页 |
| 2.4 本章小结 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 第3章 畜禽养殖废水及下游河水中微生物群落结构研究 | 第56-72页 |
| 3.1 引言 | 第56页 |
| 3.2 材料与方法 | 第56-59页 |
| 3.2.1 DNA样品准备 | 第56页 |
| 3.2.2 PCR试验 | 第56-57页 |
| 3.2.3 PCR凝胶电泳 | 第57-58页 |
| 3.2.4 454焦磷酸测序 | 第58页 |
| 3.2.5 454焦磷酸测序数据的前处理 | 第58页 |
| 3.2.6 生物信息学分析 | 第58-59页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第59-68页 |
| 3.3.1 微生物多样性分析 | 第59-61页 |
| 3.3.2 微生物群落结构分析 | 第61-64页 |
| 3.3.3 微生物群落结构相似性分析 | 第64-68页 |
| 3.4 本章小结 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-72页 |
| 第4章 禽畜养殖废水及下游河水中四环素类耐药基因丰度与多样性分析 | 第72-86页 |
| 4.1 引言 | 第72页 |
| 4.2 材料与方法 | 第72-75页 |
| 4.2.1 样品DNA提取 | 第72页 |
| 4.2.2 四环素类耐药基因PCR分析 | 第72-74页 |
| 4.2.3 凝胶电泳 | 第74页 |
| 4.2.4 PCR产物纯化 | 第74页 |
| 4.2.5 TA克隆 | 第74页 |
| 4.2.6 质粒DNA的提取与纯化 | 第74页 |
| 4.2.7 实时定量PCR | 第74-75页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第75-81页 |
| 4.3.1 废水和河水样品中四环素耐药基因的多样性分析 | 第75-77页 |
| 4.3.2 四环素耐药基因的定量分析 | 第77-78页 |
| 4.3.3 四环素类耐药基因的丰度与宿主特异性微生物标记基因相关性分析 | 第78-81页 |
| 4.4 本章小结 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-86页 |
| 第5章 结论与展望 | 第86-88页 |
| 5.1 结论 | 第86-87页 |
| 5.2 研究展望 | 第87-88页 |
| 创新点 | 第88-89页 |
| 项目支持 | 第89-90页 |
| 成果清单 | 第90-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
