蛋白质推断及其统计检验算法研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 引言 | 第8-10页 |
| 1 背景知识及相关技术 | 第10-16页 |
| 1.1 蛋白质鉴定 | 第10-13页 |
| 1.1.1 鸟枪法蛋白质组学 | 第10-11页 |
| 1.1.2 肽段鉴定算法 | 第11页 |
| 1.1.3 肽段鉴定结果评价 | 第11-12页 |
| 1.1.4 蛋白质推断算法 | 第12-13页 |
| 1.1.5 蛋白质推断结果评估 | 第13页 |
| 1.2 相关技术 | 第13-16页 |
| 1.2.1 线性规划 | 第13-14页 |
| 1.2.2 假设检验 | 第14-15页 |
| 1.2.3 置换检验 | 第15-16页 |
| 2 相关工作的研究现状 | 第16-19页 |
| 2.1 蛋白质推断算法的研究现状 | 第16-17页 |
| 2.2 蛋白质推断结果评估方法研究现状 | 第17-19页 |
| 3 基于线性规划模型的蛋白质推断算法 | 第19-35页 |
| 3.1 线性规划模型 | 第19-22页 |
| 3.2 自动参数选择方法 | 第22-23页 |
| 3.3 蛋白质推断算法实验 | 第23-33页 |
| 3.3.1 数据集 | 第23-24页 |
| 3.3.2 肽段鉴定算法 | 第24-25页 |
| 3.3.3 蛋白质推断算法 | 第25页 |
| 3.3.4 实验结果 | 第25-33页 |
| 3.4 小结 | 第33-35页 |
| 4 蛋白质推断结果FDR估计研究 | 第35-52页 |
| 4.1 蛋白质推断结果FDR估计算法 | 第35-40页 |
| 4.1.1 生成随机二分图 | 第36-38页 |
| 4.1.2 预测随机二分图上的蛋白质分数 | 第38-39页 |
| 4.1.3 计算置换P值和FDR | 第39-40页 |
| 4.2 蛋白质推断结果评估实验 | 第40-51页 |
| 4.2.1 数据集和肽段鉴定 | 第40页 |
| 4.2.2 蛋白质推断算法 | 第40-41页 |
| 4.2.3 蛋白质推断结果评估方法 | 第41页 |
| 4.2.4 实验结果 | 第41-51页 |
| 4.3 小结 | 第51-52页 |
| 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
