| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| RESUME | 第10-12页 |
| Table of Contents | 第12-14页 |
| LIST OF FIGURES AND TABLES | 第14-17页 |
| LIST OF ABBREVIATIONS | 第17-19页 |
| INTRODUCTION | 第19-72页 |
| Ⅰ.1 Overview of NMR | 第20-22页 |
| Ⅰ.1.1 Development of NMR spectroscopy | 第20-21页 |
| Ⅰ.1.2 Basic principle of NMR | 第21-22页 |
| Ⅰ.2 B-DNA structures and NMR techniques | 第22-45页 |
| Ⅰ.2.1 Generalities | 第22-26页 |
| Ⅰ.2.2 Structural information of B-DNA provided by NMR | 第26-45页 |
| Ⅰ.2.2.1 Hydrogen bonds | 第26页 |
| Ⅰ.2.2.2 Torsion Angles | 第26-30页 |
| Ⅰ.2.2.3 Helical parameters and B-DNA conformations | 第30-32页 |
| Ⅰ.2.2.4 Inter-atomic distances | 第32-37页 |
| Ⅰ.2.2.5 Chemical shifts of Phosphorus(δP) | 第37-40页 |
| Ⅰ.2.2.6 Residual Dipolar couplings(RDC) | 第40-45页 |
| Ⅰ.3 Biological context and function of nucleosome | 第45-64页 |
| Ⅰ.3.1 Nucleosome | 第45-50页 |
| Ⅰ.3.2 Nucleosome positioning | 第50-51页 |
| Ⅰ.3.3 Significances of nucleosome postioning | 第51-52页 |
| Ⅰ.3.4 Categories of nucleosome postioning | 第52-53页 |
| Ⅰ.3.5 Basic strategies for genome-wide nucleosome mapping | 第53-55页 |
| Ⅰ.3.6 Progress in genomic organization of nucleosomes | 第55-58页 |
| Ⅰ.3.7 Comparison of in vivo and in vitro studies | 第58-60页 |
| Ⅰ.3.8 CIS and TRANS determinants of nucleosome positioning | 第60-63页 |
| Ⅰ.3.8.1 DNA sequence preference motifs | 第60-61页 |
| Ⅰ.3.8.2 TRANS determinants of nucleosome positioning | 第61-63页 |
| Ⅰ.3.9 Nucleosome positioning and gene regulation | 第63-64页 |
| Ⅰ.4 The biological contents of the selected DNA sequences | 第64-72页 |
| Ⅰ.4.1 The conformation ofDNA in the nucleosome | 第64-66页 |
| Ⅰ.4.2 SELEX technology | 第66-67页 |
| Ⅰ.4.3 Biological context of the selected DNA Sequence | 第67-72页 |
| MATERIALS AND METHODS | 第72-78页 |
| Ⅱ.1 Molecules and Solutions | 第73-74页 |
| Ⅱ.1.1 Preparation of the oligonucleotide sequences | 第73-74页 |
| Ⅱ.1.2 Sample preparation | 第74页 |
| Ⅱ.1.3 Adding phage Pf1 | 第74页 |
| Ⅱ.2 Nuclear Magnetic Resonance | 第74-75页 |
| Ⅱ.2.1 NMR experiments | 第75页 |
| Ⅱ.2.1.1 The ~1H-~1HNMR spectra | 第75页 |
| Ⅱ.2.1.2 The Hetero-nuclear NMR | 第75页 |
| Ⅱ.3 Processing and analyzing of the NMR spectra | 第75-76页 |
| Ⅱ.4 BⅠ/BⅡ propensities in solution,from NMR | 第76页 |
| Ⅱ.5 TRX scores | 第76-77页 |
| Ⅱ.6 Crystallographic NCP structures | 第77页 |
| Ⅱ.7 Inter-atomic distance measurement | 第77-78页 |
| RESULTS | 第78-152页 |
| Ⅲ.1 Assignments of the resonances and analysis of the correlations of NMR observables | 第79-104页 |
| Ⅲ.1.1 Introduction of the strategies for assigning the resonance | 第79-82页 |
| Ⅲ.1.2 Distributions of exchangeable and non-exchangeable protons in 1D NMR spectra | 第82-83页 |
| Ⅲ.1.3 Assignments of 2D NMR spectra | 第83-104页 |
| Ⅲ.1.3.1 Assignments of non exchangeable protons | 第84-87页 |
| Ⅲ.1.3.2 Assignments of exchangeable protons:iminos and aminos protons | 第87-90页 |
| Ⅲ.1.3.3 Assignment ofproton H_2 ofAdenines | 第90-91页 |
| Ⅲ.1.3.4 The obtained chemical shifts of protons | 第91-94页 |
| Ⅲ.1.3.5 Assignments of Phosphorus | 第94-97页 |
| Ⅲ.1.3.6 Measurement of the inter-protons distances | 第97-104页 |
| Ⅲ.2 Intrinsic flexibility analysis | 第104-143页 |
| REFERENCES | 第126-143页 |
| Ⅲ.3 Messurements and correlations related to Residual Dipolar Couplings (RDCs) | 第143-152页 |
| Ⅲ.3.1 measurements of residual dipolar couplings | 第144-148页 |
| Ⅲ.3.2 Correlations between δP and △(RDC) | 第148-152页 |
| DISCUSSION AND GENERAL CONCLUSION | 第152-159页 |
| REFERENCE | 第159-176页 |
| ANNEXE | 第176-196页 |
| REMERCIEMENTS | 第196-199页 |
| 作者简介及在学成果 | 第199-201页 |
