| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 引言 | 第11-17页 |
| 1.1 养殖模式 | 第11-12页 |
| 1.1.1 传统池塘养殖模式 | 第11页 |
| 1.1.2 生物絮凝系统养殖模式 | 第11-12页 |
| 1.2 微生物群落研究 | 第12-13页 |
| 1.3 微生物群落研究方法 | 第13-15页 |
| 1.3.1 传统培养技术 | 第13页 |
| 1.3.2 Biolog-ECO平板分析 | 第13-14页 |
| 1.3.3 高通量测序技术 | 第14-15页 |
| 1.4 研究内容 | 第15-17页 |
| 1.4.1 养殖水环境中细菌数量变动与群落功能多样性研究 | 第15-16页 |
| 1.4.2 高通量测序技术分析养殖水环境中微生物菌群结构 | 第16-17页 |
| 第二章 凡纳滨对虾-生物絮凝池塘养殖系统细菌数量变动与群落功能多样性研究 | 第17-33页 |
| 2.1 实验材料与方法 | 第17-21页 |
| 2.1.1 采样池塘与虾放养量 | 第17-18页 |
| 2.1.2 样品采集与预处理 | 第18页 |
| 2.1.3 异养细菌和弧菌培养计数 | 第18-19页 |
| 2.1.4 Biolog微生物功能多样性分析 | 第19-20页 |
| 2.1.5 水质指标分析方法 | 第20-21页 |
| 2.1.6 数据处理 | 第21页 |
| 2.2 结果 | 第21-31页 |
| 2.2.1 水体中异养细菌和弧菌的数量变化 | 第21-22页 |
| 2.2.2 底泥中异养细菌和弧菌的数量变化 | 第22-23页 |
| 2.2.3 水质指标 | 第23-24页 |
| 2.2.4 水体中微生物群落平均色度值 | 第24-25页 |
| 2.2.5 底泥中微生物群落平均色度值 | 第25页 |
| 2.2.6 水体微生物对单类碳源利用情况 | 第25-26页 |
| 2.2.7 底泥微生物对单类碳源利用情况 | 第26-28页 |
| 2.2.8 微生物功能多样性指数 | 第28-30页 |
| 2.2.9 主成分分析 | 第30-31页 |
| 2.3 讨论 | 第31-33页 |
| 2.3.1 养殖水环境中细菌数量变动分析 | 第31-32页 |
| 2.3.2 微生物功能多样性分析 | 第32-33页 |
| 第三章 高通量测序技术分析两种池塘养殖水环境中菌群结构 | 第33-45页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第33-35页 |
| 3.1.1 采样池塘与虾放养量 | 第33页 |
| 3.1.2 样品采集与预处理 | 第33页 |
| 3.1.3 样品编号 | 第33-34页 |
| 3.1.4 高通量测序 | 第34-35页 |
| 3.1.5 生物多样性及分类学分析 | 第35页 |
| 3.2 结果 | 第35-43页 |
| 3.2.1 微生物多样性结果 | 第35-37页 |
| 3.2.2 底泥中微生物群落结构分析 | 第37-40页 |
| 3.2.3 水体中微生物群落结构分析 | 第40-43页 |
| 3.3 讨论 | 第43-44页 |
| 3.4 本章小结 | 第44-45页 |
| 第四章 异位式生物絮凝养殖模式中细菌数量变动与群落功能多样性研究 | 第45-55页 |
| 4.1 实验材料与方法 | 第45-46页 |
| 4.1.1 实验设计 | 第45-46页 |
| 4.1.2 水样采集与预处理 | 第46页 |
| 4.1.3 细菌计数 | 第46页 |
| 4.1.4 Biolog微生物功能多样性分析 | 第46页 |
| 4.1.5 水质指标分析方法 | 第46页 |
| 4.1.6 数据处理 | 第46页 |
| 4.2 结果 | 第46-53页 |
| 4.2.1 养殖水体中细菌数量变动 | 第46-47页 |
| 4.2.2 养殖水体水质指标 | 第47-48页 |
| 4.2.3 微生物群落平均色度值 | 第48-49页 |
| 4.2.4 微生物对单类碳源利用情况 | 第49-51页 |
| 4.2.5 微生物功能多样性指数 | 第51-52页 |
| 4.2.6 主成分分析 | 第52-53页 |
| 4.3 讨论 | 第53-55页 |
| 第五章 高通量测序技术分析异位式生物絮凝养殖模式中菌群结构 | 第55-62页 |
| 5.1 实验材料与方法 | 第55-56页 |
| 5.1.1 实验设计 | 第55页 |
| 5.1.2 样品采集与处理 | 第55页 |
| 5.1.3 样品编号 | 第55页 |
| 5.1.4 高通量测序 | 第55-56页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第56-61页 |
| 5.2.1 微生物多样性结果 | 第56页 |
| 5.2.2 门的分类水平上微生物群落结构 | 第56-58页 |
| 5.2.3 纲的分类水平上微生物群落结构 | 第58-59页 |
| 5.2.4 属的分类水平上微生物群落结构 | 第59-60页 |
| 5.2.5 聚类热图 | 第60-61页 |
| 5.3 本章小结 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
