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双单倍体牙鲆纯合不育个体的蛋白质组和转录组学研究

摘要第10-13页
Abstract第13-15页
1 引言第16-38页
    1.1 双单倍体鱼类的研究进展第16-25页
        1.1.1 双单倍体鱼类的诱导方法第16-21页
        1.1.2 双单倍体鱼类的生物学特性第21-22页
        1.1.3 双单倍体和克隆鱼类的应用研究进展第22-25页
    1.2 鱼类卵子发生机制的研究进展第25-36页
        1.2.1 PGCs的特征、起源和迁移第25-26页
        1.2.2 卵原细胞期第26-27页
        1.2.3 卵母细胞生长第27-30页
        1.2.4 卵母细胞的成熟和水合第30-34页
        1.2.5 排卵第34-35页
        1.2.6 卵泡闭锁第35页
        1.2.7 成熟的卵第35-36页
    1.3 研究背景和意义第36-38页
2 材料与方法第38-54页
    2.1 牙鲆诱导双单倍体成功率的比较研究第38-41页
        2.1.1 试验材料第38页
        2.1.2 基因组DNA的提取第38-39页
        2.1.3 微卫星引物第39-41页
        2.1.4 PCR反应及电泳检测第41页
        2.1.5 数据分析第41页
    2.2 双单倍体牙鲆纯合不育个体的激素水平变化研究第41-44页
        2.2.1 试验材料第41-42页
        2.2.2 血液采集第42页
        2.2.3 组织切片第42页
        2.2.4 激素水平测定第42-44页
        2.2.5 数据统计与分析第44页
    2.3 双单倍体牙鲆纯合不育的蛋白质组学研究第44-49页
        2.3.1 试验材料第44页
        2.3.2 试剂配置第44-45页
        2.3.3 蛋白样品制备第45页
        2.3.4 蛋白样品定量第45-46页
        2.3.5 双向凝胶电泳第46-47页
        2.3.6 染色第47-48页
        2.3.7 扫描第48页
        2.3.8 酶解第48页
        2.3.9 质谱上样第48页
        2.3.10 数据检索第48-49页
    2.4 双单倍体牙鲆纯合不育的转录组学研究第49-54页
        2.4.1 试验材料第49页
        2.4.2 RNA提取第49页
        2.4.3 c DNA文库的构建第49-50页
        2.4.4 RNA测序、组装和数据处理第50-51页
        2.4.5 CDS预测、SSR和SNP分析第51-52页
        2.4.6 荧光定量PCR第52-54页
3 结果与分析第54-74页
    3.1 牙鲆诱导双单倍体成功率的比较研究第54-58页
        3.1.1 亲本纯合度检验第54-55页
        3.1.2 DH的纯合个体比例第55页
        3.1.3 不同亲鱼的诱导率第55-57页
        3.1.4 相关性分析第57-58页
    3.2 双单倍体牙鲆纯合不育的激素水平变化研究第58-62页
        3.2.1 可育和不育牙鲆的卵巢组织学观察第58-59页
        3.2.2 不育牙鲆和对照组牙鲆血清激素含量的比较第59-62页
    3.3 双单倍体牙鲆纯合不育个体的蛋白质组学研究第62-65页
        3.3.1 牙鲆纯合不育个体的蛋白质组学图谱比较第62页
        3.3.2 差异表达蛋白点的质谱鉴定第62-64页
        3.3.3 一些重点关注差异蛋白的胶图及表达量对比第64-65页
    3.4 双单倍体牙鲆纯合不育个体的转录组学研究第65-74页
        3.4.1 Illumina测序和装配结果第65-67页
        3.4.2 CDS预测和unigenes注释第67页
        3.4.3 SSR和SNP分析第67页
        3.4.4 差异表达基因功能分析第67-71页
        3.4.5 共表达网络第71-73页
        3.4.6 荧光定量PCR对测序结果的验证第73-74页
4 讨论第74-83页
    4.1 牙鲆诱导DH成功率的比较研究第74-75页
        4.1.1 不同纯合度亲鱼诱导牙鲆DH效率的比较第74-75页
        4.1.2 诱导DH时杂合子产生的原因第75页
    4.2 DH牙鲆纯合不育的激素水平变化研究第75-77页
        4.2.1 DH牙鲆性腺发育的组织学特征第75-76页
        4.2.2 DH牙鲆的性腺发育过程中的激素水平变化特征第76-77页
    4.3 DH牙鲆纯合不育个体的蛋白质组学研究第77-79页
    4.4 DH牙鲆纯合不育个体的转录组组学研究第79-83页
        4.4.1 不育牙鲆性腺低表达基因分析第79-81页
        4.4.2 不育牙鲆性腺高表达基因分析第81-83页
5 结论第83-84页
致谢第84-85页
参考文献第85-110页
攻读博士学位期间发表的学术论文第110-111页

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