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A-Raf-S214C突变体对MAPK信号通路的影响及2个A-Raf激酶结合蛋白的功能研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略语索引第18-20页
实验仪器及设备第20-22页
实验试剂第22-25页
第一章 前言第25-43页
    1.1 Raf激酶激酶与信号通路第25-29页
        1.1.1 Raf激酶家族成员第25-27页
        1.1.2 Raf激酶突变与肿瘤第27-29页
    1.2 肺癌及其治疗第29-31页
        1.2.1 肺癌的病因和危险因素第29-30页
        1.2.2 肺癌的病理类型和分期第30页
        1.2.3 肺癌的治疗手段第30-31页
    1.3 热休克蛋白70 (HSP70)第31-34页
        1.3.1 热休克蛋白的发现第31-32页
        1.3.3 HSP70的功能及其作用机制第32-34页
        1.3.4 HSP70与肿瘤的关系第34页
    1.4 GRP78蛋白第34-37页
        1.4.1 GRP78的基因特点第34-35页
        1.4.2 GRP78基因的转录调控第35页
        1.4.3 GRP78的生物学功能第35-36页
        1.4.4 GRP78与肿瘤的关系第36-37页
    1.5 PARP1蛋白第37-41页
        1.5.1 PARP1的发现第37-38页
        1.5.2 PARP1的基因结构特点第38页
        1.5.3 PARP1的功能及作用机制第38-40页
        1.5.4 PARP1与肿瘤的关系第40-41页
    1.6 本论文研究的意义第41-42页
    1.7 实验技术路线第42-43页
第二章 突变产生pcDNA5/FRT/TO-VSV-A-Raf (S214C)质粒第43-53页
    2.1 实验内容第43-49页
        2.1.1 引物设计第44页
        2.1.2 TOYOBO突变试剂盒突变法得到VSV-A-Raf-S214C第44-45页
        2.1.3 用Dpn I对模板质粒DNA进行消化第45页
        2.1.4 转化第45-46页
        2.1.5 菌落PCR验证第46-47页
        2.1.6 琼脂糖凝胶电泳验证菌落PCR反应第47-48页
        2.1.7 抽提质粒,并用酶切法验证突变体第48-49页
        2.1.8 测序并进行序列比对第49页
    2.2 实验结果第49-52页
        2.2.1 菌落PCR验证第49页
        2.2.2 酶切验证第49-50页
        2.2.3 测序比对结果第50-52页
    2.3 小结与讨论第52-53页
第三章 A-Raf及其突变体稳定细胞系的构建及验证第53-61页
    3.1 实验内容第53-58页
        3.1.1 细胞转染第53-55页
        3.1.2 对稳定细胞系进行Doxycycline(DOX)浓度梯度诱导第55页
        3.1.3 对稳定细胞系进行Doxycycline(DOX)时间梯度诱导第55-56页
        3.1.4 Western blotting检测第56-58页
    3.2 实验结果第58-59页
        3.2.1 Western blot检测获得最佳诱导浓度第58页
        3.2.2 Western blot检测获得最佳诱导时间第58-59页
    3.3 小结与讨论第59-61页
第四章 研究A-Raf-S214C突变体对MAPK信号通路的影响第61-63页
    4.1 实验内容第61-62页
        4.1.1 细胞处理第61页
        4.1.2 细胞收样第61页
        4.1.3 Western blot检测ERK的磷酸化水平第61页
        4.1.4 统计学分析第61-62页
    4.2 实验结果第62页
    4.3 小结与讨论第62-63页
第五章 用免疫沉淀法(co-IP)和蛋白组学的方法系统识别A-Raf激酶的结合蛋白第63-71页
    5.1 实验内容第63-65页
        5.1.1 CO-IP实验第63-64页
        5.1.2 Western blot检测第64页
        5.1.3 分析A-Raf结合蛋白第64页
        5.1.4 Co-IP验证A-Raf结合蛋白GRP78和PARP1第64-65页
    5.2 实验结果第65-69页
        5.2.1 Western blot检测A-Raf以及S214C的IP效果第65-66页
        5.2.2 质谱结果第66-67页
        5.2.4 Western blot检测GRP78和PARP1第67-69页
    5.3 小结与讨论第69-71页
第六章 基因沉默(Psuper RNAi质粒的构建)第71-85页
    6.1 实验内容第71-77页
        6.1.1 设计含有双酶切位点的GRP78和PARP1的shRNA第71页
        6.1.2 处理shRNA片段第71页
        6.1.3 酶切Psuper puro载体第71-72页
        6.1.4 酶切后进行琼脂糖凝胶验证并胶回收第72-73页
        6.1.5 连接反应第73-74页
        6.1.6 转化第74页
        6.1.7 酶切验证沉默载体第74页
        6.1.8 序列比对第74页
        6.1.9 构建Psuper RNAi- GRP78和Psuper RNAi- PARP1稳定细胞系第74-75页
        6.1.10 Western blot验证Psuper RNAi- GRP78和Psuper RNAi-PARP1稳定细胞系第75页
        6.1.11 化疗药物敏感实验第75页
        6.1.12 细胞划痕实验第75-76页
        6.1.13 Transwell细胞迁移实验第76-77页
    6.2 实验结果第77-84页
        6.2.1 琼脂糖凝胶电泳验证BgI Ⅱ和Xoh Ⅰ酶切Psuper puro载体第77页
        6.2.2 酶切验证第77-78页
        6.2.3 测序比对结果第78-80页
        6.2.4 Western blot验证Psuper RNAi- GRP78和Psuper RNAi- PARP1稳定细胞系第80页
        6.2.5 化疗药物敏感实验检测敲减后细胞活性的变化第80-81页
        6.2.6 细胞划痕实验检测PARP1敲减后,细胞迁移能力的改变第81-83页
        6.2.7 Transwell细胞实验检测PARP1敲减后,细胞迁移能力的改变第83-84页
    6.3 小结与讨论第84-85页
第七章 基因敲除(PX459-gRNA质粒的构建)第85-91页
    7.1 实验内容第85-88页
        7.1.1 设计含有双酶切位点的GRP78和PARP1的gRNA第85页
        7.1.2 处理shRNA片段第85-86页
        7.1.3 连接第86-88页
        7.1.4 处理连接产物第88页
        7.1.5 转化第88页
        7.1.6 敲除载体的确认第88页
    7.2 实验结果第88-89页
    7.3 小结与讨论第89-91页
第八章 基因高表达(PCDNA3.1-GRP78/PARP1质粒的构建)第91-107页
    8.1 实验内容第91-97页
        8.1.1 引物设计第91页
        8.1.2 处理GRP78和PARP1的高表达引物片段第91-93页
        8.1.3 琼脂糖凝胶电泳验证PCR扩增产物,并进行胶回收第93页
        8.1.4 限制性酶切GRP78/PARP1引物片段和PCDNA3.1载体第93-95页
        8.1.5 琼脂糖凝胶电泳进行酶切验证,并进行胶回收。第95页
        8.1.6 连接反应第95-96页
        8.1.7 转化(E.coli DH 5 α感受态细胞)第96页
        8.1.8 菌落PCR验证第96-97页
        8.1.9 抽提质粒并送测序第97页
        8.1.10 PCDNA3.1-GRP78和PCDNA3.1-PARP1稳定细胞系的构建第97页
        8.1.11 Western blot验证PCDNA3.1-GRP78和PCDNA3.1-PARP1稳定细胞系第97页
    8.2 实验结果第97-105页
        8.2.1 琼脂糖凝胶电泳验证PCR效果第97-98页
        8.2.2 琼脂糖凝胶电泳验证酶切产物第98-99页
        8.2.3 琼脂糖凝胶电泳验证胶回收产物第99-100页
        8.2.4 菌落PCR验证第100页
        8.2.5 测序结果比对第100-104页
        8.2.6 Western blot验证PCDNA3.1-GRP78和PCDNA3.1-PARP1稳定细胞系第104-105页
    8.3 小结与讨论第105-107页
第九章 总结第107-109页
致谢第109-111页
参考文献第111-117页
附录A A-Raf序列第117-119页
附录B 攻读硕士期间发表论文目录第119页

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