| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 主要符号对照表 | 第11-12页 |
| 第1章 引言 | 第12-21页 |
| 1. 环境缺氧对鱼类的影响 | 第12-19页 |
| 1.1. 缺氧对鱼类种群发展、个体生长的影响 | 第12-13页 |
| 1.2. 鱼类应对低氧的形态、生理、生化、分子等方面的应答 | 第13-14页 |
| 1.3. 鱼类珠蛋白超家族研究背景 | 第14-19页 |
| 1.3.1. 血红蛋白 | 第15-16页 |
| 1.3.2. 肌红蛋白 | 第16-17页 |
| 1.3.3. 脑红蛋白 | 第17-18页 |
| 1.3.4. 胞红蛋白 | 第18-19页 |
| 2. 青藏高原水系特征及其裂腹鱼亚科鱼类生物学特征 | 第19-20页 |
| 3. 本研究的目的意义 | 第20-21页 |
| 第2章 黄河裸裂尻鱼珠蛋白超家族成员基因结构特征及分子进化 | 第21-56页 |
| 1. 材料和方法 | 第21-28页 |
| 1.1. 实验用鱼和RNA提取 | 第21-22页 |
| 1.2. 转录组文库制备与测序 | 第22页 |
| 1.3. 转录组组装 | 第22页 |
| 1.4. 珠蛋白超家族成员的分子鉴定 | 第22-23页 |
| 1.5. 珠蛋白超家族成员的克隆 | 第23-28页 |
| 1.5.1. 总RNA提取 | 第23页 |
| 1.5.2. cDNA第一链的合成 | 第23页 |
| 1.5.3. 引物设计 | 第23-25页 |
| 1.5.4. 黄河裸裂尻鱼珠蛋白家族成员cDNA核心片段克隆 | 第25-26页 |
| 1.5.5. 黄河裸裂尻鱼HbA、HbB cDNA末端片段克隆 | 第26-27页 |
| 1.5.6. PCR产物的分离、回收和纯化 | 第27页 |
| 1.5.7. PCR产物的连接与转化 | 第27-28页 |
| 1.5.8. 菌液PCR检测 | 第28页 |
| 1.5.9. 序列分析 | 第28页 |
| 2. 结果 | 第28-52页 |
| 2.1. 转录组测序分析 | 第28-30页 |
| 2.1.1. 原始测序数据及转录组组装 | 第28-29页 |
| 2.1.2. 黄河裸裂尻鱼珠蛋白超家族成员的本地blast鉴定 | 第29-30页 |
| 2.2. 黄河裸裂尻鱼珠蛋白超家族成员的序列特点 | 第30-38页 |
| 2.2.1. 黄河裸裂尻鱼组织总RNA提取 | 第30页 |
| 2.2.2. 黄河裸裂尻鱼HbA和HbB基因序列分析 | 第30-32页 |
| 2.2.3. 黄河裸裂尻鱼Mb基因序列分析 | 第32-34页 |
| 2.2.4. 黄河裸裂尻鱼Cygb1和Cygb2基因序列分析 | 第34-36页 |
| 2.2.5. 黄河裸裂尻鱼Ngb基因序列分析 | 第36-38页 |
| 2.3. 黄河裸裂尻鱼珠蛋白超家族成员的分子进化 | 第38-52页 |
| 2.3.1. 黄河裸裂尻鱼HbA和HbB氨基酸序列同源性和进化树分析 | 第38-41页 |
| 2.3.2. 黄河裸裂尻鱼Mb氨基酸序列同源性和进化树分析 | 第41-44页 |
| 2.3.3. 黄河裸裂尻鱼Cygb1和Cygb2氨基酸序列同源性和进化树分析 | 第44-47页 |
| 2.3.4. 黄河裸裂尻鱼Ngb氨基酸序列同源性和进化树分析 | 第47-48页 |
| 2.3.5. 黄河裸裂尻鱼与其他硬骨鱼珠蛋白家族成员系统发育关系 | 第48-52页 |
| 3. 讨论 | 第52-56页 |
| 3.1. 转录组鉴定 | 第52页 |
| 3.2. HbA和HbB的序列特征及分子进化 | 第52-53页 |
| 3.3. Mb的序列特征及分子进化 | 第53-54页 |
| 3.4. Cygb1和Cygb2的序列特征及分子进化 | 第54页 |
| 3.5. Ngb的序列特征及分子进化 | 第54-56页 |
| 第3章 黄河裸裂尻鱼珠蛋白超家族成员在低氧条件下的表达调控 | 第56-80页 |
| 1. 材料与方法 | 第56-60页 |
| 1.1. 实验鱼的低氧处理 | 第56-57页 |
| 1.2. 实验方法 | 第57-60页 |
| 1.2.1. 总RNA的提取和cDNA的合成 | 第57页 |
| 1.2.2. 珠蛋白家族成员的组织表达 | 第57页 |
| 1.2.3. Real-time PCR检测珠蛋白家族成员mRNA表达水平 | 第57-58页 |
| 1.2.4. Western-Blot检测珠蛋白家族成员蛋白表达水平 | 第58-60页 |
| 1.2.5. 脾体指数、肾体指数和血液中Hb浓度测定 | 第60页 |
| 2. 结果 | 第60-75页 |
| 2.1. 血红蛋白HbA和HbB在低氧条件下的表达调控 | 第60-66页 |
| 2.1.1. 血红蛋白基因HbA和HbB的组织表达 | 第60页 |
| 2.1.2. Real-tme PCR检测HbA和HbB mRNA表达水平 | 第60-63页 |
| 2.1.3. Western-Blot检测HbA和HbB蛋白表达水平 | 第63-65页 |
| 2.1.4. 低氧对脾体指数、肾体指数和血液中血红蛋白含量的影响 | 第65-66页 |
| 2.2. 肌红蛋白Mb在低氧条件下的表达调控 | 第66-69页 |
| 2.2.1. 肌红蛋白基因Mb的组织表达 | 第66页 |
| 2.2.2. Real-tme PCR检测Mb基因mRNA表达水平 | 第66-68页 |
| 2.2.3. Western-Blot检测Mb蛋白表达水平 | 第68-69页 |
| 2.3. 胞红蛋白Cygb1和Cygb2在低氧条件下的表达调控 | 第69-73页 |
| 2.3.1. 胞红蛋白基因Cygb1和Cygb2的组织表达 | 第69页 |
| 2.3.2. Real-time PCR检测Cygb1和Cygb2 mRNA表达水平 | 第69-73页 |
| 2.4. 脑红蛋白Ngb在低氧条件下的表达调控 | 第73-75页 |
| 2.4.1. 脑红蛋白基因Ngb的组织表达 | 第73页 |
| 2.4.2. Real-tme PCR检测Ngb mRNA表达水平 | 第73-75页 |
| 3. 讨论 | 第75-80页 |
| 3.1. 血红蛋白Hb的低氧表达 | 第75-77页 |
| 3.2. 肌红蛋白Mb的低氧表达 | 第77-78页 |
| 3.3. 胞红蛋白Cygb的低氧表达 | 第78页 |
| 3.4. 脑红蛋白Ngb的低氧表达 | 第78-80页 |
| 全文主要结论 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 作者简介 | 第92-93页 |
| 附录A 主要试剂 | 第93页 |
| 附录B 主要仪器 | 第93页 |
