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锡林河湿地厌氧氨氧化菌群多样性、丰度及空间特征研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
1 绪论第10-21页
    1.1 厌氧氨氧化细菌概述第10-13页
        1.1.1 厌氧氨氧化的发现及意义第10-11页
        1.1.2 厌氧氨氧化细菌的特征第11-13页
    1.2 自然环境中厌氧氨氧化细菌的分布及多样性第13-16页
        1.2.1 海洋生态系统第13-14页
        1.2.2 河口和海湾生态系统第14页
        1.2.3 淡水生态系统第14-15页
        1.2.4 陆地生态系统第15-16页
    1.3 环境因子对厌氧氨氧化细菌菌群组成、分布的影响第16-19页
    1.4 研究的目的与意义第19-20页
    1.5 技术路线图第20-21页
2 材料与方法第21-29页
    2.1 研究区概况第21-22页
    2.2 样品的采集、处理与保存第22-23页
    2.3 主要试剂和仪器第23页
        2.3.1 分子生物学实验所用试剂盒第23页
        2.3.2 主要仪器第23页
    2.4 沉积物或土壤样品理化因子测定第23-24页
    2.5 沉积物或土壤样品总DNA提取第24-25页
    2.6 厌氧氨氧化菌16S rRNA基因序列的扩增第25-26页
    2.7 克隆测序第26-27页
        2.7.1 PCR产物纯化第26页
        2.7.2 克隆转化第26-27页
        2.7.3 菌落PCR鉴定阳性克隆子第27页
        2.7.4 测序第27页
    2.8 实时荧光定量PCR第27-28页
    2.9 数据处理第28-29页
3 结果与分析第29-42页
    3.1 理化性质结果分析第29-30页
    3.2 沉积物或土壤总DNA提取结果第30-31页
    3.3 厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因PCR电泳结果第31页
    3.4 厌氧氨氧化细菌16S rDNA克隆文库分析第31-38页
        3.4.1 厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因多样性分析第31-33页
        3.4.2 厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因系统进化分析第33-34页
        3.4.3 锡林河湿地厌氧氨氧化细菌群落结构分析第34-36页
        3.4.4 厌氧氨氧化细菌16SrRNA基因Unifrac聚类分析第36-37页
        3.4.5 环境因子对锡林河湿地厌氧氨氧化细菌群落结构的影响分析第37-38页
    3.5 锡林河湿地厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因丰度分析第38-42页
        3.5.1 定量PCR标准曲线和溶解曲线分析第38-40页
        3.5.2 锡林河湿地厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因定量结果第40页
        3.5.3 厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因丰度与环境因子相关性分析第40-42页
4 讨论第42-44页
    4.1 锡林河湿地厌氧氨氧化细菌多样性及分布第42-43页
    4.2 锡林河湿地厌氧氨氧化细菌丰度分析第43-44页
5 主要结论与展望第44-45页
    5.1 主要结论第44页
    5.2 创新点第44页
    5.3 不足与展望第44-45页
参考文献第45-51页
致谢第51页

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