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乳液PCR技术在构建ssDNA文库和P16基因甲基化、HBV DNA检测中的初步应用

摘要第5-11页
ABSTRACT第11-18页
第一章 绪论第24-49页
    1.1 乳状液第24-26页
    1.2 乳液PCR第26-34页
        1.2.1 PCR发展史第26-28页
        1.2.2 乳液PCR的建立第28-29页
        1.2.3 乳液PCR的应用第29-32页
        1.2.4 乳液PCR的特性第32-34页
    1.3 适配子筛选中次级文库构建方法第34-40页
        1.3.1 DNA次级文库在适配子筛选中作用第34-36页
        1.3.2 次级文库构建方法第36-39页
        1.3.3 总结第39-40页
    1.4 p16基因甲基化检测第40-44页
        1.4.1 p16基因概述第40页
        1.4.2 甲基化检测方法第40-44页
    1.5 乙型肝炎病毒检测第44-45页
        1.5.1 乙肝现状第44页
        1.5.2 乙型肝炎病毒检测方法第44-45页
    1.6 本课题的研究思路第45-49页
        1.6.1 研究目的第45-46页
        1.6.2 研究方法第46页
        1.6.3 试验设计第46-48页
        1.6.4 研究意义第48-49页
第二章 建立和优化乳液不对称PCR高效构建随机ssDNA文库第49-64页
    2.1 实验仪器和材料第50-53页
        2.1.1 实验仪器第50页
        2.1.2 实验材料第50-51页
        2.1.3 实验试剂第51-52页
        2.1.4 主要溶液配制第52-53页
    2.2 实验方法第53-57页
        2.2.1 引物和随机ssDNA文库第53页
        2.2.2 乳液的制作第53-54页
        2.2.3 乳液不对称PCR第54-55页
        2.2.4 常规不对称PCR第55页
        2.2.5 破乳液回收PCR产物第55-56页
        2.2.6 PCR产物纯化回收第56页
        2.2.7 磁珠纯化回收ssDNA第56页
        2.2.8 变性聚丙烯酰胺胶电泳第56-57页
    2.3 实验结果第57-61页
        2.3.1 乳液颗粒制备第57-59页
        2.3.2 乳液-不对称PCR与常规不对称PCR比较第59-60页
        2.3.3 乳液-不对称PCR优化第60-61页
    2.4 讨论第61-64页
第三章 乳液单引物PCR构建次级ssDNA文库方法的建立及优化第64-81页
    3.1 实验仪器和材料第64-67页
        3.1.1 实验仪器第64-65页
        3.1.2 实验材料第65页
        3.1.3 实验试剂第65-66页
        3.1.4 主要溶液配制第66-67页
    3.2 实验方法第67-73页
        3.2.1 引物和随机ssDNA文库第67-68页
        3.2.2 乳液的制作第68页
        3.2.3 乳液PCR第68-69页
        3.2.4 常规单引物PCR第69页
        3.2.5 乳液单引物PCR第69-70页
        3.2.6 破乳液回收PCR产物第70-71页
        3.2.7 PCR产物纯化回收第71页
        3.2.8 PCR产物分析第71-73页
    3.3 实验结果第73-78页
        3.3.1 乳液PCR扩增随机ssDNA文库第73页
        3.3.2 乳液单引物PCR与常规单引物PCR比较第73-74页
        3.3.3 乳液单引物PCR优化第74-78页
    3.4 讨论第78-81页
第四章 两步乳液PCR的建立及在结直肠癌患者p16基因甲基化检测中的初步应用第81-102页
    4.1 实验仪器和材料第82-86页
        4.1.1 实验仪器第82-83页
        4.1.2 实验材料第83页
        4.1.3 实验试剂第83-85页
        4.1.4 主要溶液配制第85-86页
    4.2 实验方法第86-96页
        4.2.1 标准人基因组DNA的CpG甲基转移酶修饰第86-87页
        4.2.2 血清中游离DNA纯化回收第87页
        4.2.3 DNA重亚硫酸盐转化及纯化回收第87-90页
        4.2.4 引物设计第90页
        4.2.5 甲基化特异性PCR (MSP)第90页
        4.2.6 琼脂糖电泳第90-91页
        4.2.7 目的条带胶回收纯化第91-92页
        4.2.8 质粒构建及鉴定第92-94页
        4.2.9 两步乳液PCR:第94-95页
        4.2.10 乳液PCR和甲基化特异性PCR比较第95页
        4.2.11 两步乳液PCR和甲基化特异性PCR检测P16基因甲基化抗干扰力比较第95页
        4.2.12 临床标本检测率的比较第95-96页
        4.2.13 统计学方法第96页
    4.3 结果第96-99页
        4.3.1 P16甲基化质粒的测序结果第96-97页
        4.3.2 灵敏度对比较第97-98页
        4.3.3 抗干扰力比较第98-99页
        4.3.4 临床标本检测率的比较第99页
    4.4 讨论第99-102页
第五章 两步乳液PCR检测乙型肝炎病毒核酸方法的建立及初步应用第102-113页
    5.1 实验仪器和材料第103-105页
        5.1.1 实验仪器第103-104页
        5.1.2 实验材料第104页
        5.1.3 实验试剂第104-105页
        5.1.4 主要溶液配制第105页
    5.2 实验方法第105-110页
        5.2.1 标本来源第105页
        5.2.2 核酸提取第105-106页
        5.2.3 荧光定量PCR第106页
        5.2.4 ELISA检测HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb和HBcAb第106-107页
        5.2.5 普通PCR第107-108页
        5.2.6 两步乳液PCR体系(图5.1)第108-109页
        5.2.7 琼脂糖电泳第109页
        5.2.8 灵敏度分析第109页
        5.2.9 统计学方法第109-110页
    5.3 结果第110-111页
        5.3.1 普通PCR扩增与两步乳液PCR扩增对比第110-111页
        5.3.2 统计分析第111页
    5.4 讨论第111-113页
第六章 结论与展望第113-115页
    6.1 结论第113页
    6.2 展望第113-115页
参考文献第115-130页
致谢第130-131页
攻读博士学位期间发表的文章第131页

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