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大豆疫霉中参与氧化压力应答和致病过程的转录因子PsHSF1和PsBZPc32的功能分析

摘要第9-12页
ABSTRACT第12-15页
引言第16-18页
上篇 文献综述第18-59页
    1 植物病原真菌和卵菌的致病过程第20-26页
        1.1 植物病原真菌和卵菌的生活史和病害循环第20-22页
        1.2 以稻瘟病菌为例的植物病原真菌侵染机制第22-24页
        1.3 以疫霉菌为例的植物病原卵菌侵染机制第24-26页
    2 参与致病过程转录因子的功能鉴定第26-34页
        2.1 利用生物信息学系统鉴定转录因子第26-29页
        2.2 利用转录分析寻找致病相关转录因子第29-30页
        2.3 建立突变体库寻找调控致病过程的转录因子第30-32页
        2.4 获得突变体鉴定转录因子如何参与致病过程第32-34页
    3 转录因子参与致病过程的调控机制研究第34-41页
        3.1 bZIP转录因子第35-37页
        3.2 HSF转录因子第37-38页
        3.3 锌指结构转录因子第38-40页
        3.4 其他类型转录因子第40-41页
    4 转录因子调控机制的研究方法第41-44页
        4.1 转录因子的翻译后水平调控第41-42页
        4.2 转录因子靶标基因的鉴定第42-44页
    参考文献第44-59页
下篇 研究内容第59-174页
    第一章 大豆疫霉热激转录因子HSF家族基因的鉴定及转录分析第60-80页
        1 材料与方法第62-65页
            1.1 数据库信息和同源检索第62-63页
            1.2 多重序列比对和系统发育分析第63页
            1.3 供试菌株和大豆品种第63页
            1.4 大豆培疫霉的培养第63-64页
            1.5 大豆疫霉无性生活史各阶段和侵染阶段的样品制备第64页
            1.6 大豆疫霉在氧化压力下样品的制备第64-65页
            1.7 RNA提取和cDNA合成第65页
            1.8 SYBR green Real-time RT-PCR分析第65页
        2 结果与分析第65-74页
            2.1 HSF候选基因的挖掘第65-66页
            2.2 疫霉菌HSFs系统发育分析第66-67页
            2.3 HSF候选编码基因在基因组中的结构特征第67-70页
            2.4 大豆疫霉HSF候选编码基因在生长发育及致病过程中的转录水平分析第70-71页
            2.5 大豆疫霉HSF候选编码基因在氧化压力下的转录水平分析第71-74页
        3 讨论第74-76页
        参考文献第76-80页
    第二章 PSHSF1参与调控大豆疫霉氧化压力应答和抑制植物防卫反应第80-112页
        1 材料与方法第83-89页
            1.1 供试菌株及卵菌表达载体第83页
            1.2 大豆疫霉菌株的培养及无性发育和侵染各阶段菌体的获得第83-84页
            1.3 氧胁迫处理条件下大豆疫霉菌丝的获得第84页
            1.4 RNA提取和SYBR-green Real-time RT-PCR分析第84页
            1.5 载体的构建第84-85页
            1.6 大豆疫霉遗传转化第85-87页
            1.7 大豆疫霉转化子筛选第87页
            1.8 致病性测定第87页
            1.9 侵染菌丝的定量第87-88页
            1.10 胼胝质和活性氧的细胞学观察第88页
            1.11 胞外氧化酶和漆酶的活性测定第88页
            1.12 酵母转化第88-89页
            1.13 酵母的氧化压力敏感性测定第89页
        2 结果与分析第89-102页
            2.1 大豆疫霉PsHSF1基因的克隆及同源性比较第89-91页
            2.2 PsHSF1在氧化压力诱导下迅速上调表达第91页
            2.3 PsHSF1可以互补酵母突变体菌株⊿SKN7对氧化压力的敏感性第91-93页
            2.4 PsHSF1的沉默导致大豆疫霉致病力显著下降第93-94页
            2.5 PsHSF1沉默转化子抑制寄主免疫反应的能力减弱第94-97页
            2.6 PsHSF1的沉默影响大豆疫霉胞外酶的活性第97-98页
            2.7 PsHSF1沉默转化子中胞外氧化酶和漆酶编码基因的转录水平下降第98-100页
            2.8 漆酶编码基因PsLAC4的瞬时沉默影响大豆疫霉的致病性和漆酶活性第100-102页
            2.9 LAC4和LAC5的启动子区有HSE类似元件分布第102页
        3 讨论第102-106页
            3.1 大豆疫霉PsHSF1可互补酵母SKN7突变体表型第103页
            3.2 大豆疫霉PsHSF1清除植物防卫反应积累ROS的机制第103-104页
            3.3 PsHSF1下游基因的预测第104-106页
        参考文献第106-112页
    第三章 转录因子PSBZPC32在大豆疫霉生长发育及致病过程中的功能研究第112-144页
        1 材料与方法第115-119页
            1.1 供试菌株的保存和活化第115页
            1.2 PsBZPc32同源序列的保守结构域预测和系统发育分析第115页
            1.3 大豆疫霉氧胁迫处理条件下、无性发育和侵染各阶段样品制备第115-116页
            1.4 RNA提取和SYBR green Real-time RT-PCR分析第116页
            1.5 载体的构建第116页
            1.6 大豆疫霉遗传转化和沉默转化子筛选第116-117页
            1.7 PsBZPc32沉默转化子的表型分析第117-118页
            1.8 致病性测定第118页
            1.9 DAB染色检测ROS第118页
            1.10 PsBZPc32细胞定位的显微观察第118页
            1.11 DAPI染色及荧光显微观察第118-119页
        2 结果与分析第119-135页
            2.1 大豆疫霉PsBZPc32基因的克隆及结构分析第119-121页
            2.2 PsBZPc32在氧化压力胁迫、无性生活史和侵染各阶段的转录水平分析第121页
            2.3 PsBZPc32可以定位在细胞核中第121-123页
            2.4 PsBZPc32基因沉默转化子的获得第123-125页
            2.5 PsBZPc32沉默转化子的休止孢萌发率下降且萌发形态异常第125页
            2.6 PsBZPc32的沉默不影响大豆疫霉对细胞壁胁迫因子敏感性第125-127页
            2.7 PsBZPc32沉默转化子对氧化压力更敏感第127-128页
            2.8 PsBZPc32的沉默对胞外氧化酶和漆酶的活性没有明显影响第128-130页
            2.9 PsBZPc32的沉默导致大豆疫霉致病力下降第130-131页
            2.10 PsBZPc32沉默转化子不能抑制寄主活性氧的积累第131-133页
            2.11 PsBZPc32的过表达对大豆疫霉致病力没有影响第133-135页
        3 讨论第135-138页
            3.1 PsBZPc32的功能域分析第135-136页
            3.2 PsBZPc32参与氧化压力的应答过程第136-137页
            3.3 PsBZPc32沉默对休止孢萌发和致病性的影响第137-138页
        参考文献第138-144页
    第四章 PSBZPC32调控氧化压力应答和致病过程的分子机制研究第144-174页
        1 材料与方法第148-153页
            1.1 细胞定位载体构建第148-149页
            1.2 大豆疫霉稳定转化第149-150页
            1.3 荧光转化子的定位观察和DAPI染色第150页
            1.4 磷酸化位点预测和分析第150页
            1.5 蛋白提取第150-151页
            1.6 SDS-PAGE胶制备及Western-blot第151-152页
            1.7 Phos-tag SDS-PAGE胶制备及Western-blot第152-153页
            1.8 PsBZPc32原核表达多克隆抗体制备第153页
            1.9 CO-IP第153页
            1.10 RNA提取和SYBR green Real-time RT-PCR分析第153页
        2 结果与分析第153-165页
            2.1 PsBZPc32的磷酸化位点预测与磷酸化组数据分析第153-156页
            2.2 PsBZPc32在氧化压力下的磷酸化状态发生变化第156-157页
            2.3 PsBZPc32的细胞定位在氧化压力下从细胞质向细胞核中转移第157-159页
            2.4 磷酸化位点S212和S236失活后PsBZPc32不能定位于细胞核第159-160页
            2.5 PAS功能域的缺失不影响PsBZPc32的亚细胞定位第160-161页
            2.6 PsBZPc32互作蛋白的分析第161页
            2.7 PsBZPc32的沉默影响侵染阶段Avh基因的转录第161-163页
            2.8 通过转录组分析寻找PsBZPc32调控的候选基因第163-165页
        3 讨论第165-169页
            3.1 PsBZPc32应答氧化压力的机制第166页
            3.2 PsBZPc32对下游基因的转录调控第166-169页
        参考文献第169-174页
附表1第174-176页
附表2第176-181页
附表3第181-184页
全文总结及创新点第184-186页
攻读博士学位期间发表的研究论文第186-188页
致谢第188页

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