山核桃油脂合成和基因表达变化分析
摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-10页 |
1 文献综述 | 第10-18页 |
·山核桃研究概况 | 第10-12页 |
·山核桃研究进展 | 第10页 |
·山核桃油脂积累及组分变化 | 第10-12页 |
·油脂合成过程及研究进展 | 第12-16页 |
·植物油脂合成起始阶段 | 第12-13页 |
·油脂从质体向内质网运动过程 | 第13-14页 |
·TAG的从头合成装配 | 第14-15页 |
·磷脂酰胆碱在油脂合成中的重要作用 | 第15-16页 |
·转录因子WRI1研究进展 | 第16页 |
·植物油脂合成组学研究进展 | 第16-17页 |
·本研究的目的及意义 | 第17页 |
·研究内容 | 第17-18页 |
2 材料和方法 | 第18-26页 |
·实验材料 | 第18-19页 |
·材料预处理 | 第19-20页 |
·重要生理生化指标测定 | 第20页 |
·粗脂肪测定 | 第20页 |
·脂肪酸组分测定 | 第20页 |
·气象数据记录 | 第20-21页 |
·转录组数据库构建及生物信息学分析 | 第21-26页 |
·转录组数据库样本选择 | 第21页 |
·RNA提取、纯化及RNA-seq | 第21-22页 |
·原始序列数据处理 | 第22-23页 |
·测序质量评估 | 第23页 |
·样本间基因表达差异分析 | 第23-24页 |
·nr数据库比对 | 第24页 |
·基因GO富集分析及KEGG代谢途径分析 | 第24-25页 |
·与不同物种的转录组数据比较 | 第25-26页 |
3 结果与分析 | 第26-47页 |
·山核桃油脂合成规律 | 第26-28页 |
·山核桃油脂积累过程 | 第26-27页 |
·山核桃脂肪酸组分变化规律 | 第27-28页 |
·RNA提取分析 | 第28-29页 |
·转录组测序与组装 | 第29-31页 |
·RNA-seq拼接情况 | 第29-30页 |
·测序质量数据评估 | 第30-31页 |
·转录组动态功能富集分析 | 第31-34页 |
·nr比对及KEGG代谢通路分析 | 第31-32页 |
·差异基因表达模式 | 第32-33页 |
·GO富集分析 | 第33-34页 |
·油脂代谢网络分析 | 第34-43页 |
·不同年份差异表达的油脂合成相关基因 | 第34-36页 |
·ACCase作为脂肪酸合成的限速酶 | 第36-37页 |
·DGAT2和PDAT在TAG装配中的重要作用 | 第37-39页 |
·SAD和FAD2决定高油酸含量 | 第39-41页 |
·糖酵解为油脂合成提供来源 | 第41-42页 |
·脂肪酸降解途径的限制保证高含油量 | 第42-43页 |
·环境变化引起的基因差异表达 | 第43-44页 |
·山核桃与橄榄果实转录组比较分析 | 第44-45页 |
·油脂代谢过程相关的潜在功能基因 | 第45-47页 |
4 结论 | 第47-50页 |
·油脂合成及组分变化规律 | 第47页 |
·山核桃成油分子调控机理 | 第47-48页 |
·山核桃果实应对环境变化的反应机制 | 第48页 |
·研究展望 | 第48-50页 |
参考文献 | 第50-56页 |
作者简介 | 第56-57页 |
致谢 | 第57页 |