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生菜紫色叶基因的遗传定位及MAGIC群体的前期构建

摘要第1-7页
Abstract第7-8页
缩略语表第8-9页
1 前言第9-19页
   ·生菜简介第9页
     ·生菜起源及营养价值第9页
     ·生菜分类第9页
   ·花青素概述第9-13页
     ·花青素的生物合成途径第10-11页
     ·花青素生物合成关键酶第11-12页
     ·影响花青素合成的转录因子第12-13页
   ·基因定位与克隆第13-18页
     ·图位克隆(Map-based cloning)第14页
     ·混合分组分析法(Bulked Segregant Analysis)第14-15页
     ·转座子标签法(Transposon tagging)第15页
     ·同源序列法(Homology-based cloning)第15-16页
     ·数量性状基因座定位分析法(Quantitative Trait Locus)第16页
     ·关联分析法(Association analysis)第16-18页
   ·研究目的与意义第18-19页
2 材料和方法第19-23页
   ·植物材料第19页
   ·F2代紫色分离群体的构建第19-20页
   ·F2代分离群体RNA-seq测序第20页
   ·RNA-seq数据差异表达基因的分析第20-21页
   ·等位基因在两个极端池中测序频率差异分析第21-22页
   ·250份生菜栽培种的类型划分及多亲本高级世代互交系(MultiparentAdvanced Generation Intercross,MAGIC)的前期构建第22-23页
3 结果与分析第23-32页
   ·F2代分离群体分析第23页
   ·紫色池和绿色池RNA-seq数据统计第23-24页
   ·紫色池和绿色池差异表达基因分析第24-25页
   ·花青素合成途径基因分析第25-26页
   ·紫色池和绿色池等位基因频率差异分析第26-29页
   ·PLL2基因的遗传定位第29-31页
   ·MAGIC群体的前期构建第31-32页
4 讨论第32-35页
   ·光对花青素的诱导第32页
   ·第二代测序与BSA法相结合的遗传分析第32-33页
   ·生菜叶色变异的遗传机理第33页
   ·生菜紫色叶形成的分子机理第33-35页
参考文献第35-41页
附录第41-55页
 附录1第41-43页
 附录2第43-54页
 附录3第54-55页
致谢第55页

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