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与水稻互作的枯草芽孢杆菌OKB105菌株蛋白质组学研究

目录第1-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
上篇 文献综述第12-33页
 第一章 植物根围促生细菌促生机理及其与植物的互作研究进展第13-25页
  1 植物根围促生细菌(PGPR)对植物的促生作用第13-14页
  2 植物根围促生细菌(PGPR)的促生机理第14-23页
   ·PGPR能够提高植物对养分的可利用性第14-18页
     ·嗜铁素的产生第14-17页
     ·PGPR的解磷作用第17-18页
     ·氮的利用第18页
   ·PGPR能够产生挥发性化合物来促进植物生长第18-19页
   ·植物激素第19-23页
     ·生长素第19-21页
     ·赤霉素第21-22页
     ·细胞分裂素第22-23页
     ·乙烯第23页
  3 植物根围促生细菌(PGPR)与植物的互作第23-25页
   ·竞争空间和营养物质第23页
   ·定殖第23-24页
   ·建立共生关系第24-25页
 第二章 双向电泳技术及生物信息学分析第25-33页
  1 双向电泳第25-29页
   ·双向电泳原理第25-26页
   ·双向电泳实验流程第26-28页
     ·样品制备第26页
     ·第一向等电聚焦(IEF)第26-27页
     ·胶条的平衡第27页
     ·第二向聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第27页
     ·凝胶的染色第27页
     ·成像和软件分析第27页
     ·蛋白鉴定第27-28页
   ·双向电泳技术在蛋白质组学中的应用第28-29页
  2 分子生物信息学分析第29-33页
   ·分子生物信息学的历史第29-30页
     ·分子生物信息学的产生第29-30页
     ·分子生物信息学的发展第30页
   ·分子生物信息学概念第30页
   ·分子生物信息学的主要研究内容第30-31页
   ·分子生物信息学信息处理流程第31-32页
   ·分子生物信息学的应用及研究意义第32-33页
     ·分子生物信息学的应用第32页
     ·分子生物信息学的研究意义第32-33页
下篇 研究内容第33-79页
 第一章 枯草芽孢杆菌OKB105菌株与水稻互作体系的建立第35-43页
  摘要第35-36页
  1 材料与方法第36-38页
   ·供试菌株及培养条件第36页
   ·供试植物材料第36页
   ·水稻培养方法第36-37页
     ·蛭石混土法培养水稻第36页
     ·植物组织培养基N6培养水稻第36-37页
     ·水培法培养水稻第37页
   ·水稻与枯草芽孢杆菌OKB105菌株互作体系第37-38页
   ·枯草芽孢杆菌OKB105菌株对水稻促生的表型实验第38页
   ·枯草芽孢杆菌OKB105菌株平板检测实验第38页
  2 结果与分析第38-41页
   ·水稻最优培养方法及互作体系的确立第38-39页
   ·OKB105菌株促进水稻的生长第39-40页
   ·与水稻互作的枯草芽孢杆菌OKB105菌株平板检测结果第40-41页
  3 讨论第41-42页
  ABSTRACT第42-43页
 第二章 OKB105菌株胞内全蛋白样品制备及双向电泳条件优化第43-65页
  摘要第43页
  1 材料与方法第43-57页
   ·菌株及培养条件第43页
   ·培养基第43-44页
   ·主要试剂第44页
   ·供试胶条第44页
   ·缓冲液第44-46页
   ·OKB105菌株胞内全蛋白的提取第46-47页
     ·超声波破碎法提取蛋白第46页
     ·液氮研磨法提取蛋白第46-47页
     ·溶菌酶结合超声波破碎法提取蛋白第47页
   ·SDS-PAGE凝胶电泳检测第47-49页
   ·OKB105菌株胞内全蛋白纯化第49-50页
   ·OKB105菌株胞内全蛋白定量第50页
   ·一向等电聚焦第50-52页
     ·胶条溶胀第50-51页
     ·等电聚焦第51-52页
     ·胶条的保存第52页
   ·二向SDS-PAGE第52-56页
     ·灌胶前的准备第52页
     ·灌胶第52-53页
     ·玻璃板、电泳槽的准备第53-54页
     ·胶条平衡第54-55页
     ·胶条转移第55页
     ·SDS-PAGE电泳第55-56页
   ·染色第56-57页
     ·考马斯亮蓝R250染色法第56页
     ·银染法第56-57页
   ·凝胶的保存第57页
  2 结果与分析第57-61页
   ·OKB105菌株胞内全蛋白的提取第57-58页
   ·OKB105菌株胞内全蛋白的纯化及浓度测定第58-59页
   ·蛋白上样浓度的优化第59-60页
   ·蛋白胶浓度的优化第60页
   ·等电聚焦程序的优化第60-61页
  3 讨论第61-63页
  ABSTRACT第63-65页
 第三章 与水稻互作的OKB105菌株胞内全蛋白差异表达蛋白点生物信息学分析第65-79页
  摘要第65页
  1 材料与方法第65-66页
   ·菌株及培养条件第65页
   ·培养基第65-66页
   ·主要试剂第66页
   ·供试胶条第66页
   ·缓冲液第66页
   ·水稻培养方法第66页
   ·枯草芽孢杆菌OKB105胞内全蛋白提取、纯化及定量方法第66页
   ·双向电泳实验条件第66页
   ·水稻与枯草芽孢杆菌OKB105互作第66页
   ·与水稻互作的OKB105菌株胞内全蛋白双向电泳图像分析第66页
   ·质谱分析第66页
  2 结果与分析第66-74页
   ·与水稻互作的OKB105菌株胞内全蛋白双向电泳第66-68页
   ·差异蛋白点比对第68-69页
   ·差异表达蛋白点分析第69-74页
  3 讨论第74-78页
   ·细菌群体感应系统相关蛋白第74-75页
   ·细菌蛋白质合成、分泌相关蛋白第75页
   ·细菌细胞分裂相关蛋白第75-76页
   ·细菌生长代谢相关蛋白第76-77页
   ·功能未知蛋白第77-78页
  ABSTRACT第78-79页
参考文献第79-91页
附录第91-93页
致谢第93-95页
攻读硕士期间发表的学术论文第95页

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