| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-45页 |
| ·研究背景 | 第17-43页 |
| ·幽门螺杆菌感染现状 | 第19-23页 |
| ·幽门螺杆菌cag致病岛 | 第23-27页 |
| ·幽门螺杆菌的致病因子 | 第27-38页 |
| ·幽门螺杆菌Ⅳ型分泌系统(type Ⅳ secretion system,T4SS) | 第38-42页 |
| ·Ⅳ型分泌系统伴侣蛋白(Type Ⅳ secretion system chaperone) | 第42-43页 |
| ·本研究的目的、内容及技术路线 | 第43-45页 |
| ·研究目的 | 第43页 |
| ·研究内容及方案 | 第43-44页 |
| ·技术路线 | 第44-45页 |
| 第二章 幽门螺杆菌cagM、cagI基因的克隆与测序 | 第45-59页 |
| 前言 | 第45页 |
| ·材料 | 第45-48页 |
| ·菌株和质粒 | 第45-46页 |
| ·主要试剂 | 第46页 |
| ·主要溶液配制 | 第46-47页 |
| ·主要仪器 | 第47-48页 |
| ·方法 | 第48-55页 |
| ·H.pylori培养与鉴定 | 第48页 |
| ·H.pylori基因组DNA的提取 | 第48-49页 |
| ·PCR引物的设计 | 第49页 |
| ·PCR扩增H.pylori的cagM、cagI基因 | 第49-50页 |
| ·目的DNA片段的回收 | 第50-51页 |
| ·制备感受态细胞 | 第51-52页 |
| ·载体和目的片段的连接 | 第52-53页 |
| ·转化与筛选 | 第53页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第53-54页 |
| ·H.pylori NCTC11637 cagM、cagI基因序列的检测 | 第54页 |
| ·H.pylori NCTC11637 cagM、cagI基因序列提交NCBI核酸数据库GenBank | 第54-55页 |
| ·结果 | 第55-57页 |
| ·H.pylori的分离培养与鉴定 | 第55页 |
| ·PCR法扩增H.pylori cagM、cagI基因片段 | 第55-56页 |
| ·T-A克隆与鉴定 | 第56-57页 |
| ·H.pylori NCTC11637菌株cagM、cagI基因的测序结果 | 第57页 |
| ·讨论 | 第57-59页 |
| 第三章 CagM、CagI蛋白的生物信息学分析 | 第59-85页 |
| 前言 | 第59-60页 |
| ·材料 | 第60页 |
| ·主要软件 | 第60页 |
| ·主要网站 | 第60页 |
| ·方法 | 第60-63页 |
| ·序列组成和基本性质分析 | 第60-61页 |
| ·同源性分析 | 第61页 |
| ·跨膜区预测分析 | 第61-62页 |
| ·信号肽和剪切位点预测分析 | 第62页 |
| ·二级结构预测分析 | 第62页 |
| ·三级结构预测分析 | 第62页 |
| ·功能位点分析 | 第62页 |
| ·卷曲螺旋的预测分析 | 第62-63页 |
| ·细胞定位的预测分析 | 第63页 |
| ·蛋白家族保守区域分析 | 第63页 |
| ·蛋白质指纹图谱分析 | 第63页 |
| ·结果 | 第63-79页 |
| ·序列组成和基本性质分析 | 第63-65页 |
| ·同源性分析 | 第65-69页 |
| ·跨膜区预测 | 第69-70页 |
| ·信号肽和剪切位点预测 | 第70-71页 |
| ·二级结构预测分析 | 第71-73页 |
| ·三级结构预测分析 | 第73-74页 |
| ·功能位点分析 | 第74-76页 |
| ·卷曲螺旋的预测分析 | 第76-77页 |
| ·细胞定位的预测分析 | 第77页 |
| ·蛋白家族保守区域分析 | 第77页 |
| ·蛋白指纹图谱分析 | 第77-79页 |
| ·讨论 | 第79-85页 |
| ·基本性质 | 第79-80页 |
| ·同源性 | 第80-82页 |
| ·结构预测 | 第82-83页 |
| ·功能分析 | 第83-85页 |
| 第四章 结论和展望 | 第85-87页 |
| ·结论 | 第85页 |
| ·展望 | 第85-87页 |
| 致谢 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-102页 |
| 读博期间发表的论文和参加的课题 | 第102页 |
