| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第11-15页 |
| 1 绪论 | 第15-25页 |
| ·研究背景 | 第15-25页 |
| ·转录组研究技术进展 | 第15-18页 |
| ·基于RNA-Seq方法研究基因表达调控 | 第18-21页 |
| ·基于RNA-Seq转录组重构转录本 | 第21-25页 |
| 2 肿瘤细胞基因表达调控模式研究 | 第25-57页 |
| ·研究背景 | 第25页 |
| ·材料和方法 | 第25-34页 |
| ·转录组数据收集 | 第25-29页 |
| ·基因组和注释信息数据 | 第29-30页 |
| ·分析方法 | 第30-34页 |
| ·结果 | 第34-50页 |
| ·RNA-Seq转录组数据分析模型 | 第34-35页 |
| ·界定HK基因 | 第35-41页 |
| ·共有HK基因的表达模式 | 第41-47页 |
| ·肿瘤特有的Cancer-associated HK基因的表达特征 | 第47-50页 |
| ·讨论 | 第50-55页 |
| ·基因表达模式与生理状态相关 | 第50-52页 |
| ·肿瘤细胞中基因表达的肿瘤特征 | 第52页 |
| ·肿瘤细胞中的表达调控 | 第52-55页 |
| ·结论 | 第55-57页 |
| 3 大熊猫基因组重注释 | 第57-81页 |
| ·研究背景 | 第57-58页 |
| ·材料和方法 | 第58-69页 |
| ·实验样品 | 第58页 |
| ·实验试剂、仪器与耗材 | 第58-59页 |
| ·实验方法 | 第59-64页 |
| ·数据收集 | 第64-65页 |
| ·分析方法 | 第65-69页 |
| ·结果 | 第69-77页 |
| ·转录组数据评估 | 第69-72页 |
| ·转录本重构 | 第72页 |
| ·完善基因组 | 第72-74页 |
| ·新转录本发现 | 第74-76页 |
| ·新基因验证 | 第76-77页 |
| ·讨论 | 第77-79页 |
| ·结论 | 第79-81页 |
| 4 结论 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-93页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第93页 |