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成年与老年大熊猫肠道菌群16S rDNA-RFLP技术分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
第一章 文献综述第11-23页
 1 大熊猫研究概况第11-12页
   ·大熊猫的生存现状第11页
   ·大熊猫的生活习性与消化特点第11-12页
   ·大熊猫年龄的划分情况第12页
 2 肠道微生物研究概况第12-14页
   ·肠道正常菌群的概念第12页
   ·肠道菌群的分类第12-13页
   ·肠道菌群的作用第13-14页
   ·肠道菌群失调的危害第14页
 3 大熊猫肠道微生物的研究进展第14-17页
   ·大熊猫肠道正常菌群的研究概况第14-15页
   ·大熊猫肠道致病菌的研究概况第15页
   ·大熊猫肠道菌群多样性的研究概况第15-17页
 4 肠道菌群多样性研究分析方法的进展第17-21页
   ·传统的研究方法第17页
   ·现代分子生物学技术的研究方法第17-21页
     ·16S rDNA-RFLP技术第18-20页
     ·16S rDNA-RFLP技术在分析肠道菌群多样性中的应用第20-21页
 5 本实验的目的意义第21-23页
第二章 成年与老年大熊猫肠道菌群16S rDNA-RFLP技术分析第23-49页
 1 实验材料和方法第23-29页
   ·实验材料第23-24页
     ·实验样品第23页
     ·实验仪器第23页
     ·实验主要试剂及配制方法第23-24页
   ·实验方法第24-29页
     ·成年与老年大熊猫粪便的采集第24-25页
     ·粪便样品的预处理第25页
     ·粪便细菌总DNA的提取与检测第25页
     ·粪便总细菌16S rDNA片段的PCR扩增第25页
     ·细菌16S rDNA扩增片段的纯化同收第25-26页
     ·16S rDNA克隆文库的构建第26-27页
       ·连接目的片段与T载体第26页
       ·转化第26页
       ·阳性克隆子的筛选第26-27页
       ·酶切筛选出来的阳性克隆子第27页
     ·RFLP聚类分析第27页
     ·文库统计及多样性指数分析第27-28页
       ·覆盖率(Coverage value,C)第27-28页
       ·香浓指数(Shannon Index, H')第28页
       ·Simpson优势度指数(D)第28页
       ·物种的丰富度指数(Margalef d_(Ma))第28页
       ·Chaol物种多样性指数(S)第28页
     ·测序及比较分析第28-29页
 2 实验结果与分析第29-43页
   ·成年与老年大熊猫粪便细菌总DNA的提取第29页
   ·粪便细菌16S rDNA片段的PCR扩增第29-31页
   ·总细菌16S rDNA扩增片段的纯化回收第31-32页
   ·16S rDNA克隆文库的构建第32-36页
     ·目的片段的连接与转化第32-33页
     ·阳性克隆子的筛选第33-34页
     ·对阳性克隆子的酶切结果第34-36页
   ·RFLP分型结果第36-39页
   ·对所构建文库的分析结果第39-40页
   ·菌群序列的测定及比对结果第40-43页
 3 讨论第43-49页
   ·16S rDNA-RFLP分析肠道菌群的优缺点第43-44页
   ·对所构建的两个16S rDNA克隆文库的讨论第44-45页
     ·样品处理方法的改进第44页
     ·对16S rDNA-RFLP数据的处理与分析的讨论第44-45页
   ·对大熊猫肠道菌群组成分析比较的讨论第45-49页
     ·关于本实验中成年与老年大熊猫肠道菌群组成的比较讨论第45-46页
     ·对亚成体、成年、老年大熊猫肠道菌群组成的分析讨论第46-49页
结论第49-51页
参考文献第51-57页
致谢第57-59页
附录第59-73页

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