摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-11页 |
第一章 文献综述 | 第11-23页 |
1 大熊猫研究概况 | 第11-12页 |
·大熊猫的生存现状 | 第11页 |
·大熊猫的生活习性与消化特点 | 第11-12页 |
·大熊猫年龄的划分情况 | 第12页 |
2 肠道微生物研究概况 | 第12-14页 |
·肠道正常菌群的概念 | 第12页 |
·肠道菌群的分类 | 第12-13页 |
·肠道菌群的作用 | 第13-14页 |
·肠道菌群失调的危害 | 第14页 |
3 大熊猫肠道微生物的研究进展 | 第14-17页 |
·大熊猫肠道正常菌群的研究概况 | 第14-15页 |
·大熊猫肠道致病菌的研究概况 | 第15页 |
·大熊猫肠道菌群多样性的研究概况 | 第15-17页 |
4 肠道菌群多样性研究分析方法的进展 | 第17-21页 |
·传统的研究方法 | 第17页 |
·现代分子生物学技术的研究方法 | 第17-21页 |
·16S rDNA-RFLP技术 | 第18-20页 |
·16S rDNA-RFLP技术在分析肠道菌群多样性中的应用 | 第20-21页 |
5 本实验的目的意义 | 第21-23页 |
第二章 成年与老年大熊猫肠道菌群16S rDNA-RFLP技术分析 | 第23-49页 |
1 实验材料和方法 | 第23-29页 |
·实验材料 | 第23-24页 |
·实验样品 | 第23页 |
·实验仪器 | 第23页 |
·实验主要试剂及配制方法 | 第23-24页 |
·实验方法 | 第24-29页 |
·成年与老年大熊猫粪便的采集 | 第24-25页 |
·粪便样品的预处理 | 第25页 |
·粪便细菌总DNA的提取与检测 | 第25页 |
·粪便总细菌16S rDNA片段的PCR扩增 | 第25页 |
·细菌16S rDNA扩增片段的纯化同收 | 第25-26页 |
·16S rDNA克隆文库的构建 | 第26-27页 |
·连接目的片段与T载体 | 第26页 |
·转化 | 第26页 |
·阳性克隆子的筛选 | 第26-27页 |
·酶切筛选出来的阳性克隆子 | 第27页 |
·RFLP聚类分析 | 第27页 |
·文库统计及多样性指数分析 | 第27-28页 |
·覆盖率(Coverage value,C) | 第27-28页 |
·香浓指数(Shannon Index, H') | 第28页 |
·Simpson优势度指数(D) | 第28页 |
·物种的丰富度指数(Margalef d_(Ma)) | 第28页 |
·Chaol物种多样性指数(S) | 第28页 |
·测序及比较分析 | 第28-29页 |
2 实验结果与分析 | 第29-43页 |
·成年与老年大熊猫粪便细菌总DNA的提取 | 第29页 |
·粪便细菌16S rDNA片段的PCR扩增 | 第29-31页 |
·总细菌16S rDNA扩增片段的纯化回收 | 第31-32页 |
·16S rDNA克隆文库的构建 | 第32-36页 |
·目的片段的连接与转化 | 第32-33页 |
·阳性克隆子的筛选 | 第33-34页 |
·对阳性克隆子的酶切结果 | 第34-36页 |
·RFLP分型结果 | 第36-39页 |
·对所构建文库的分析结果 | 第39-40页 |
·菌群序列的测定及比对结果 | 第40-43页 |
3 讨论 | 第43-49页 |
·16S rDNA-RFLP分析肠道菌群的优缺点 | 第43-44页 |
·对所构建的两个16S rDNA克隆文库的讨论 | 第44-45页 |
·样品处理方法的改进 | 第44页 |
·对16S rDNA-RFLP数据的处理与分析的讨论 | 第44-45页 |
·对大熊猫肠道菌群组成分析比较的讨论 | 第45-49页 |
·关于本实验中成年与老年大熊猫肠道菌群组成的比较讨论 | 第45-46页 |
·对亚成体、成年、老年大熊猫肠道菌群组成的分析讨论 | 第46-49页 |
结论 | 第49-51页 |
参考文献 | 第51-57页 |
致谢 | 第57-59页 |
附录 | 第59-73页 |