| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-17页 |
| ·课题背景 | 第11-14页 |
| ·课题内容 | 第14-15页 |
| ·研究意义 | 第15-16页 |
| ·本文的组织结构 | 第16-17页 |
| 第二章 无序蛋白质结构预测概述 | 第17-31页 |
| ·蛋白质结构概述及面向计算的表示 | 第17-20页 |
| ·蛋白质结构概述 | 第17-19页 |
| ·面向计算的蛋白质结构表示方法 | 第19-20页 |
| ·蛋白质结构从头预测方法 | 第20-23页 |
| ·Rosetta从头预测方法 | 第20-22页 |
| ·并行蚁群蛋白质骨架结构从头预测方法 | 第22-23页 |
| ·无序区域建模方法 | 第23-25页 |
| ·Rosetta建模方法 | 第23-24页 |
| ·分子动力学建模方法 | 第24-25页 |
| ·Rosetta能量函数 | 第25-27页 |
| ·搜索算法概述 | 第27-30页 |
| ·模拟退火算法 | 第27页 |
| ·蚁群算法 | 第27-28页 |
| ·和声算法 | 第28-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 基于并行和声算法的无序蛋白质骨架结构预测方法 | 第31-44页 |
| ·概述 | 第31页 |
| ·算法设计 | 第31-38页 |
| ·基本框架 | 第31-33页 |
| ·并行和声算法的设计方案 | 第33-34页 |
| ·和声算法的内部设计方案 | 第34-36页 |
| ·参数的自适应调节 | 第36-38页 |
| ·结果与分析 | 第38-43页 |
| ·实验环境及参数设置 | 第38页 |
| ·评价方法和标准 | 第38-39页 |
| ·测试用例 | 第39-40页 |
| ·结果与分析 | 第40-43页 |
| ·本章总结 | 第43-44页 |
| 第四章 基于距离特征的无序区域建模方法 | 第44-51页 |
| ·概述 | 第44页 |
| ·无序区域建模方法设计 | 第44-46页 |
| ·无序区域定位 | 第45-46页 |
| ·无序区域建模 | 第46页 |
| ·结果与分析 | 第46-49页 |
| ·无序区域定位的结果 | 第46-47页 |
| ·无序蛋白质结构预测结果 | 第47-49页 |
| ·本章小结 | 第49-51页 |
| 第五章 总结与展望 | 第51-54页 |
| ·作总结 | 第51-52页 |
| ·研究展望 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 发表文章目录及科研项目 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |